【原】10X单细胞RNA-seq技术

    10X Chromium单细胞基因表达解决方案提供了一个全面且可扩展的解决方案，能够对数百个至数万个细胞进行细胞鉴定和基因表达分析。10X Chromium能够从每个细胞中检测到更多的独特转录本，有了Feature Barcoding技术，还能从每一个细胞中获得更完整的分子结果，从而鉴定CRISPR介导的细胞特异性扰动，或在同一细胞中同时测定基因表达和细胞表面蛋白表达，并在其他更多的细胞特征类型上更是有着几乎无限可能。

超越传统的基因表达分析，提升到在单细胞的基础上鉴定细胞群体、细胞类型、细胞状态等。从评估肿瘤异质性和干细胞组成，到剖析神经元群体，Chromium单细胞基因表达解决方案带来的技术进步以及一体化的软件工具，能够从单细胞中生成高复杂度的文库，从而实现在多种类型的样品中获得最大量的信息。10X Chromium能应用到如下这些方向。

• 鉴定和描绘罕见的细胞类型

• 分析和了解细胞异质性以及它们对生物系统的贡献

• 利用单细胞RNA-seq开展细胞表型分析，鉴定新的靶点、生物标志物、细胞类型和状态，而无需预先选择靶点

• 评估同一细胞中的mRNA和细胞表面蛋白表达

• 对数万个细胞同时开展高通量、高分辨率的功能性遗传筛选

• 全面评估单独的CRISPR扰动后的基因表达表型

    10X Chromium起源自Drop-Seq技术， 横向孔道逐个导入凝胶微珠Gel beads，第一个纵向道输入细胞。当凝胶微珠和细胞碰撞会被吸附在微珠上，然后通过微流控技术运送到第二个纵向通道（“油管”）。这时就会形成一个个的油滴GEMs（一个油滴包含一个凝胶微珠和一个单细胞），然后收集在EP管中。每一个凝胶微珠都布满了带有不同Barcode和UMI的oligo，oligo的末尾是PolyT，这样就形成了像“刺猬”一样的捕获抓手。随后细胞裂解，这些抓手通过PolyT与mRNA3'端的 poly(A) 碱基互补配对，从而抓取mRNA,构建转录文库。10X Chromium可以在8分钟内完成100~80,000个细胞的捕获。

下面这个视频中有具体的原理和过程介绍

更多关于10X genomics的介绍可以戳这里10x Genomics