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DNA家族火了,这不“记者招待会”都开起来了...

 解螺旋 2020-08-27


作者:子非鱼

转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台

最近,DNA家族里那叫一个热闹非凡,有关DNA复制的爆料可谓是牢牢地霸占着科研头条,一个个惊艳事实轮番亮相,简直是你方唱罢我登场,朋友圈都被它们给刷屏了。因而,一时间登门拜访的记者们络绎不绝,都想弄清楚DNA复制的背后真相。这不,DNA家族记者专访会刚召开,力图挖掘第一手资料的各位记者们便已经蜂拥而至。

DNA家族:首先感谢大家能在百忙之中莅临现场,大家都知道DNA复制支撑生命本身,其多样性对遗传、疾病风险和人类进化产生着重要影响。但受限于科学技术的发展,DNA复制也只是被揭露了冰山一角。

其实,和人类一样,我们基因也有家族。而DNA复制则穿越时间的纽带将我们与始祖联系在一起,对祖先的不断复制和扩散,每经过一个循环我们都会有些许改变。随后,原来的版本继续忠实地执行使命,新的版本则获得了演化出新功能的自由。

虽然这背后的机理还笼罩在迷雾之中,但是孜孜不倦的科研者们已然是八仙过海、各显神通,在近期这段时间里将这团遮掩庐山真面目的浓雾吹散了不少。而我们家族作为科研者的神助攻,自然要帮助大家捋一捋其中的千头万绪,加深大家对我们的了解,这也是我们召开记者专访会的主要目的,现在大家可以开始自由提问了。

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记者1:你好,我是来自科研八卦日报的记者,素闻你们家族酷爱棒打鸳鸯,所谓DNA复制就是你们手里的“大棒”,所以我的问题就是能简单描述一下这大棒是如何炼成的么?


DNA家族:咳,这个问题么......嘛,这个也是我们家族里的内部矛盾。都说家丑不易外传,这咋就泄露出去了?!肯定是DNA这个话唠说出去的,不过,关于这个事情,DNA才是真正的当事人,就由它来回答你的这个问题吧。

DNA:好的,那我就好好絮叨絮叨一番。嗯,事情是酱紫的:话说,细胞一分裂,我就要连轴转,这话一点都不假。彼时,胞内各类分子及细胞器,无一不在为着细胞分裂大事而努力奋斗,可我这家里的A链与B链还在那儿你侬我侬、儿女情长,真是让人恨铁不成钢。

我曾对他俩动之以情,晓之以理,可他俩终归是无动于衷。没办法,为了细胞的长久之计,我只能联合复制起始点(ori)果断解开双链,并让RNA聚合酶快速依样画葫芦,合成RNA分子暂时稳定A、B两链的情绪,避免它们因碱基配对的分子作用力再次重逢。其实,我所做的一切那都是为了大局着想,绝对不是因为看不惯别人秀恩爱的!有视频为证!

记者1:怎么有种此地无银三百两的感觉?这么说,你的所作所为出发点都是好的喽!

DNA:嗯嗯,一看你就是个明白人!随后引发体(prisome,含有引物酶)也会强势介入两条单链之中,并合成RNA引物序列让A、B链彻底分开并形成Y字形复制叉。此时,DNA聚合酶III也趁机而入,依附着引物3'-OH端并向前延伸为新链增加碱基,形成新的DNA分子。

记者1:原来引物酶和DNA聚合酶也跑来横插一脚,真是看热闹不嫌事大。不过,我不明白的是,DNA复制作为你家族的头等大事,又怎会让RNA家族里的引物序列来担当领路人的呢?

DNA:这个嘛......唉,也是因为自己兄弟太不给力,复制起始处的几个核苷酸极易出差错,无形中会提高我自身的突变频率,进而埋下健康隐患。因而,只能让RNA引物打前锋,这样即便出现差错,也会被DNA聚合酶I所切除,来保证DNA复制的准确性嘛!话说,PCR那个臭小子的DNA复制技能就是从我这偷师的吧......

记者1(眼睛瞬间一亮):学术界中一向有你们与PCR结怨的传言,难道竟是事实么?这么说,你与PCR之间确实是有些牵扯的,是吧?!那能不能谈谈你与PCR.....

DNA家族:咳,关于DNA的个人八卦绯闻就到此为止吧,我们这可是一个严肃的场所,请大家不要随意歪楼、跑题。嗯,好了,下个要提问记者是谁?

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记者2:你好,我是来自科研学术角的记者。刚刚从你们播放的视频来看,可见DNA聚合酶在两条链上的工作方式并不同,在前导链(leading strand)是连续移动,即连续合成可直接产生一条新的双链DNA。而另一条后随链(lagging strand)的合成是不连续的,先形成冈崎片段(比较短的DNA链),最后由连接酶连成完整的一条链。

传统的观点一致认为,前导链和后随链上的聚合酶在某种程度上是相互协调的,复制速度基本保持一致,从而保证其中一条链上的聚合酶不会领先于另一个。对此,你们是怎么看的呢?

DNA聚合酶:既然这个问题是针对我的工作效率,那么我是最有发言权的,就由我来解答吧。

从单个DNA分子的角度来说,DNA复制确实富有随机性,且每股DNA单链上的复制速度也并不一致,会发生暂停或变速(速度前后相差10倍)。且先导链和后随链之间并没有互相协调,它们完全是自主的;有时,后随链合成停止了,但先导链仍然继续合成。

而这两条链之所以看似合成步调一致,实际上是它们在复制过程中启动、停止、速度变化这些随机过程共同导致的结果。就好比高速公路的交通状况一样,某个时间段上,车速有快有慢,但当行驶路程足够远时,两台车最后会同时到达终点。

记者2:关于你的比喻,是不是可以理解为两条链在复制过程中随着时间的推移,任何一条链都会以一个平均速度进行复制?

DNA聚合酶:是的,而且如果你同时观察很多条DNA链,就会发现它们会以相同的平均速度进行合成。

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记者3:据了解,你们家族还为解旋酶安装了“自动刹车”系统,这又是怎么回事呢?

DNA聚合酶(笑):解旋酶这个“劳模”,在DNA复制这个工作中可谓是不辞辛苦,始终坚守在第一岗位上。有时即便我休息了,它还在保持移动,并尽可能地使松散DNA展开一个缺口,并被修复酶发出警报信号,以使单链DNA免受伤害。

当然,它并不是只顾着一味向前冲,也比较会顾全大局,一旦它发现与复制复合体这个大部队失去耦合并开始远离时,它就会自动将移动速冻减慢5倍,让我们这些慢吞吞的家伙慢慢赶上,然后再次加速。

记者3:确实这些新发现与现有的教科书上的一些内容很不一样,可以称得上是颠覆传统理论。当然,我记得这并不是DNA家族第一次改写教科书了,记得在2015年,有关DNA复制的另一个惊天爆料,也宣称是要改写教科书,不知道你们能详细谈一谈么?

DNA家族:看来这位记者对我们家族还是一直保持关注的嘛,对于这点我们倍感欣慰。嗯,一直以来,经典的细胞分裂理论告诉我们,一个完整的细胞分裂周期分为:复制前期(G1)、DNA复制期(S)、复制后期(G2)和有丝分裂期(M)。而学术界也普遍认为DNA复制只能发生在细胞周期的S期。

但肿瘤细胞偏偏不走寻常路,不仅会在S期快速进行DNA复制,且在有丝分裂阶段,即M期“加班”复制DNA。

记者3:这也太让人诧异了!这肿瘤“加班”复制DNA可是有什么目的么?

DNA家族:常言道,慢工出细活。谁让肿瘤君在S期乱搞“大跃进”运动,本来复制DNA这活扎扎实实干完需要8小时,谁料肿瘤细胞硬是压缩在6小时内完成了DNA的快速复制。这样“偷工减料”势必会遗留了很多DNA损伤,使其变得极其不稳定,变得比正常细胞更容易受伤。所以为了亡羊补牢,只能在M期于基因组特定区域加班复制DNA,来维持DNA的稳定性。

记者3:那么这个基因组特定区域指的是哪里呢?

DNA家族:染色体的“脆性位点”。该区域之所以易断裂,是因为新合成的DNA区域与染色体其他区域连接不紧密,对与癌症相关联的错误基因组重排有影响,而癌细胞也正是利用这种特殊时期的DNA复制模式进行无限恶性增殖。

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记者4:原来如此,看来DNA复制与肿瘤之间也存在着千丝万缕的关系啊。那么前段时间,疯传的近2/3癌症突变归因于随机DNA复制错误,也是事实喽,对此你们家族的看法是什么呢?

DNA家族:咳咳,这人咋哪壶不开提哪壶啊?嗯,这个嘛,其实我们也是知道的。早在两年前,约翰霍普金斯大学的研究者们就在Science杂志上发表了一篇论文,表明大多数癌症的发生其实是随机的,取决于「上帝掷骰子」。结果引发了一场争议风暴,毕竟不符合已知的“环境因素和遗传是导致癌症发生的主要因素”的主流说法,因此他们也受到科学界大规模的批评。

近期,这几位不服气的科学家又从全球涵盖48亿人的69个国家收集海量数据,对32种癌症类型的发病率和相关性进行全面的研究后,发现29%的癌症相关突变归因于环境因素,5%来自遗传因素,66%则是源于DNA复制随机错误。

确实,细胞分裂作为新细胞产生的主要方式,每一次分裂过程中DNA复制就会平均随机产生3次错误。但大多数复制错误都是无害的,只有小部分错误将会导致细胞“失去控制”,进而发生癌变。换句话说,细胞分裂过程中发生的大多数突变是无害的,但是极少数情况下,这些突变才会导致癌症。

虽然这项新研究表明许多肿瘤类型的发生不可预防,但癌症的死亡却是可以预防的,如果能将更多的资源集中在癌症早期的发现和干预,则可在癌症扩散前,通过手术或辅助治疗来减少癌症死亡。

好了,聊了这么多,想来大家对DNA复制也有一定程度的认识,那么今天的记者专访会就到此结束。

众记者:唉?唉?唉?还有好多问题没有提问呢?!

DNA家族:你们的那些问题对我们而言,那都属于天机不可泄露,你们还是等待未来科学家们来给予你们答案吧!

参考文献:1.Independent and Stochastic Action of DNA Polymerases in the Replisome(DOI: http://dx./10.1016/j.cell.2017.05.041)

2.Close-Up View of DNA Replication Yields Surprises

3.Replication stress activates DNA repair synthesis in mitosis(doi:10.1038/nature16139)

4.Stem cell divisions, somatic mutations, cancer etiology, and cancer prevention(DOI: 10.1126/science.aaf9011)

5.Genes, environment, and “bad luck”(DOI: 10.1126/science.aam9746)

6.https:///news/2017-03-cancer-mutations-due-random-dna.html

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