 MRD（微小残留病灶）的概念最早在白血病诊疗中提出，是指白血病诱导化疗完全缓解（CR）后或骨髓移植治疗后，在体内残留少量白血病细胞的情况，用于预测复发风险和指导后续治疗。 近年来，国内外在实体肿瘤中基于ctDNA的MRD评估的临床数据和证据越来越多，开启了实体肿瘤MRD（分子残留病灶）检测的热潮。实体瘤ctDNA-MRD检测的技术流派主要分为两大类： 1）Tumor-informed assays（肿瘤知情分析） 也可以称为Tumor-Bespoke assays，即先对原发肿瘤组织进行测序以鉴定患者的特异基因组变异图谱，然后定制多重PCR-NGS MRD panel（或固定panel，如WGS）进行个性化的ctDNA检测分析。 2）Tumor-uninformed assays（肿瘤不知情分析） 也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即无需原发肿瘤组织，仅依赖于一组预先选定引物/探针设计的与癌症类型相关的固定panel进行ctDNA检测分析，常在检测ctDNA突变的同时，辅以ctDNA甲基化或片段组学等多组学方法。
▲ 实体肿瘤ctDNA-MRD检测的两种技术流派对比 实体瘤ctDNA-MRD赛道如此火热，国内肿瘤基因检测公司的MRD布局如何？近日召开的广州结直肠癌高峰论坛暨第二十一届广东省大肠癌学术会议-结直肠癌MRD专场，给我们披露了部分信息。
① 鹍远基因：Tumor-agnostic assays策略；ColonAiQ：CRC MRD固定化检测产品，设计思路是全基因组水平筛选出1000多个CRC高度相关的ctDNA甲基化靶点，然后细筛几十个表现非常好的ctDNA甲基化靶点，最终用多重PCR方法定位表现非常突出的6个ctDNA甲基化靶点进行检测。 ② 至本医疗：Tumor-informed assays策略；至美 OriMIRACLE S：多癌种MRD检测产品，设计思路是优先肿瘤组织WES测序（其中，578基因外显子及部分基因内含子区域探针增强设计，保证用药指导），然后筛选数十个位点定制多重PCR-NGS MRD panel进行个性化的ctDNA检测分析。测序深度100,000X。 ③ 世和基因：Tumor-agnostic assays策略；单癌种固定化MRD检测产品（不同癌种基因数不一样），设计思路是针对不同癌种中国人群数据（结合TCGA等数据）预先设计单癌种热点变异的固定化MRD panel，并直接进行血液ctDNA检测，MRD分析的时候会参考基线肿瘤组织检测（NGS大panel检测）出的突变情况进行判定（非完全Tumor-agnostic assays策略）。测序深度30,000X。未来会考虑在ctDNA突变检测的同时，添加cfDNA片段组学进来分析的MRD开发策略。 ④ 燃石医学：Tumor-informed assays策略；朗微（brPROPHET）：多癌种MRD检测产品，设计思路是优先肿瘤组织WES测序（其中，部分基因外显子及21基因内含子区域探针增强设计，保证用药指导），然后筛选50个位点定制多重PCR-NGS MRD panel进行个性化的ctDNA检测分析。测序深度100,000X。目前正同步开发Tumor-agnostic assays策略的MRD产品Pharos（ctDNA突变+ctDNA甲基化）。 ⑤ 华大基因：Tumor-informed assays策略；华见微（引进Signatera MRD检测技术）：多癌种MRD检测产品，设计思路是优先肿瘤组织WES测序（无增强区域设计），然后筛选16个位点定制多重PCR-NGS MRD panel进行个性化的ctDNA检测分析。测序深度100,000X。 ⑥ 臻和科技：Tumor-informed assays策略；MinerVa：多癌种固定化MRD检测产品（平台，固定769基因），设计思路是针对既往基因组学数据开发固定化MRD panel（769基因），并优先对肿瘤组织进行测序，然后持续采用769基因panel进行个性化的ctDNA检测分析。测序深度≥30,000X。未来会考虑优先使用组织WES检测再做定制化MRD panel的开发策略。 ⑦ 艾德生物：同时布局Tumor-informed assays和Tumor-agnostic assays两种策略；两种策略的ctDNA-MRD产品都在同步开发中。未来可能会重点聚焦Tumor-informed assays策略的MRD产品开发与应用。 ⑧ 桐树基因：Tumor-agnostic assays策略；多癌种固定化MRD检测产品（固定600基因），设计思路是针对既往基因组学数据开发固定化MRD panel（600基因），并直接进行血液ctDNA检测，MRD分析的时候可能会参考基线肿瘤组织检测出的突变情况进行判定（如果有组织检测情况下）。测序深度30,000X~50,000X。未来可能会考虑优先使用组织WES检测再做定制化MRD panel的开发策略。 ⑨ 吉因加科技：Tumor-agnostic assays策略；多癌种固定化MRD检测产品（固定338基因），设计思路是针对既往基因组学数据开发固定化MRD panel（338基因），并直接进行血液ctDNA检测，MRD分析的时候会参考基线肿瘤组织检测（1021基因panel检测）出的突变情况进行判定（非完全Tumor-agnostic assays策略）。测序深度30,000X~40,000X。未来可能会考虑优先使用组织WES检测再做定制化MRD panel的开发策略。 ▼ 鹍远，至本，世和，燃石，华大演讲内容 鹍远（刘蕊 博士）：ctDNA用于MRD研究（ColonAiQ） 至本（李锋 博士）：至本技术流眼中的MRD 世和（洪晓愉 博士）：世和基因ctDNA MRD技术分享 燃石（张之宏 博士）：朗微 MRD技术分享及临床研究进展 华大（许晶 博士）：Signatera/华见微MRD检测技术临床应用进展 鹍远（刘蕊 博士）：ctDNA用于MRD研究（ColonAiQ）
至本（李锋 博士）：至本技术流眼中的MRD
世和（洪晓愉 博士）：世和基因ctDNA MRD技术分享
燃石（张之宏 博士）：朗微 MRD技术分享及临床研究进展
华大（许晶 博士）： Signatera/华见微MRD检测技术临床应用进展
参考资料： 1.广州结直肠癌高峰论坛暨第二十一届广东省大肠癌学术会议-结直肠癌MRD专场  |
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