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看点啥|这项研究进一步强调了循环肿瘤DNA在检测DIPG驱动突变方面的作用

 启帆医学BioSCI 2020-08-01
✎ 小助理说  

文献二三事,今天看点啥?

这里有我精心选择的好文章,

忙碌总有空闲,每天看个一两篇文献,paper也能发一篇。

论文:一项治疗儿童弥漫性固有桥脑胶质瘤的试点精确医学试验-PNOC003:太平洋儿科神经肿瘤学联合会的报告


摘要: 
这项临床试验评估了配对的正常组织和肿瘤组织的完整外显子组测序(WES)和RNA测序(RNAseq)是否可以纳入新诊断的弥漫性固有桥脑胶质瘤(DIPG)患者(<25岁)的个性化治疗计划。

此外,还将全基因组测序(WGS)与WES进行了比较,以确定WGS是否会进一步为治疗决策提供信息,以及循环肿瘤DNA(CtDNA)是否可以检测到H3K27M突变以评估治疗反应。患者是在2014年9月至2016年1月期间从三个太平洋儿科神经肿瘤学联盟成员机构中挑选出来的。WES和RNAseq在诊断和复发时尽可能在CLIA认证的实验室进行。每个受试者都尝试建立患者来源的细胞系。

在治疗前和每次核磁共振检查中采集血液中的ctDNA。一个专门的肿瘤委员会根据检测到的基因组改变生成了一份治疗建议,其中包括最多四种FDA批准的药物。所有15名受试者在组织收集后21个工作日内成功发布了治疗计划,15名受试者中有14名符合可行性标准。WGS结果没有明显偏离基于WES的治疗建议。

然而,WGS数据提供了对肿瘤进化和患者来源细胞模型保真度的进一步洞察。用ctDNA检测H3F3A或HIST1H3BK27M(H3K27M)突变的成功率为92%。DIPG的个性化治疗建议可以在临床相关的时间范围内使用全面的下一代测序技术在多中心设置内提供

关键词:循环肿瘤DNA;弥漫性固有桥脑胶质瘤;基因组学指导的临床试验;下一代测序;精确医学。

部分图展示:Figure1~3


作者最后在讨论部分提到,目前的可行性队列没有证明我们的精确医学方法的生存益处;然而,这必须在样本量非常小的情况下考虑。

该试验的可行性队列不是为了确认疗效或判断这种方法对总体生存的影响而设计的。相反,扩大队列的目标将是更好地阐明这种方法对存活率和DIPG患者总体临床结果的影响最终目标是更好地发现接受推荐治疗的患者与不接受推荐治疗的患者的结局差异。


最后再补充几句:

虽然被诊断为弥漫性固有桥脑胶质瘤(DIPG)的儿童继续遭受惨淡的生存结果,但下一代测序技术的进步已经提高了个性化治疗干预的可能性。

作者这项前瞻性研究证明了在诊断时对DIPG患者进行活检的可行性,应用下一代测序中的方法在临床相关的时间框架内确定个性化的治疗计划。对来自患者样本的细胞系的分析发现了DIPG典型的关键基因组变化,包括ACVR1、H3F3A/HIST1H3B、PIK3R1、PPM1D和TP53的突变。

这项研究进一步强调了循环肿瘤DNA在检测DIPG驱动突变方面的作用

-END

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