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最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录，这里先放出直播我的基因组（第一阶段）完整目录。 （悄悄告诉你，后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格！） （然后，点击阅读原文也可以拿到可以跳转的目录） （再或者复制粘贴url：http:///tmp/blog-my-genome.xlsx 到浏览器打开） 希望大家能有所收获！ | 我的基因组01 | 直播的目的及意义 | | 我的基因组02 | 科研和临床分析调研 | | 我的基因组03 | 抽血送样测序 | | 我的基因组04 | 计算资源的准备 | | 我的基因组05 | 测试数据及参考基因组的准备 | | 我的基因组06 | 变异位点注释数据库的准备 | | 我的基因组07 | 从整体理解全基因组测序数据的变异位点 | | 我的基因组08 | 原始测序数据质量报告 | | 我的基因组09 | 拿到数据后要做的事情 | | 我的基因组10 | 测序数据质量控制 | | 我的基因组11 | 测序数据的比对 | | 我的基因组12 | 先粗略看看几个基因吧 | | 我的基因组13 | 了解sam格式比对结果 | | 我的基因组14 | bam文件给按照染色体给分割成小文件 | | 我的基因组15 | 提取未比对的测序数据 | | 我的基因组16 | 提取左右端测序数据比对到不同染色体的PE reads | | 我的基因组17 | 初步分析一下multiple mapping 的情况 | | 我的基因组18 | 初步分析PCR duplication的情况 | | 我的基因组19 | 根据比对结果来统计测序深度和覆盖度 | | 我的基因组20 | 覆盖度详细探究 | | 我的基因组21 | 为什么我算出的染色体覆盖度与公司差异甚大 | | 我的基因组22 | 用IGV查看具体某个位点是否变异 | | 我的基因组23 | 对比对结果文件进行过滤 | | 我的基因组24 | 用GATK对SAM格式的文件进行重排 | | 我的基因组25 | 用bcftools来call variation | | 我的基因组26 | GATK的realign对最后的结果影响到底有多大 | | 我的基因组27 | 先简单统计一下全基因组变异情况吧 | | 我的基因组28 | 必须要理解vcf格式记录的变异位点信息 | | 我的基因组29 | 统计1000 genome hom-het ratio | | 我的基因组30 | 使用软件把变异分类—添加tag | | 我的基因组31 | vcf文件标记dbSNP的rsID号 | | 我的基因组32 | 使用annovar注释vcf | | 我的基因组33 | 用samstat软件对sam文件做统计 | | 我的基因组34 | Qualimap对比对好的bam文件进行统计及可视化 | | 我的基因组35 | bam格式转化为bw格式看测序深度分布 | | 我的基因组36 | 这些可能是somatic突变的位点究竟是什么？ | | 我的基因组37 | gwas研究结果在我身上得到了验证 | | 我的基因组38 | 我得了艾滋病？我是暴躁狂？ | | 我的基因组39 | 从bam中提取我们的原始测序数据 | | 我的基因组40 | 不同lane的bam文件的比较 | | 我的基因组41 | 按照不同的lane来call variation | | 我的基因组42 | 不同lane的variation的比较 | | 我的基因组43 | 简单粗糙的WGS数据分析流程 | | 我的基因组44 | 比对文件画profile和heatmap图 | | 我的基因组45 | SNV突变(6种)频谱的制作 | | 我的基因组46 | SNV突变(96种)频谱的制作 | | 我的基因组47 | 测序深度和GC含量的关系 | | 我的基因组48 | 我可能测了一个假的全基因组 | | 我的基因组49 | Y染色体的SNV不能用常规流程来找？ | | 我的基因组50 | 从测序深度和位点间距来看SNV分布情况 | | 我的基因组51 | 画全基因范围内的染色体reads覆盖度图 | | 我的基因组52 | X和Y染色体的同源区域探索 | | 我的基因组53 | 几个找变异的软件的效果比较 | | 我的基因组54 | 把我的variation跟dbSNP数据库相比较 | | 我的基因组55 | 简单的PCA分析千人基因组的人群分布 | | 我的基因组56 | 探索遗传起源 | | 我的基因组57 | 最简陋的祖源分析 | | 我的基因组58 | 用R包SNPRelate来对我的基因型跟hapmap计划数据比较 | | 我的基因组59 | 把我的数据伪装成23andme或wegene的芯片数据 | | 我的基因组60 | CNV初步探索 | | 我的基因组61 | scalpel软件找indel | | 我的基因组62 | 用Delly检测SV | | 我的基因组63 | wegene芯片跟二代测序的简单比较 | | 我的基因组64 | 用gwas来预测健康风险 | | 我的基因组65 | 什么性状一定是由单个基因简单决定的？ | | 我的基因组66 | 大多数性状往往是多个基因控制的 | | 我的基因组67 | clinvar数据库 | | 我的基因组68 | 看看哪些基因的突变较多，哪些较少 | | 我的基因组69 | 一个标准的基因检测报告目录 | | 我的基因组70 | 比对文件并不能完美的还原出测序文件 | | 我的基因组71 | WGS流程可以有多复杂 | | 我的基因组72 | 把基因检测芯片数据转为vcf格式 | | 我的基因组73 | 在IGV看看indel是啥样子 | | 我的基因组74 | 快速给测序reads比对到物种 | | 我的基因组75 | 为什么我的血液里面有这些菌？ | | 我的基因组76 | 用krona对血液全基因组的菌比例可视化 | | 我的基因组77 | 批量计算每个蛋白编码基因的测序深度及覆盖度 | | 我的基因组78 | 简单解析一下蛋白编码基因的测序深度及覆盖度 | | 我的基因组79 | 为什么这些基因的覆盖度如此之低？ | | 我的基因组80 | 为什么有些基因的内部测序深度差异如此大 | | 我的基因组81 | 看看我的vcf文件的vaf分布情况 | | 我的基因组82 | 如何对maf格式的突变文件统计vaf | | 我的基因组83 | 批量IGV截图 | | 我的基因组84 | 从WGS测序得到的VCF文件里面提取位于外显子区域 | | 我的基因组85 | 安装snpEFF工具并对VCF文件进行注释 | | 我的基因组86 | 基因组重测序的unmapped reads assembly探究 | | 我的基因组87 | 探究某个基因的外显子覆盖度情况 |
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