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误差线怎么画,写不写代码as you like

 生信交流平台 2021-12-29

    大家看文献,或者自己做文章的时候应该都接触过误差线。误差线是通常用于统计或数据科学,用来显示潜在的误差或相对于系列中每个数据的不确定程度。误差线可以用标准差标准误差,一般用标准差(standard deviation)。

样本标准差的计算公式是,n是样本的个数

标准误的计算公式是

下面来举个实际的例子,比如说我们手上有4个男性的身高和4个女性的身高。如下表所示

我们先来看无代码版画误差线,需要用到Excel

1)首先我们来计算均值,在Excel里面计算均值使用average函数

2)计算标准差,在Excel里面计算标准差用stdev函数

3)计算标准误,根据前面的公式计算标准误只需要将标准差除以根号n就可以了,sqrt函数是计算平方根的函数。

3)画柱形图

添加误差线

指定误差线的值,这里以标准差为例,正错误值和负错误值都选择E4:F4

这样就能得到下面这张图了,如果只想上方有误差线,在方向的地方选择正偏差就可以了。也可以根据标准误来画误差线。留给大家自己练习吧!

下来我们来用R代码画误差线

1)读入数据

这个数据存放在height.txt文件中

a=read.table("height.txt",header=T,sep="\t")

2)计算均值,方差和标准误

#计算均值ave=apply(a,2,mean)#计算标准差std=apply(a,2,sd)#计算标准误se=apply(a,2,function(x){sd(x)/sqrt(length(x))})

3)画图

#画柱形图x<-barplot(ave,xlim=c(0,1),width=0.1,space=0.8,ylim=c(0,200),col="lightblue")#画误差线arrows(x0=x,y0=ave+std,x1=x,y1=ave-std, #如果只画上误差线,这里改成y1=aveangle=90,code=3,length=0.04,lwd=0.4)

也可以根据标准误来画误差线。留给大家自己练习吧!

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