百度检索JASPAR 第一个就是我们需要的网站 随后,转战NCBI,找到相关子数据库找到人的EGFR 的启动子序列(fasta格式) NC_000007.14(55019017..55211628) 55260294 上游2000-下游100 55260094 55262193 再转战UCSC,确定能够结合在启动子区域内的候选转录因子(UCSC) EGFR正向转录,选择→,候选基因:EWSR1-FLI1SP2 最后,才是我们的主角:确定候选转录因子的结合位点(JASPAR) 最终确定选择SP2作为转录因子 整体思路就是三个数据库的轮转,但是具体实操还需要大家自行摸索。 如果有疑问,欢迎下方留言,我们一起交流讨论。 科研路上,不是所有问题,都可可以手把手教会。更多时候,都是给你一个思路,剩下的靠你自己去施行。 加油。
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