【原】了不起的NCBI Blast

序列比对（Sequence Alignment）是指比较两个或两个以上序列的相似性。

最常用、最知名的工具就是NCBI的Blast了 （https://blast.ncbi.nlm./Blast.cgi）

但是受限于网速，比对常常失败，而且一般也就比对一到两条序列，序列多了，网页就崩了，使用者常常崩溃。

虽然有Linux版本的blast功能更为强大，但是也不是每个人都能熟练操作命令行啊。服务器也不是说有就有的啊。

所以，小编一直想自己搭个在线版的blast比对工具。

所以，搭好了，如图所示。

这个工具可以做什么呢？

你可以用它来做序列的在线NR库比对。

—NR库是目前公认的最全最全的核酸库了，所有物种，别管是人的、动物的、细菌的、真菌的都在里面，你无需选择挑选。使用简单，鼠标点点文件上传上去就可以用了。

你可以用它做多条序列的NR库比对。

—你的输入文件可以是fasta或fq格式的多条序列，别管是10条，20条，还是100条序列统统支持，你再不用一条条的去搜索了。当然由于系统资源也有上限，不过日常工作也足够了。

你可以用它做多条序列的NR库比对，并注释出该序列的物种来源。

它的缺点是？还是太慢，一个任务大约1小时。

尽管平台支持离线运算和任务保留，但是还是需要使用者耐心等待。

所以，不做不知道，了不起的NCBI，能把blast支持到全世界这么多人使用，还这么快，真不容易，越来越佩服了。

所以，目前先这样吧，以后笔者再慢慢优化

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