收获后贮藏是马铃薯生产和利用中的一个非常重要的环节。无论是鲜薯销售也好，还是加工也好，都离不开贮藏保鲜。但农村马铃薯贮藏保鲜存在很多问题，贮藏不当极易导致马铃薯商品性下降。
我省晚熟马铃薯多在9月中旬收获。当马铃薯地上部分茎叶变黄、倒伏和枯萎时，马铃薯可以采收。收获应在晴天进行，将薯块就地晾晒半天左右，散发部分水分，使薯皮干燥，以便降低贮藏中的发病率。
为了提高马铃薯贮藏保鲜效果，入窖时，要求入窖块茎个体完整，薯皮干燥、无腐烂及其他杂质等。可是有些农户在马铃薯秋收入窖时，图省事，不愿多用工，不经晾晒和挑选，使泥土与块茎混合，并将潮湿淋雨的薯块和冻、病、伤、烂的薯块一起入窖。入窖时将马铃薯从窖口向窖内倾倒，把薯摔伤，或人在薯上踩踏，造成薯块受伤等，严重影响了入窖质量。泥土多会造成湿度大，通气不畅，同时还带入各种病菌;病、烂薯块入窖，直接把大量病菌接种在薯堆内，成为窖内发病的病源;伤薯易于使真菌和细菌侵入，会导致病害的扩大蔓延;湿度大不仅能满足病菌繁殖传染条件，促进病害发展，同时也易于造成块茎早期发芽，影响质量。因此入窖前，应对薯块进行认真的晾干和整理，做到薯皮干燥，无病块、无腐烂、无伤口、无破皮、无冻块及无泥土杂物。
有的选址不当，在地下水位高处建窖，造成窖内湿度大，甚至出水;或薯窖正对风口，容易出现冻窖。有的窖建造得太浅，顶部覆薄土，薯堆上部接近冻层，也易造成冻窖。还有的没有通风孔道，或通风孔道设置得不合理，因而无法调节窖内温湿度，更无法通进新鲜空气，以致使所贮薯块受损害。因此，贮藏窖要选择在地下水位低、背风的地方建造，并防止窖顶太薄。建窖结构的改进主要是增加通风换气设施。
使用过的薯窖，避免不了要残存一些薯块带来的土壤，残、烂、废薯等，这些东西上都会附着各种真菌和细菌，接触过薯块的墙壁、通风道、通风沟、垫板等也会附着病原菌，如果不经处理就使用，肯定会成为下次存贮茎块的菌源，所以必须认真进行清理和消毒灭菌。首先是把薯窖地表的土和一些残存的杂物清理出去，窖内不留死角。同时，要运进新从山上或河滩取回来的沙土，均匀铺垫到地面上。然后，对墙壁等进行全方位消毒。可以使用75%的百菌清可湿性粉剂500倍液，对墙壁、地面、通风道喷雾消毒。也可用百菌清烟剂熏蒸消毒，施药后密闭36小时以上，然后通风，也可用硫磺或甲醛溶液熏蒸。
贮藏管理工作的主要任务，就是通过调节和控制窖内温湿度，搞好通风换气，增加窖内氧气浓度，减少窖内呼吸时产生的热量，来防止贮藏病害的发生，防止块茎非正常失水，伤热、发芽等现象的发生。具体操作的原则是“既防冻又防热，既防干又防湿”。湿度应维持在相对湿度的90%-95%，温度12℃-18℃，保持10-14天，然后以每天降0.5℃的速度，一直降至块茎不同用途要求的贮藏温度和湿度，并保持整个贮藏期。具体温度是3℃-4℃;湿度应保持在90%左右，最安全的范围是80%-93%，湿度万万不能过大。
