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先天免疫系列推文二:炎症应答中的关键转录因子(NF

 漠藩 2020-07-28

引言

炎症是机体应对外来病原微生物和自身损伤的一种正常生理反应,炎症处于先天免疫和获得性免疫之间,能够帮助机体进一步清除病原微生物,并刺激获得性免疫的启动。炎症应答过程起始于细胞的模式识别受体PRRs识别外来病原微生物模式分子PAMP和自身损伤模式分子DAMP,然后通过启动一系列的信号传导和联级反应,激活相关的转录因子,最后调控大量的基因表达,从而引发炎症。在这里,我们就为大家盘点一下在炎症应答过程中,最重要的三个转录因子:NF-κB,IRFs,STATs。

1、NF-κB

NF-κB是一个高度保守的多功能转录因子家族,包含五个成员,分别为p65(RelA)、RelB、c-Rel、NF-κB1和NF-κB2,它们会组成不同的同源或异源二聚体而发挥基因转录调节作用,进而调节许多重要的细胞行为,特别是炎症反应[1]。与其他家族成员不同的是,NF-κB1和NF-κB2被合成为前体(p105和p100),并分别可以被加工成p50和p52[2]。

在大多数静止细胞中,这些二聚体的转录调节活性受到NF-κB抑制分子(IκB)的限制,或在加工为成熟形式前受其自身内部抑制基序的限制(比如p105或p100)。当细胞受到各种刺激,含有IKKα、IKKβ和IKKγ(NF-κB必需调节物,也称为NEMO)的IκB激酶复合物可以被多种上游信号通路(包括多种PRR下游通路、TNF信号通路等)激活,并介导IκB的磷酸化和蛋白酶体降解。然后NF-κB同源或异源二聚体可以转移到细胞核并激活靶基因转录[2]。NF-κB激活的另一种途径,也被称为替代途径,在包括BAFFR、CD40、RANK或LTβR的下游存在时,导致NF-κB诱导激酶(NIK)活化并激活IKKα[3]。IKKα能磷酸化p100并导致p100的多泛素化及其随后经蛋白酶体被加工为p52。然后,p52-RelB二聚体可以激活靶基因的转录。除了上述两种激活途径,NF-κB还可以在特定情况下被其他信号通路或激酶激活,称为非典型激活途径 [4]。

《先天免疫系列推文二:炎症应答中的关键转录因子(NF-κB,IRFs,STATs)》

图1:细胞内NF-κB的信号传导通路

NF-κB转录调控系统的复杂性也体现在如下几个方面:1)不同的NF-κB二聚体对DNA结合序列的变化有不同的偏好。因此,不同的靶基因由不同的NF-κB二聚体被不同程度上激活[5]; 2)NF-κB家族成员和调节因子还含有磷酸化和其他翻译后修饰的位点,这些位点对NF-κB的调节和与其他信号通路的串话很重要[4,6];3)在不同的细胞环境下,NF-κB信号通路与其他信号通路之间或NF-κB与其他转录因子之间的串话,增加了NF-κB调控和功能的复杂性 [2, 7-13]。

激活的NF-κB会诱导产生大量的促炎细胞因子而诱导炎症的发生。这些细胞因子分两类,一类是促进先天免疫免疫的细胞因子,如Ⅰ型干扰素(IFNβ),IL-12和巨噬细胞趋化因子等;另一类是促进获得性免疫的细胞因子,如IL-1,IL-2,IL-6,IL-8,IL-12,IL-18和Ⅱ型干扰素(IFNγ)等。

2、IRFs

IRFs中文全称是干扰素调节因子,有9个成员,分别是IRF1-9。IRFs最初被鉴定到的功能是能够激活Ⅰ型干扰素基因表达,其中IRF1、IRF3、IRF5、IRF7和IRF9都具有这一功能 [14],且IRF3和IRF7的作用最为明显。Ⅰ型干扰素具有强大的抗病毒功能,能通过激活JAK-STATs通路而诱导表达大量的抗病毒相关蛋白,从而抑制病毒在体内的复制。在机体受到了病毒等病原微生物感染时,PRRs所介导的信号通路除了能够激活NF-κB之外,还能磷酸化并激活IRF3、IRF5和IRF7,从而使他们进核诱导Ⅰ型干扰素以及其它促炎细胞因子的表达。

除了在已经分化的免疫细胞中发挥功能外,一些IRFs(IRF1、IRF2、IRF4和IRF8)还在未分化的免疫细胞中具有关键作用,如DC细胞、NK细胞、髓性细胞、B细胞和T细胞。这些IRFs在激活后,能促进相关的免疫细胞成熟和分化,从而激活获得性免疫反应 [15]。

与其它IRFs不同,IRF9最主要的功能是和磷酸化的STAT1和STAT2形成蛋白复合物ISGF3,参与JAK-STATs通路,参与Ⅰ型干扰素信号传导 [16]。

IRFs的功能

IRFs功能
IRF3,IRF5,IRF7诱导产生Ⅰ型干扰素和趋化因子
IRF1,IRF2,IRF4,IRF8参与免疫细胞的分化和发育
IRF9与STAT1和STAT2形成ISGF3蛋白复合体,促进Ⅰ型IFN诱导基因的表达

3、STATs

STATs中文名全称是信号传导及转录激活蛋白,由7个成员组成,分别是STAT1-4,STAT5a和STATs5b和STAT 6,这些成员都主要在细胞因子的应答过程中扮演关键角色。当细胞因子与其对应的膜受体结合后,会引起与这些受体相连的JAKs(janus kinase)磷酸化。JAKs的磷酸化又会引起STATs的磷酸化和二聚化,即STATs的活化。STATs活化后会暴露出核定位信号,从而进核并参与基因表达调控[17]。

不同的细胞因子激活不同的STATs蛋白入核,并发挥其特异的功能。Ⅰ型(如IFNα和IFNβ)和Ⅲ型干扰素(如IFN-λ)能激活STAT1和STAT2,激活后的STAT1、STAT2与IRF9组成蛋白复合物ISGF3,ISGF3蛋白复合物结合在含有ISRE元件(interferon-stimulated response element)的启动子上,并激活相关基因表达。ISRE是干扰素刺激基因ISGs(interferon-stimulated genes)的标志,ISGs主要包括一些能够抑制病毒复制的酶类。另外,Ⅱ型干扰素(IFN-γ)主要激活STAT1,激活后的STAT1形成二聚体,激活含有GAS(gamma interferon-activated sequence)元件的基因表达。Ⅱ型干扰素的抗病毒作用较弱,但是具有较强的免疫调节功能,能够刺激免疫细胞的成熟和分化,从而激活获得性免疫反应[18]。

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图2:IRFs和STATs在细胞应对病毒感染时的信号通路

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>>>> 参考文献

1.Oeckinghaus, A., & Ghosh, S. (2009). The NF-?B Family of Transcription Factors and Its Regulation. Cold Spring Harb Perspect Biol, 1(4), a000034-a000034.
2.Hoesel, B., & Schmid, J. A. (2013). Hoesel B, Schmid JA.The complexity of NF-??B signaling in inflammation and cancer. Mol Cancer 12:86. Mol Cancer, 12(1), 86.
3.Sun, S.-C. (2017). The non-canonical NF-κB pathway in immunity and inflammation. Nature Reviews Immunology, 17(9), 545-558.
4.Christian, F., Smith, E. L., & Carmody, R. J. (2016). The Regulation of NF-kappaB Subunits by Phosphorylation. Cells, 5(1). doi:10.3390/cells5010012
5.Mulero, M. C., Wang, V. Y., Huxford, T., & Ghosh, G. (2019). Genome reading by the NF-κB transcription factors. Nucleic Acids Res, 47(19), 9967-9989. doi:10.1093/nar/gkz739
6.Huang, B., Yang, X. D., Lamb, A., & Chen, L. F. (2010). Posttranslational modifications of NF-kappaB: another layer of regulation for NF-kappaB signaling pathway. Cellular Signalling, 22(9), 1282-1290.
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18.Stark GR, Darnell JE. The JAK-STAT pathway at twenty. Immunity (2012)36:503–14. doi: 10.1016/j.immuni.2012.03.013

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