该数据是我自己下载整理过的数据。 下载日期:2021年8月25日
下载方式:TCGAbiolinks包 数据类型:RData 变量名称:mir_Count;mir_RPM
path <- dir("processedTCGAdata/TCGA-miRNA_Isoform_Count/",".RData$", full.names = T) path[1] load(path[1]) head(mir_Count)[,1:3] 后台回复:TCGA-miRNA-Seq,下载。 相关文章:数据库数据 | TCGA数据库33种癌症的
transcriptome profiling (RNA-Seq) 数据
往期文章一.Linux笔记Linux笔记【001】| 初识Linux Linux笔记【002】| 远程登录服务器软件:MobXterm与FileZilla Linux笔记【003】| Linux系统目录结构与基本命令 Linux笔记【004】| 文件/文件夹的基本操作命令 Linux笔记【005】| vim编辑器使用教程 Linux笔记【006】| 用户及用户组 Linux笔记【007】| 文件/文件夹属性设置 Linux笔记【008】| 文件系统与文件压缩 Linux笔记【009】| 文本操作神器 Linux笔记【010】| Linux的运行模式与网卡设置 Linux笔记【011】| 腾讯CentOS云服务器挂载云硬盘与硬盘分区 二.R语言语法基础第01章:R语言简介 第02章:R语言安装和下载 第02章:RStudio的使用教程 第03章:R中的数据 (1):从存储角度划分 (2):从结构角度划分(向量) (3):从结构角度划分(矩阵) (4):从结构角度划分(数组) (5):从结构角度划分(数据框) (6):从结构角度划分(列表) (7):从结构角度划分(因子) (8):数据之间的转换 第04章:字符串操作与正则表达式 第05章:判断语句 第06章:循环语句 第07章:操作系统文件 第08章:数据的输入与输出 第09章:数据的预处理与重构(1) 数据的预处理与重构(2) 数据的预处理与重构(3) 第10章:函数 第11章:R中的网络爬虫 第12章:面向对象编程(S3类与S4类) 三.R绘图笔记01. R绘图笔记 | R语言绘图系统与常见绘图函数及参数 02. R绘图笔记 | 一般的散点图绘制 03. R绘图笔记 | 柱状图绘制 04. R绘图笔记 | 直方图和核密度估计图的绘制 05. R绘图笔记 | 二维散点图与统计直方图组合 06. R绘图笔记 | 散点分布图与柱形分布图 07. R绘图笔记 | 箱形图的绘制 08. R绘图笔记 | 小提琴图与漂亮的云雨图绘制 09. R绘图笔记 | 带抖动散点的多数据系列箱型图 10. R绘图笔记 | 热图的绘制 11. R绘图笔记 | 生存曲线的绘制 12. R绘图笔记 | 火山图的绘制 13. R语言数据可视化——解读ggplot2绘图思想视频教程 14. R绘图笔记 | 词云图的绘制 15. R绘图笔记 | GO-BP,GO-MF,GO-CC绘制在同一个柱状图中 四.R与统计第1章:数据预处理(1)——缺失值处理 第1章:数据预处理(2)——缺失值常用的处理方法 第1章:数据预处理(3)——数据整理 第2章:统计学基础(视频) 第3章:R语言绘图基础(看上一部分文章) 第4章:回归分析(1)——一元回归分析 第4章:回归分析(2)——多元线性回归 第4章:回归分析(3)——变量的选择 第4章:回归分析(4)——logistic回归 第5章:方差分析(1)——单因素方差分析 第5章:方差分析(2)——多因素方差分析 第5章:方差分析(3)——协方差分析 第6章:主成分分析(1)——主成分分析概论 第6章:主成分分析(2)——案例讲解 第7章:因子分析 第8章:判别分析(1)——距离判别法 第8章:判别分析(2)——贝叶斯(Bayes)判别分析 第8章:判别分析(3)——费歇尔(Fisher)判别分析 第9章:聚类分析(1)——动态聚类 第9章:聚类分析(2)——层次聚类 五.文献笔记001.HOXC11作为一种新的致癌基因在人结肠癌和肾透明细胞癌中发挥作用 002.在基底细胞样乳腺癌中,ANXA4通过与ANXA1相互作用激活JAK-STAT3信号通路 003.ANXA8在胃癌中的预后价值 004.TIMER2.0用于分析肿瘤免疫细胞浸润 005.KLF7:高级别浆液性卵巢癌新的候选生物标志物和治疗靶点 006.胰腺导管腺癌的免疫细胞浸润及其临床意义 六.分子对接01. 分子对接教程 | (1) 软件安装准备 02. 分子对接教程 | (2) 选择合适的蛋白受体 03. 分子对接教程 | (3) 配体分子文件格式转换 04. 分子对接教程 | (4) 蛋白受体文件的预处理 05. 分子对接教程 | (5) 配体小分子的预处理 06. 分子对接教程 | (6) AutoDock对接操作与对接结果解读 07. 分子对接教程 | (7) AutoDock对接中易错问题 08. 分子对接教程 | (8) PyMOL可视化对接结果 七.生信在线分析工具001. 生信工具 | TCGA数据分析工具GEPIA最新更新,用于免疫细胞浸润分析
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