做生物信息学的时候,往往需要找到对应的物种,但是往往物种是用拉丁文写的,这是非常令人头痛的事情。例如在GO和KEGG富集分析时常常要我们选择对应的物种,如果我们的基因是人、小鼠、大鼠,这就好办了,可能大家一眼就看出了,如果是其他动物,或者是植物,大家就懵逼了。因此,这里总结了大量的物种供大家参考。
Ateles geoffroyi 蜘蛛猴 | age | Human lymphocryptovirus 伊波病毒 | ebv | Gorilla gorilla 大猩猩 | ggo | Human cytomegalovirus 人类巨细胞病毒 | hcmv | Human immunodeficency virus 1 人类艾滋病毒 | hiv1 | Homo sapiens 人 | hsa | Human rhadinovirus 人类卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒 | kshv | Lemur catta 环尾狐猴 | lca | Lagothrix lagotricha 绒毛猴 | lla | Macaca mulatta 猕猴 | mml | Macaca nemestrina 豚尾猕猴 | mne | Pygathrix bieti 黑腿白臀叶猴 | pbi | Pan paniscus 侏儒黑猩猩 | ppa | Pongo pygmaeus 婆罗州猩猩 | ppy | Pan troglodytes 黑猩猩 | ptr | Rhesus lymphocryptovirus 恒河猴淋巴隐伏病毒属 | rlcv | Rhesus monkey rhadinovirus 恒河猴疱疹病毒 | rrv | Symphalangus syndactylus 合趾猿 | ssy |
| Mouse gammaherpesvirus 68 – | mghv | Mus musculus 小鼠 | mmu | Rattus norvegicus 大鼠 | rno |
| Caenorhabditis briggsae秀丽隐杆线虫 | cbr | Caenorhabditis elegans 秀丽小杆线虫 | cel | Drosophila ananassae 果蝇 | dan | Drosophila erecta 果蝇 | der | Drosophila grimshawi 果蝇 | dgr ­ | Drosophila melanogaster 黑腹果蝇 | dme | Drosophila mojavensis 果蝇 | dmo | Drosophila persimilis 果蝇 | dpe | Drosophila pseudoobscura 拟暗果蝇 | dps | Danio rerio 斑马鱼 | dre | Drosophila sechellia 果蝇 | dse | Drosophila simulans 果蝇 | dsi | Drosophila virilis 果蝇 | dvi | Drosophila willistoni 果蝇 | dwi | Drosophila yakuba 果蝇 | dya | Xenopus laevis 非洲爪蟾 | xla | Xenopus tropicalis 热带爪蟾 | xtr | Arabidopsis thaliana 阿拉伯芥 | ath | Brassica oleracea 芥蓝菜 | bol | Brassica rapa 油菜 | bra | Oryza sativa 水稻 | osa | Populus trichocarpa 三角叶杨 | ptc | Solanum lycopersicum 西红柿 | sly | Vitis vinifera 葡萄 | vvi |
Anopheles gambiae 蚊子 | aga | Apis mellifera 蜜蜂 | ame | Branchiostoma floridae 佛罗里达文昌鱼 | bfl | Bombyx mori 蚕 | bmo | Bos taurus 牛 | bta | Capitella sp. I 淡水小头虫 | cap | Canis familiaris 狗 | cfa | Cricetulus griseus 中国仓鼠 | cgr | Ciona intestinalis – | cin | Ciona savignyi 海鞘 | csa | Takifugu rubripes 日本虎河豚 | fru | Gallus gallus 鸡 | gga | Lottia gigantea 霸王莲花青螺 | lgi | Locusta migratoria 东亚飞蝗 | lmi | Monodelphis domestica 短尾负鼠 | mdo | Mardivirus gallid herpesvirus2 type 1 (禽类)马立克氏病病毒 | mdv1 | Mardivirus gallid herpesvirus2 type 2 (禽类)马立克氏病病毒 | mdv2 | Macaca mulatta 猕猴 | mml | Ornithorhynchus anatinus 鸭嘴兽 | oan | Ovis aries 绵羊 | oar | Oikopleura dioica 异体住囊虫 | odi | Saccoglossus kowalevskii 囊舌虫 | sko | Saguinus labiatus 白唇獠狨 | sla | Schmidtea mediterranea 真涡虫 | sme | Strongylocentrotus purpuratus 紫海胆 | spu | Sus scrofa 野猪 | ssc | Tribolium castaneum 拟谷盗 | tca | Tetraodon nigroviridis 斑点绿河豚 | tni |
| Brassica napus 欧洲油菜 | bna | Carica papaya 木瓜 | cpa | Chlamydomonas reinhardtii 绿藻 | cre | Dictyostelium discoideum 黏菌 | ddi | Gossypium herbecium 草棉 | ghb | Gossypium hirsutum 棉花 | ghr | Glycine max 黄豆 | gma | Gossypium rammindii – | gra | Medicago truncatula 蒺藜苜蓿 | mtr | Physcomitrella patens 苔藓 | ppt | Pinus Taeda 火炬松 | pta | Sorghum bicolor 高粱,蜀黍 | sbi | Solanum lycopersicum 西红柿 | sly | Selaginella Moellendorffii 地衣类 | smo | Saccharum officinarum 甘蔗 | sof | Triticum aestivum 小麦 | tae | Zea mays 玉米 | zma |
希望本文对大家有所帮助。
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