发文章
发文工具
撰写
网文摘手
文档
视频
思维导图
随笔
相册
原创同步助手
其他工具
图片转文字
文件清理
AI助手
留言交流
Step1:打开UCSC数据库
http://www.genome./
Step2:进入搜索页面:EZH2
Step3:点击EZH2基因
Step4:找到启动子位置和序列:
Step5:接下来调用JASPARS数据源
Step6:点击Connect,进行关联
分值越高,p值越小,越严格。即颜色越黑。
找到感兴趣转录因子后,进入JASPARS数据库,查找转录因子和基因的结合位置。
复制基因启动子序列信息。
以上就是预测转录因子并查找结合位点!
来自: imtravelinghah > 《待分类》
0条评论
发表
请遵守用户 评论公约
如何用UCSC和ENCODE研究表观遗传学?
如何用UCSC和ENCODE研究表观遗传学?如何用UCSC和ENCODE.研究表观遗传学。表观遗传学,近几年高速发展,一个又一个重大发现简直是亮瞎了...
包教包会,表观必备技能UCSC查找心仪基因转录因子
来UCSC找调控靶基因的转录因子,给您不一样的体验~
来,再教你搜个启动子吧……
“ENC Regulation”调控的数据库包括转录本和组蛋白甲基化、DNA酶超敏反应和转录因子结合位置的信息,全选成“full”就好了,然后选“sh...
转录因子与靶基因预测操作-正义链
转录因子与靶基因预测操作-正义链一文学会JASPAR数据库使用方法。1)根据转录因子对转录调控的特性分为通用型转录因子和特异型转录因子...
资源|基础研究数据库
基因表达信息基因表达是将来自基因的信息用于功能性基因产物合成的过程。miRNA分析和预测miRNA(又称为microRNA)是在动植物和一些病毒...
【干货】ChIP 引物设计葵花宝典3.0
如何使用GEO数据库ChIP-Seq数据和UCSC genome browser数据库设计ChIP引物?高通量测序数据提交到GEO数据库之后会分配一个GSE编号,在撰...
利用多网站预测转录因子结合位点
利用多网站预测转录因子结合位点。百度检索JASPAR.随后,转战NCBI,找到相关子数据库找到人的EGFR 的启动子序列(fasta格式)再转战UCSC...
再给你换种方法搜启动子
片头结束,今天要为大家介绍的是一个能准确找出启动子以及转录因子结合位点的数据库SwissRegulon Portal(http://swissregulon.unibas.c...
一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点
一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结...
微信扫码,在手机上查看选中内容