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一作解读|小麦-簇毛麦#4易位系Pm97033中抗白粉病基因的筛选和功能鉴定

 洋溢九洲 2021-01-04

小麦白粉病Blumeria graminis f.sp. tritici, Bgt是危害小麦生产的主要病害之一,培育和利用抗病品种是防治小麦白粉病的经济、有效途径。到目前为止,从小麦及其近缘物种中共鉴定了106个白粉病抗性基因,其中仅克隆了Pm2Pm3Pm5ePm8Pm21Pm24Pm41Pm60 Cao et al. 2011; Hurni et al. 2013; Yahiaoui et al. 2004; Sanchez-Martin et al. 2016; He et al. 2018; Xing et al. 2018; Zou et al. 2018; Chen et al. 2019; Lu et al. 2020; Xie et al. 2020; Li et al. 2020。簇毛麦是小麦的一个重要野生近缘种属,具有许多优良特性(包括高抗白粉菌),是小麦遗传改良的优良基因库。簇毛麦来源比较多,其中的簇毛麦#1-#5最受研究者关注。业已从簇毛麦中鉴定了CMPG1-V、PDI-V、LecRK-V、ERF1-V、Stpk-VPm55Pm62PmV Pm21等基因。尤其是,南京农业大学曹爱忠团队,江苏大学何华纲团队、江苏里下河地区农业科学研究所别同德团队利用图位克隆方法,从簇毛麦6V#2及其T6V#4S·6AL易位系中成功克隆了Pm21基因,表明该基因编码一个典型的CC-NBS-LRR蛋白。

为了挖掘簇毛麦#4中的白粉病抗性基因,我们对小麦-簇毛麦T6V#4S·6DL小麦抗病易位系Pm97033和感病亲本宛7107(W7107)接种白粉病菌0、12、24和48h后的叶片进行了转录组测序。在Pm97033 vs W7107有参部分0 h时共有2830个差异基因,12h时共有3990个差异基因,24h时共有2568个差异基因,48h时共有6688个差异基因;122448h之间有1718个共有基因,GO注释发现生物过程中最显著富集的是蛋白磷酸化,分子功能中最显著富集的是蛋白激酶活性。KEGG注释发现苯丙醇生物合成是最显著富集的通路,其次是苯丙氨酸代谢、次生代谢合成、植物-病原菌互作和乙醛酸和二羧酸酯代谢等;1718个共有基因中有890个为新基因,8个与抗病相关基因在Pm97033中特异表达,基因功能主要涉及抗病蛋白、半胱氨酸类受体蛋白激酶和细胞壁连接受体激酶。在Pm97033 vs W7107无参部分,0 h时共有46个差异基因,12h时共有1236个差异基因,24h时共有410个差异基因,48h时共有1137个差异基因;1248h之间共有基因566个。P12 vs W12P48 vs W48一起共有抗病相关基因22个,其中,c112345_g2c112345_g3注释到Pm21,可能在Pm97033对白粉菌的抗病过程中起重要作用。

筛选到35个位于6V#4S染色体上的unigene序列,其中15个是与抗病相关的基因,利用qRT-PCR分析发现其中7个受白粉菌诱导上调表达。并分析了35unigene在小麦6A6B6D和大麦6H上的共线性关系,发现大部分unigene在小麦6群和大麦6H短臂上具有较好的共线性。又利用其中25unigeneW7107Pm97033、簇毛麦#410SR3109和簇毛麦#2等材料进行扩增,将这些unigene分为了3种类型:(1)在簇毛麦#2#4中具有一致扩增条带;(2)在簇毛麦#2#4中具有不同大小扩增条带;(3)在簇毛麦#4中有特异条带,而簇毛麦#2中无此特异条带。

进一步利用BSMV-VIGS、转基因和基因编辑技术对4个基因DvLoxDvFbxPm21#4 Pm21#4-H 进行了功能验证。DvLoxDvFbx Pm21#4 Pm97033中沉默之后均影响了其对白粉菌的抗性。DvLox DvFbx 分别编码脂氧合酶和F-box家族蛋白,属于防卫基因,可能在抗病过程中起作用。过表达DvLox 的小麦植株对白粉菌具有一定抗性,但抗性提高不显著。Pm21#4 编码1CC-NB-LRR抗病蛋白,可能在Pm97033对白粉菌的抗病过程中起关键作用。过表达Pm21#4 的小麦植株对白粉菌混合菌种表现免疫(1),编辑Pm21#4 后的沉默小麦植株对白粉菌混合菌种高感(2)。Pm21#4 Pm21#4-H 都编码CC-NB-LRR抗病蛋白,但Pm21#4-H Pm97033中不受白粉菌诱导表达,过表达Pm21#4-H 基因的转基因小麦植株对白粉菌混合菌种表现免疫(3


图1 Fielder中过表达Pm21#4 基因的小麦植株对白粉菌混合菌种表现免疫
 

图2 编辑Pm97033Pm21#4 基因的沉默小麦植株对白粉菌混合菌种高感
图3 Fielder中过表达Pm21#4-H 基因小麦植株对白粉菌混合菌种表现免疫

该研究首次报道了簇毛麦#4中抗白粉病基因Pm21#4 Pm21#4-H 的筛选及功能鉴定,丰富了小麦抗白粉病基因资源,对于小麦抗白粉病育种具有实际应用价值。

2020年7月19日,这一研究成果在线发表在《Theoretical and Applied Genetics》,论文题目为“Screening and functional characterization of candidate resistance genes to powdery mildew from Dasypyrum villosum#4 in a wheat line Pm97033”。中国农业科学院作物科学研究所已毕业博士生李仕金和在读硕士生贾子苗为论文共同第一作者,林志珊副研究员和叶兴国研究员为论文通讯作者,王轲副研究员、杜丽璞高级实验师和李洪杰研究员为论文共同作者。

原文链接
https:///10.1007/s00122-020-03655-4
参考文献:
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Li SJ, Jia ZM, Wang K, DuLP, Li HJ, Lin ZS, Ye XG (2020) Screening and functional characterization of candidate resistance genes to powdery mildew from Dasypyrum villosum#4 in a wheat line Pm97033. Theor Appl Genet https:///10.1007/s00122-020-03655-4
Li SJ, Lin ZS, Liu C,Wang K, Du LP, Ye XG (2017) Development and comparative genomic mapping of Dasypyrum villosum 6V#4S-specific PCR markers using transcriptome data. Theor Appl Genet 130:2057–2068
Li SJ, Wang J, Wang KY,Chen JN, Wang K, Du LP, Ni ZF, Lin ZS, Ye XG (2019) Development of PCR markers specific to Dasypyrum villosum genome based on transcriptome data and their application in breeding Triticum aestivum-D. villosum#4 alien chromosome lines. BMC Genomics 20:289
Xing LP, Hu P, Liu JQ, Witek K, Zhou S, Xu JF, Zhou WH, Gao L, Huang ZP, Zhang RQ, Wang XE, Chen PD, Wang HY, Jones JDG, Karafiátová M, Vrána J, Bartoš J, Doležel J, Tian YC, WuYF, Cao AZ (2018) Pm21 from Haynaldia villosa encodes a CC-NBS-LRR protein conferring powdery mildew resistance in wheat. Mol Plant 11:874–878 

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