【原】染色质免疫共沉淀技术ChIP介绍

1.ChIP的分类

ChIP-Seq：将ChIP与**代测序技术相结合的技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等相互作用的DNA区段。

ChIP-chip：将ChIP与DNA芯片相结合的技术，主要用于特定反式因子靶基因的高通量筛选以及组蛋白修饰和染色体重建。

RIP：RNA结合蛋白**沉淀技术，是研究细胞内RNA与蛋白质相互作用的一项技术。主要用于研究RNA在基因表达调控中的作用。

ChIP-Re-ChIP：在次ChIP的基础上不解交联，而继续进行另一个目的蛋白的**沉淀，从而得到与两种目的蛋白都结合的DNA序列。

2.染色质免疫共沉淀测序技术优势：

检测覆盖范围广：全基因组范围内扫描目标区域；

检测分辨率高：更利于定位目标区域；

样本需要量低：需要的**沉淀后的DNA量可低至5-10ng；

可靠性好：避免了非特异性杂交，背景低；

性价比高：花费较少即可检测全基因组，获取准确丰富的信息。

3.ChIP试剂盒的选择

由于ChIP实验的操作繁琐、每一步反应需要注意的细节很多，常常需要花费实验者很长的时间才能完成整个实验，而且回收得到的DNA片段可能出现各种各样的问题。因此，为了帮助广大科研用户解决这些问题，许多商业化的ChIP试剂盒问世。