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迄今为止，在大规模集约化养殖生产中，大都使用硝化细菌来净化水质。因为在集约化的水产养殖系统中，经过长期的大量积累，水生生物排泄物等有机污染物甚至动物的尸体较多，在异养性细菌的分解作用下，其中的蛋白质及核酸会慢慢分解，产生大量的氨氮等对水产养殖动物有毒有害物质。 氨在亚硝化细菌或光合细菌作用下转化为亚硝酸盐，亚硝酸与一些金属离子结合形成亚硝酸盐；而亚硝酸盐有可和胺等物质结合，形成具有强烈致癌作用的亚硝酸胺。因此，亚硝酸盐常与氨氮相提并论。由于亚硝酸盐长期蓄积，致使养殖水生动物中毒，导致鱼、虾等抗病能力下降而受到各种病原体的侵袭。但亚硝酸盐在硝化细菌的作用下，可转化为硝酸厚，很容易形成硝酸盐，从而成为可以被植物吸收利用的营养物质。 养殖池塘中的氨氮原本很适合于硝化细菌的生长，但因养殖池中存在大量的异养菌，受异养菌的排斥作用影响，适合硝化细菌栖息的地方相对于自然环境而言显然少得多，因此，没有足够数量的硝化细菌来消费过来的亚硝酸盐，就是问题所在。
一、硝化细菌及其生物学 1、硝化细菌 硝化细菌是指利用氨或亚硝酸盐作为主要生存能源，以及利用二氧化碳作为主要碳源的一类细菌。硝化细菌是古老的细菌群之一，其分布广泛，土壤、海水、淡水及污水处理系统中都有存在，但在一般环境少有出现，因为其分布会受到很多环境因素的限制，入氨源、温度、氧气浓度、渗透压、酸碱度和盐度等 硝化细菌分为硝化细菌和亚硝化细菌。亚硝化细菌的主要功能是将氨氮转化为亚硝酸盐；而硝化细菌则主要功能是将亚硝酸盐转化为硝酸盐。氨氮和亚硝酸盐都是水产养殖系统中产生的有毒物质，且亚硝酸盐还是强致癌物质。 由于亚硝化细菌的生长速度较快，且光合细菌也具有降解氨氮的作用，因此，现代水产养殖已能成功的将氨氮控制在较低水平上。而对于亚硝酸盐，由于自然界中的硝化细菌生长较慢，且还没有发现其他可替代的任何微生物，所以养殖过程中产生的亚硝酸盐就成为阻碍养殖业发展的关键因素。 2、硝化细菌制剂的生物学特性 生物的生长和繁殖除需要可用于构建自身细胞成分的基本物质外，也需获得能量。硝化细菌是一种化能自养菌，是利用无机物质获得能量的。硝化细菌利用亚硝态氮获得合成反应所需的化学能量，在体内制造糖类；而制造糖类所需的时间相当得长，不像其他异养性细菌从有机物中直接分解及摄取所需要的糖类，因此，硝化细菌的生长和繁殖速度远比一般异养性细菌慢，在自然条件下，硝化和脱氢效果不能满足正常养殖的需要。温度、酸碱度和水体中的溶解氧浓度对硝化细菌的生长均有重要影响。 硝化细菌形态较小，接种到肉汤培养基上不能正常生长，是严格的自养型微生物，是以氧化无机物产生的化学能为能源，并利用外来的能量，以二氧化碳或者碳酸盐为碳源合成细菌本身的有机物，能直接分解和利用亚硝酸盐。其主要特征是自养性，生长速度低，好氧性，依附性和产酸性等。硝化细菌是生物脱氮过程中起主要作用的微生物，水体中硝化细菌数量直接影响到硝化效果和生物脱氮反应效率，硝化细菌制剂的浓度与硝化率成正比。 二、硝化细菌的作用机理 1、氮循环与循环过程 （1）氮循环 氮循环是指氮在有机体与环境之间的循环，是一个复杂的反应过程，主要是指有机氮与无机氮之间的相互转换的过程。 （2）循环过程 氮循环的基本过程为：含有氮有机物→氨氮→亚硝酸盐→硝酸盐 上述过程也能逆转或反向进行称为反硝化作用。该过程能将一部分硝酸盐还原为氨，一部分硝酸盐分解成氮气而进入大气中。这个循环过程中的中间产物—氨氮、亚硝酸盐是有毒有害物质，而硝酸盐是无毒无害的且硝酸盐能被动植物及藻类加以吸收利用。 2、氮循环过程对于水产养殖业的意义 了解和掌握了氮循环过程，就可以利用自然界所固有的规律，降低水产养殖水体中所产生的氨氮和亚硝酸盐含量，改善水体，减少或降低氨氮及亚硝酸盐对水产养殖动物的危害，确保养殖生产安全。硝化细菌制剂就是利用这一原理，通过消耗细菌的降解氨氮和亚硝酸盐作用，将亚硝酸盐等转化成硝酸盐为目标而制备的一类产品。
3、 作用机理 硝化细菌的硝化作用有时特称为硝酸化作用，因为它能产生如下反应： NO-2+1/2O2→NO3-+17.8Kcal.mol-1 上述反应中，氨由正三价氧化为正五价，并产生17.8千卡每摩尔的热量。这些热量用于形成ATP并储存其中，从而使硝化细菌可以同化二氧化碳所需的能量。硝化细菌制剂利用这一能量有机物，其反应为： 6CO2+6H2O→C6H12O6+6O2 这种由硝化细菌制剂完成的生物氧化作用称为自养性硝化作用，即硝化细菌在好氧条件下，利用其化学能自养的生长特性，将亚硝酸盐氧化成硝酸盐，并从中获得赖以生存的化学能，用于固定二氧化碳来满足其对碳的需求。
三、硝化细菌施用注意事项 由于硝化细菌的生物学特性与其他细菌有所不同，使用时不需要经过活化处理，不需要用葡萄糖、红糖等来扩大培养，反之会使硝化细菌失活，因此，使用时只要简单的用池塘水溶解后全池泼洒即可。 因硝化细菌的特点是繁殖较慢，20多小时才能繁殖一代，不像芽孢杆菌那样2分钟就能繁殖一代，所以施用硝化细菌后，一般情况下需要4-5天后才能发挥明显的效果，因此提前施用时间久石非常重要，为更好的发挥硝化细菌的作用，在实际应用中，若芽孢杆菌和光合细菌一起施用时，硝化细菌应提前几天施用，避免繁殖速度慢而被其他活菌抑制生长和繁殖。 硝化细菌不可与化学增氧剂入过碳酸钙或过氧化钙同时使用，因这些氧化剂在水体中放出氧化能力较强的氧原子会杀死硝化细菌，所以，最好是在施用氧化剂1天后再施用硝化细菌。 由于硝化细菌是吸附在有机物上，在高位池中采用的中间排污，会排走大量的硝化细菌，特别是硝化细菌刚投放的前几天，硝化细菌的繁殖尚未进入高峰期，这时排污会使硝化作用不明显。因此，在高位池中，最好使用硝化细菌4-5天内基本不排污或少排污。在施用硝化细菌时，如结合使用质量好的沸石粉同时泼洒，使硝化细菌能够快速的沉入池塘底部而不易被排走，效果会更佳。 养殖池塘内的酸碱度和溶解氧含量与硝化细菌的使用效果有直接的关系。硝化细菌对PH值的适用范围为5~10，但在低于7或高于8.5的水体中，硝化细菌的繁殖会受到一定的影响，最适宜的pH值范围是7.8~8.2，同时，硝化细菌在将氨氮转化为亚硝酸盐的过程中，是一个消耗氧的过程，但需氧量很少，在使用硝化细菌的水体中，溶氧只要不低于2mg/l即可。
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