全基因组测序的出现,彻底改变了游戏规则,主要是因为全基因组测序可以让人们更准确的查明感染源。该技术真的彻底改变了鉴定科学。类似于犯罪性节目中的法医鉴定,通过提取沙门氏菌感染性患者的 DNA,并确认能否在人们摄取的食物中分离出这种菌株?然后到农场中进行采样,确认是否分布着同种类型的沙门氏菌?或者是否可能是在食物供应链的某个环节被引入?这些问题都有助于更精确定位感染源。
全基因组测序也有助于我们更好地了解这些病原体。例如,我们知道了整个基因组,因此我们可以鉴定出哪些基因可以使细菌具有毒性。
通常情况下,食源性沙门氏菌和弯曲杆菌不会使成年鸡生病。所以需要探究的关键问题之一是:是什么让沙门氏菌成为人类的病原体?