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大分子溶液比普通溶液粘度大，线形大分子又比球形大分子粘度大。DNA是线形大分子，人类DNA分子平均长度在4 cm以上，而双螺旋直径只有2 nm，长度直径比高达千万数量级。因此，DNA粘度极高，也极易在机械力作用下折断。双链DNA解链成为单链DNA时，由较伸展的双螺旋变成较紧凑的线团结构，粘度明显下降。RNA因为分子量小，且呈线团结构，所以其粘度低得多。 不同大分子的浮力密度也不同。DNA一般在1.7以上，RNA为1.6，蛋白质为1.35-1.40。分子量相同结构不同的DNA沉降系数不同，线形双螺旋DNA、线形单链DNA、超螺旋DNA沉降系数之比为1:1.14:1.4。所以可用利用密度梯度离心分离核酸。氯化铯溶解度高，可制成高密度溶液，所以最为常用。要求不高时，也可用蔗糖等。  密度梯度离心，引自百度图片 嘌呤和嘧啶因具有共轭体系而有强紫外吸收。核酸在260nm有紫外吸收峰，蛋白质在280nm。利用紫外吸收可测定核酸的浓度和纯度。一般测定OD260/OD280，纯DNA为1.8，RNA为2.0。如果含有蛋白质，比值会明显下降。纯的核酸可以根据紫外吸收计算浓度。 紫外吸收改变是DNA结构变化的标志，当双链DNA解链时碱基外露增加，紫外吸收明显增加，称为增色效应。双链、单链DNA与核苷酸的紫外吸收之比是1:1.37:1.6。 在一定条件下，双链DNA解链成为单链的现象称为变性或熔解。加热引起的变性称为热变性；碱性条件（pH>11.3）下，DNA会发生碱变性。此外，尿素、有机溶剂、甚至脱盐都可引起DNA变性。DNA变性后粘度降低，密度和吸光度升高。  DNA变性与复性，引自百度图片 通常将50%DNA分子变性时的温度称为熔点（Tm）。一般DNA在生理条件下的熔点在85-95度之间。熔点主要取决于碱基组成，G-C对含量越高，熔点越高。一般G-C对含量40%时熔点是87度，每增加1%，熔点增加约0.4度。缓冲液中的离子能与DNA结合，使其稳定，所以离子强度越低，熔点越低，熔解范围越窄。因此DNA应保存在高盐溶液中。如果DNA不纯，则变性温度范围也会扩大。甲酰胺可以使碱基对之间的氢键不稳定，降低熔点。所以分子生物实验中经常用甲酰胺使DNA变性，以避免高温引起DNA断裂。乙醇、丙酮、尿素等也可促进DNA变性。 除去变性因素后，互补的单链DNA又可以重新结合为双链DNA，称为复性或退火。DNA复性由局部序列配对形成双链核心的慢速成核反应开始，然后经过快速的所谓拉链反应而完成。 DNA的复性速度与其初始浓度C0及复杂度有关。当温度、离子强度等其他条件固定时，一半DNA复性时的C0t值仅与其复杂度有关，可用来计算基因组的复杂度。 变性后的单链DNA与具有互补序列的其它DNA或RNA分子结合形成双链的DNA-DNA或DNA-RNA杂合分子的过程称为分子杂交。实验室中常用的Southern Blot（DNA杂交）、Northern Blot（RNA杂交）等技术都是以此为基础的。分子杂交技术的发展和应用，对分子生物学和基因工程技术的发展起到了重要的推动作用。  Northern Blot原理，引自百度图片 |
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