|
染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。 实验流程 （1）甲醛交联整个细胞系（组织），即将目标蛋白与染色质连结起来；（这一步一般会检测下交联情况） （2）分离基因组DNA，并用超声波将其打断成一定长度的小片段； （3）添加与目标蛋白质特异的抗体，该抗体与目标蛋白形成免疫沉淀免疫结合复合体；（chip级别的抗体，会有效率问题存在，很考验抗体质量和操作） （4）去交联，纯化DNA即得到染色质免疫沉淀的DNA样本，准备测序； （5）将准备好的样本进行深度测序（一般会准备空白对照，排除假阳性，有两种，1.input DNA：不用任何抗体拉的DNA；2.mock IP DNA：用不含有抗体的DNA） 优缺点      |
|
|
