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有很多网友说分享一下如何用生信+实验分析miRNA发SCI的方法，所以这次就分享一下使用TCGA数据挖掘+细胞实验分析miRNA发SCI的思路,本次参考范文题目：Let-7i-5p enhances cell proliferation, migration and invasion of ccRCC by targeting HABP4，该文章发表在BMC Urology上，影响因子：1.592，中科院最新分区：4区，审稿周期：3-4个月，版面费：$2390.00，不在中科院《国际期刊预警名单（试行）》名单（ 2021年1月发布版）上。 分析思路： 1、首先就是通过查阅文献发现一个在自己研究领域没有进行研究过的miRNA，例如范文分析的是Let-7i-5p ，然后先通过TCGA数据分析Let-7i-5p 的表达情况、与临床因素的相关性以及对预后的影响，再确定是否开展细胞功能实验研究（有条件的话可以收集临床样本测序验证其表达，以及在细胞系的表达验证、蛋白水平的验证，这样会更可靠一些，后期风险相对比较低）。 2、通过第一步的分析，确定Let-7i-5p是值得做实验的，分析Let-7i-5p对ccRCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响。 3、上面分析了Let-7i-5p细胞功能，当然需要探索一下其作用机制，范文就直接寻找下游的作用机制，通过预测靶基因分析发现Let-7i-5p很可能是通过调控HABP4发挥作用的，并且分析HABP4对ccRCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响，进一步实验验证HABP4是直接受Let-7i-5p调控的。 总结： 这篇范文思路比较简单清晰：作者通过TCGA数据分析Let-7i-5p 的表达情况及预后影响，然后分析其对ccRCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响，然后探索其是通过调控哪一个基因发挥作用的，这种思路比较容易模仿复现，风险也是相对比较低的，研究内容不够深入，发文高度较低。可能是由于经费等原因，作者并没有收集临床样本测序验证其表达，以及在细胞系的表达验证、蛋白水平的验证，也没有探索下游靶基因是通过激活哪条信号通路发挥作用的，当然还可以探索ceRNA作用机制（circRNA/lncRNA-miRNA-gene）。 |
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