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微生物：原核生物（包括真细菌和古生菌），真核微生物和非细胞微生物。
原核生物：即广义的细菌，指一大类细胞核无核膜包裹，只存在称作核区的裸露的DNA的原始单细胞生物，包括真细菌和古生菌两打类群。根据外表特征，分为六种类型：细菌（狭义）放线菌，蓝细菌，支原体，立克次氏体和衣原体。
细菌：是一类细胞细短，结构简短，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性较强的原核生物。
细胞壁：是位于细胞最外的一层厚实，坚韧的外被，主要成分为肽聚糖，具有固定细胞外形和保护细胞不受损伤等多种生理功能。主要功能 ：固定细胞外形和提高机械强度，使其免受渗透压等外力的损伤；为细胞的生长，分裂和鞭毛运动所需；阻拦大分子有害物质（某些抗生素和水解酶）进入细胞；赋予细菌特定的抗原性以及对抗生素和噬菌体的敏感性。
肽聚糖：又称粘肽，胞壁质或粘质复合物，是真细菌细胞壁中的特有成分。由肽和聚糖两部分组成，，肽包括四肽尾和肽桥两种，而聚糖由N-乙酰葡糖按和N-乙酰胞壁酸。
磷壁酸：是结合在G﹢细菌细胞壁上的一种酸性多糖，主要成分为甘油磷酸或核糖醇磷酸。有壁磷壁酸和膜磷壁酸。
外膜：是G﹣细菌细胞壁所特有的结构，它位于壁的最外层，化学成分为脂多糖，磷脂和若干种外膜蛋白。脂多糖由类脂A，核心多糖和O-特异侧链3部分组成。
古生菌：又称古细菌或古菌，是一个在进化途径上很早就与真细菌和真核生物相互独立的生物类群，主要包括一些独特生态类型的原核生物，如：产甲烷菌及大多数嗜极菌，包括极端嗜盐菌，极端嗜热菌。
假肽聚糖：多糖骨架由N-乙酰葡胺和N-乙酰塔罗糖胺糖醛酸以β-1，3-糖苷键交替连接而成。
放线菌：是一类主要呈菌丝状生长和以孢子繁殖的陆生性较强的原核生物。70%的抗生素。抗癌剂，酶抑制剂，抗寄生虫剂，免疫抑制剂和农用杀虫剂等。在甾体转化，石油脱蜡和污水处理中也有重要应用。链霉菌属于放线菌。基内菌丝：不断伸长，分支并以放射状向基质表面和内层扩展，形成大量色浅，较细的具有吸收营养和排泄代谢废物功能，又称基质菌丝，营养菌丝或一级菌丝。气生菌丝：向空间方向分化出的颜色较深，直径较粗的分支菌丝，或二级菌丝。
蓝细菌：旧名蓝藻或蓝绿藻，是一类进化历史悠久，革兰氏染色阴性，无鞭毛，含叶绿素a（但不形成叶绿体），能进行产氧性光合作用的大型原核生物。有“先锋生物”之美称。“螺旋藻”赤潮的主体。
支原体：是一类无细胞壁，介于独立生活和细胞内寄生生活间的最小型原核生物。称侵染植物的支原体为类支原体或植原体。特点：细胞很小；细胞膜含甾醇，比其他原核生物更坚韧；无细胞壁，故呈G﹣且形态易变，对渗透压较敏感，对抑制细胞壁合成的抗生素不敏感；菌落小；在固体培养基表面呈“油煎蛋装”；以二分裂和出芽等方式繁殖；能在含血清，酵母膏和甾醇等营养丰富的培养基上生长；多数能以糖类做能源，能在有氧或无氧条件下进行氧化型或发酵型产能代谢。
立克次氏体：是一类专性寄生于真核细胞内的G﹣原核生物。与支原体的区别是有细胞壁和不能独立生活；与衣原体的区别是细胞较大，无滤过性和存在产能代谢系统。特点：细胞较大，细胞形态多样；有细胞壁；除少数外，均在真核细胞内营专性寄生，宿主为虱，等节肢动物和人，鼠等脊椎动物；以二分裂方式为主；存在不完整的产能代谢途径，不能利用葡萄糖或有机酸，只能利用谷氨酸和谷氨酰胺产能；对四环素和青霉素等抗生素敏感；对热敏感；
衣原体：是一类在真核细胞内营专性能量寄生的小型G﹣原核生物。特点：有细胞构造；细胞内同时含有RNA和DNA两种核酸；有细胞壁；有核糖体；缺乏产生能量的酶系，须严格细胞内寄生；以二分裂方式繁殖；对抑制细菌的抗生素和药物敏感；
真核生物：是一大类细胞核具有核膜，能进行有丝分裂，细胞质中存在线粒体或同时存在叶绿体等多种细胞器的生物。真菌，显微藻类和原生动物等是属于真核生物类的微生物，故称真核微生物类。真核微生物主要包括菌物界中的真菌，粘菌，假菌，植物界中的显微藻类和动物界中的原生动物。
菌物界：是指与动物界，植物界相并列的一大群无叶绿素，依靠细胞表面吸收有机养料，细胞壁一般含有几丁质的真核微生物。包括真菌，粘菌和假菌三类。真菌的特点：无叶绿素，不能进行光合作用；一般具有发达的菌丝体；细胞壁多数含几丁质；营养方式为异养吸收型；以产生大量无性和有性孢子的方式进行繁殖；陆生性较强。真菌细胞壁的主要成分是多糖，另有少量的蛋白质和脂类。多糖构成了细胞壁中有形的微显微和无定形基质的成分。低等真菌的细胞壁成分以纤维素为主，酵母菌以葡聚糖为主，高等陆生真菌以几丁质为主。同一真菌的细胞壁成分有明显不同。
细胞骨架：是由微管，肌动蛋白丝（微丝）和中间丝3种蛋白质纤维构成的细胞骨架。具有支持运输和运动功能。
膜边体：又称须边体或质膜外泡，为许多真菌所特有。是一种位于菌丝细胞周围的质膜与细胞壁间，由单层膜包裹的细胞器。
几丁质酶体：又称壳体，一种活跃于各种菌丝体顶端细胞中的微小囊泡，内含几丁质合成酶，可把其中所含的酶运送到菌丝顶端的细胞壁表面，使该处不断合成几丁质微纤丝。
氢化酶体：通常位于鞭毛基体附近，为其运动提高能量，只存在于厌氧性的原生动物和近年才发现的厌氧性真菌。
酵母菌 特点：个体一般以单细胞状态存在；多数营出芽繁殖；能发酵糖类产能；细胞壁常含甘露聚糖；常生活在含糖量较高。酸度较大的水生环境中。
构造：细胞壁为三明治状—外层为甘露聚糖内层为葡聚糖，中间为蛋白质葡聚糖是赋予细胞壁以机械强度的主要成分。其细胞壁可用蜗牛消化酶水解。细胞膜上含维生素D的前体-麦角甾醇。细胞核，酵母菌线粒体和“2μm质粒”及酵母菌线状质粒中含DNA。2μm质粒为一个闭合环状超螺旋DNA分子。繁殖方式有无性繁殖和有性繁殖。无性繁殖方式有三种。（1）芽殖，裂殖和产生无性孢子。
病毒 无产能酶系，无蛋白质和核酸合成酶酶系。对抗生素不敏感但对干扰素敏感。对称机制有螺旋对称，二十面体对称和复合对称。（1）螺旋对称-烟草花叶病毒TMV（2）二十面体对称-腺病毒（3）复合对称—T偶数噬菌体T2T4T6 动物病毒以线状的dsDNA和ssRNA为多，植物病毒以ssRNA为主，噬菌体以现状的dsDNA为主。四类病毒：（1）原核生物的病毒—噬菌体 有噬细菌体 ，噬放线菌体，噬蓝细菌体。
效价 表示每毫升式样中所含有的具侵染性的噬菌体粒子数，又称噬菌斑形成单位数或感染中心数。
一步生长曲线定量描述烈性噬菌体生长规律的实验曲线。
温和噬菌体 侵入相应宿主细胞后，由于前者的基因组整合到后者的基因组上，并随后者的复制而进行同步复制，这种温和噬菌体的侵入并不引起宿主细胞裂解，此即称溶源性或溶源现象。能引起溶源性的噬菌体即称温和噬菌体。其宿主就称溶源菌。温和噬菌体的存在形式有三种：游离态，指成熟后被释放并具有侵染性的游离噬菌体粒子；整合态，指已整合到宿主基因组上的前噬菌体状态；营养态，指前噬菌体经外界理化因子诱导后，脱离宿主核基因组而处于积极复制和合成，装配的状态。例子—λ噬菌体。
类病毒 是一类只含RNA一种成分，转性寄生在活细胞内的分子病原体。目前只在植物体中发现，所含的核酸为裸露的环状ssRNA。
拟病毒 又称类类病毒，壳内类病毒或病毒卫星，是指一类包裹在真病毒粒中的有缺陷的类病毒。一般仅由裸露的RNA或DNA所组成。被拟病毒“寄生”的真病毒又称辅助病毒。
阮病毒 是一类不含核酸的传染性蛋白质分子。与真病毒的主要区别：1 呈淀粉样颗粒状2 无免疫原性 3 无核酸成分 4 由宿主细胞内的基因编码 5 抗逆性强
碳源 一切能满足微生物生长繁殖所需碳元素的营养物，称为碳源。异养微生物在元素水平上的最适碳源是“CHO”型，其中的糖类应用最广泛，其次是有机酸类，醇类和脂类。糖类中，单糖优于双糖和多糖，己糖优于戊糖，葡萄糖，果糖优于甘露糖，半乳糖；在多糖中，淀粉优于纤维素或几丁质等纯多糖，纯多糖优于琼脂等杂多糖。
除原生动物外，其他微生物通过单纯扩散，促进扩散，主动运输和基团移位吸收营养物质。
单纯扩散 又称被动运输，只疏水型双分子层细胞膜（包括孔蛋白在内）在无载体蛋白的参与下，单纯依靠物理扩散的方式让许多小分子，非电离分子尤其是亲水性小分子被动通过的一种物质运送方式。通过这种方式运送的物质主要是O2,,CO2,乙醇和某些氨基酸分子。
促进扩散 指溶质在运送过程中，必须借助存在于细胞膜上的底物特异载体蛋白的协助，但步消耗能量的一类扩散性运送方式。载体蛋白有时称作渗透酶，移位酶或移位蛋白，一般通过诱导产生，它借助自身构象的变化，在不耗能的条件下可加速把膜外高浓度的溶质扩散到膜内，直至膜内外该溶质的浓度相等为止。
主动运输 指一类须提供能量（包括ATP，质子动势或离子泵等）并通过细胞膜上特异性载体蛋白构想的变化，而使膜外环境中低浓度的溶质运入膜内的一种运送方式。
基团移位 指一类既需要特异性载体蛋白的参与，又需耗能的一种物质运送方式。其特点是溶质在运送前后还会发生分子结构的变化。主要用于运送各种糖类，核苷酸，丁酸和腺嘌呤等物质。靠磷酸转移酶系统即磷酸烯醇式丙酮酸-己糖磷酸转移酶系统进行。
pH的内源调节 由于微生物的生长，代谢过程中会产生引起培养基的pH改变的代谢产物，如步及时调节，就会抑制甚至杀死自身，因而在设计此类培养基时，就要考虑培养基成分对pH的调节能力，这种通过培养基内内在成分所起的调节作用，称pH的内源调节。
渗透压 是某水溶液中一个可用压力来量度的物化指标。它表示两种不同浓度的溶液间若被一个半透性薄膜隔开时，稀溶液中的水分子会因水势的推动而透过薄膜流向浓溶液，直至浓溶液所产生的机械压力足以使两边水分子的进出达到平衡为止，这时由浓溶液中的溶质所产生的机械压力，既为它的渗透压值。
水活度 表示在天然或人为环境中，微生物可实际利用的自由水或游离水的含量。其定量含义为：在同温同压下，某溶液的蒸汽压与纯水蒸汽压之比。
根据递氢特点尤其是受氢性质的不同，可把生物氧化分为呼吸，无氧呼吸和发酵3中类型。
呼吸 又称好养呼吸，是一种最普遍有最重要的生物氧化或产能方式，特点是底物按常规方式脱氢后，脱下的氢经完整的呼吸链又称电子传递链传递，最终被外源分子氧接受，产生了水并释放出ATP形式的能量。
氧化磷酸化 又称电子传递磷酸化，是指呼吸链的递氢和受氢过程与磷酸化反应相偶联并产生ATP的作用。
无氧呼吸 又称厌氧呼吸，指一类呼吸链末端的氢受体为外源无机氧化物的生物氧化。
发酵 指在无氧等外源氢受体的条件下，底物脱氢后所产生的还原力[H]未经呼吸链传递而直接交某一内源性中间代谢产物接受，以实现底物水平磷酸化产能的一类生物氧化作用。
生物固氮 是指大气中的分子通过微生物固氮酶的催化而还原成氮的过程，生物界中只有原核生物才具有固氮能力。
生长曲线 定量描述一体培养基中微生物群体生长规律的试验曲线。
同步生长 通过同步培养的手段而使细胞群体中各个体处于分裂步调一致的生长状态，称同步生长。
接种龄 指接种物或种子的生长年龄，亦即它生长到生长曲线上哪一阶段时用来做种子的。
连续培养 由呈开放培养，是相对于绘制典型生长曲线时所采用的那种单批培养或密闭培养而言的。
生长温度三基点 包括最低生长温度，最适生长温度和最高生长温度。
最适生长温度 涵义为某菌分裂时代最短或生长速率最高时的培养温度。
灭菌 采用强烈的理化因素使任何物体内外部的一切微生物永远丧失其生长繁殖能力的措施，分为杀菌和溶菌。杀菌指菌体已死，但形体尚存；后者指菌体被杀死之后，细胞因发生自溶，裂解等而消失的现象。
消毒 仅杀死物体表面或内部一部分对人体或动植物有害的病原菌。
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