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RNA与DNA的“细菌死活”之争

 Cheximing 2020-06-30

在检验圈子里流行这样一种说法“RNA可以用来区分死菌和活菌”。至于这种说法对还是不对,大家是分为两派的,多数派认为RNA容易降解,如果能检测到RNA说明这个菌是活的,另一方面RNA也指mRNA,而mRNA是蛋白质表达的载体,能检测到mRNA说明这个细菌正在进行复制表达。

少数派是这么认为的,RNA容易降解,容易造成假阴性,这种结果是否能真的拿来判断死菌还是活菌尚且存疑,另一方面有些mRNA低表达,不一定能被检测到也是被大家所顾忌的原因之一。

为什么大家比较纠结“死菌”还是“活菌”呢?因为这个结果看起来更具临床价值,也能将临床微生物领域的定植和感染进行区分。至于是不是这样呢?仁者见仁智者见智吧。

今天给大家分享一组前瞻性队列研究的结果:

荷兰阿姆斯特丹公共卫生局的研究者们在《BMC Infectious Diseases》杂志上发表了一项前瞻性队列研究成果:《Time to clearance of Chlamydia trachomatis RNA and DNA after treatment in patients coinfected with Neisseria gonorrhoeae – a prospective cohort study》。

研究方式:他们连续检测入组患者28天的样本(肛门,阴道或尿液样本,患者每天自取样),每个样本同时用RNA和DNA两种核酸方法进行检测。

研究结果:所有患者在随访期间均清除了沙眼衣原体,未观察到再感染。RNA的平均清除时间为7天,DNA的平均清除时间为6天。95%的患者在第13天清除了RNA,在第14天清除了DNA。在完全清除沙眼衣原体感染之后,RNA或者DNA检测均有点阳性结果出现。

该研究表明:“RNA与DNA”都不可以分辨活死菌,无论是DNA检测方法还是RNA检测方法,都只能提供有关病原体遗传物质是否存在的信息,而不能提供有关病原体是否存活或是否仍具有传染性的信息。详细研究信息如下:

背景:进行判愈实验(TOC)可以证明沙眼衣原体感染的抗微生物治疗成功或失败,但使用核酸扩增测试(NAAT)进行TOC时机的建议却不一致。我们使用最新的基于RNA和DNA的核酸检测手段评估了治疗后沙眼衣原体清除的时间。

方法:我们分析了2014年3月至2014年10月到荷兰阿姆斯特丹性病诊所就诊的沙眼衣原体和淋病奈瑟氏球菌共感染患者的数据。用头孢曲松加阿奇霉素或强力霉素治疗后,患者在连续28天中自行收集了肛门,阴道或尿液样本。使用基于RNA的核酸检测试剂和基于DNA的核酸检测试剂来分析样品。我们将清除率定义为三个连续的阴性结果,将清除后的点阳性结果定义为“斑点”。

结果: 从2014年3月至2014年10月在我们诊所诊断出的462名肛门生殖器淋病患者中,有77名被纳入原始队列。二十六名患者(34%)合并了沙眼衣原体感染,其中三名失访。最终,23例患者被纳入当前分析,我们纳入了23例沙眼衣原体和淋病奈瑟菌合并感染的患者。所有患者在随访期间均清除了沙眼衣原体,我们未观察到再感染。RNA的平均清除时间为7天(1-13),DNA的平均清除时间为6天。95%的患者在第13天清除了RNA,在第14天清除了DNA。清除后出现点阳性的风险为4.4%(RNA)和1.7%(DNA) 

图:清除沙眼衣原体的时间 【RNA(a)、DNA(b)】

图:治疗之后的沙眼衣原体患者每天的检测结果 【RNA(a)、DNA(b)、黑色方块:沙眼衣原体阳性、白色方块:沙眼衣原体阴性、c:间隙;×:样品丢失;s:当天性接触(采样后)

结论:如果需要对沙眼衣原体等进行判愈实验,建议使用核酸检测方法。然后,至少在治疗开始14天后再进行。14天之后的阳性结果可能仅仅只是遗传物质的阳性,而不是治疗失败或重新感染。

讨论:此前有几项关于沙眼衣原体治疗后体内清除率的研究报道,但采用不同的分子检测方法,每周采样频率不超过两次。一些研究在3周内观察到DNA的清除,而其他研究报告了在3-4周后大致有5-25%的DNA持续存在。治疗之后RNA清除的确切时间之前的一些研究也是不知道的(指的是用核酸检测)。

Sena等报告称,男性在治疗4周后的RNA阳性率为12%,而Dukers等报告在51天内有42%的间歇性阳性结果。此外,最近的一项研究报告称,180名患者在6个月后24%呈阳性,但没有再感染的数据。

由于这些先前的研究均未报告连续几天的结果,因此无法确定确切的清除时间,也无法将长时间的持续性阳性与点阳性区分开来。此外,没有一个研究报告了可能导致再感染的事件的数据,即没有像本研究那样报告可能引起再感染的事件的数据。虽然之前没有研究过沙眼衣原体在合并淋球菌感染的患者中的清除情况,但我们的结果证实了以下假设:沙眼衣原体RNA和DNA大致在2周后都能清除。

另一方面,进行判愈实验时,灵敏度较高的检测试剂可能会导致更多的点阳性结果,需要更多大样本的研究去阐明其含义。然而,核酸检测(无论DNA或RNA)都只能提供有关遗传物质是否存在的信息,而不能提供有关病原体是否存活或是否仍具有传染性的信息。


原文出处:Luca Boeri,Filippo Pederzoli ,et al. Semen infections in men with primary infertility in the real-life setting. Fertility and Sterility 2020 Apr13.
参考来源:世硕新语

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