|
APOBEC3B能够诱发肿瘤突变，并在人体免疫反应中发挥重要作用。在这项研究中，作者招募了482名胃癌（GC）患者进行免疫组织化学（IHC）染色以评估APOBEC3B的预后价值。同时，作者下载了来自癌症基因组图谱（TCGA）和亚洲癌症研究（ACRG）队列的基因组和表型数据集用于外部验证和生物信息学分析。随后，作者收集了另外60名患者的新鲜标本，用流式细胞术（FCM）检测CD8+T细胞表型。结果表明，APOBEC3B高表达的GC患者总生存率和无病生存率更低，但在TNM II期患者中对基于氟尿嘧啶的辅助化疗（ACT）的治疗反应性更好。APOBEC3B高表达的肿瘤微环境（TME）中的表达效应分子和免疫检查点的肿瘤反应性CD8+T细胞浸润减少。此外，APOBEC3B与免疫失活和基因组改变的关联研究表明APOBEC3B有希望作为免疫治疗和靶向治疗的潜在生物标志物。 发表杂志：Oncoimmunology. 影响因子：8.11 小编最近筛选到一些结果比较好的基因，需要做深入分析的可以联系小编喔。 被致谢！2021年7分+单基因泛癌纯生信，投稿到接受30天！ 请扫描下方二维码 研究背景 胃癌是一种异质性恶性肿瘤，其中一部分与Epstein–Barr病毒（EBV）感染密切相关。宿主响应病毒感染分泌的细胞因子可诱导胞苷脱氨酶/载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽(AID/APOBEC)家族基因的表达，包括载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3B(APOBEC3B)。从机制上讲，APOBEC3B可以通过特异性催化胞嘧啶到胸腺嘧啶(C到T)的脱氨基转变来促进突变过程。因此，APOBEC3B最初被确定为一种针对逆转录病毒的细胞防御系统。随后的研究表明，APOBEC3B参与了多种恶性肿瘤的发生发展，并在基因组不稳定性和癌基因突变中发挥了重要作用。APOBEC3B在多种癌症中过表达，并与肿瘤分期、复发、远端转移和预后密切相关。 流程图 分析解读： APOBEC3B高表达与肿瘤进展相关 ①研究APOBEC家族与GC中拷贝数变异（CNA）的相关性。 ②免疫组织化学（IHC）染色以评估APOBEC3B在GC组织和癌旁组织中的表达差异。 ③研究APOBEC3B与肿瘤淋巴结转移（TNM）之间的关联。 ④研究APOBEC3B与肿瘤突变负荷（TMB）之间的关联。 结果： 下图a：APOBEC家族成员与基因组拷贝数变异之间的相关性。 下图b：胃癌和癌旁组织中APOBEC3B的IHC染色。APOBEC3B阳性细胞为棕色。 下图c：条形图显示了APOBEC3B在胃癌（蓝色）和癌旁（红色）IHC评分的分布（n=482）。 下图d：APOBEC3B在胃癌中的表达与TNM分期呈正相关。 下图e：在APOBEC3B过表达的患者中，肿瘤突变负荷升高。 APOBEC3B的预后价值 ①分析APOBEC3B在TCGA队列和中山医院（ZSHS）队列中的预后价值。 ③Kaplan-Meier分析APOBEC3B过表达对肿瘤OS和DFS的影响。 结果： 下表：GC临床病理参数的单变量和多变量分析。 下图a-d：Kaplan-Meier曲线表明训练集(a，b)和验证集(c，d)中APOBEC3B过表达的肿瘤患者的OS和DFS较差。 下图e：森林图显示不同TNM阶段APOBEC3B表达的风险比(HR)和95%置信区间(CI)。 免疫细胞浸润分析 ①应用CIBERSORT研究APOBEC3B与肿瘤微环境内免疫细胞之间的关联。 ②流式细胞术验证APOBEC3B和CD8+T细胞之间的关系。 结果： 下图a：在APOBEC3B过表达的肿瘤中观察到M0极化巨噬细胞增加，而CD8+T细胞和CD4+T细胞减少。 下图b：流式细胞术分析检测到CD8+T细胞比例与APOBEC3B表达之间呈负相关趋势。 下图c：Kaplan-Meier曲线显示，在APOBEC3B过表达的亚组中，CD8+T细胞浸润与总生存期延长有关。 下图d：热图显示APOBEC3B表达与CD8+T细胞活化或衰竭评分之间的关联。 下图e：流式细胞术检测APOBEC3B过表达的肿瘤中CD8+T细胞的表型。 治疗反应性预测 ①研究APOBEC3B是否可以预测GC的治疗反应性。 ②研究APOBEC3B与治疗GC的靶向药作用途径之间的关联。 ③研究APOBEC3B在预测GC中程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)阻断的免疫治疗反应方面的潜在价值。 结果： 下图a：单变量Cox分析的Kaplan-Meier曲线显示在根据APOBEC3B表达分层的亚组中，II期或III期患者（n=345）对基于氟尿嘧啶的辅助化疗(ACT)有反应。 下图b：森林图显示了ACT在不同亚组中的预后。 下图c：瀑布图显示肿瘤患者对派姆单抗的反应性。 CD8+T浸润与APOBEC3B ①对于APOBEC3B过表达的TNM II期患者，使用亚组分析研究CD8+T细胞浸润与ACT敏感性之间的关联。 结果： 下图a：在APOBEC3B过表达的TNM II期GC中，CD8+T浸润对ACT的影响。 下图b：在ICB队列中，APOBEC3B与CD8A呈负相关。 小结： 这项研究旨在探讨APOBEC3B对GC的预后价值，并揭示APOBEC3B过表达对GC免疫逃逸机制的影响。研究表明，高表达APOBEC3B的GC患者预后较差，但对基于氟尿嘧啶的化疗反应良好。同时，APOBEC3B与TMB、CNA和致癌基因TP53突变呈正相关。本研究强调了APOBEC3B在GC中的临床意义，并为对GC患者进行个体化治疗分层提供了依据。 |
|
|
