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关于日本人祖先来源于中国的说法，在很长一段时间里都相当盛行，其中最具代表性的当属徐福说和秦始皇后裔说，无一例外都指出日本人的先祖来源于中国，而且都是在我国秦汉时期东渡过去的中国人。徐福说盛行，是因为徐福东渡在历史上却有其事，而且徐福出海最终并没有回来，最大的可能就是来到了今天的日本群岛定居了下来。徐福出海是为秦始皇寻找仙山，寻求长生不老药，徐福对嬴政说海外有蓬莱、方藏、银州三座仙山，山上住着仙人，秦始皇就相信了，还搜集了500童男童女陪他一起出海，徐福最后一次乘船出海是公元210年，此后再也没有回来。
日本人认为徐福是到了日本岛上，看见当地土地肥沃、气候适宜，就留在了岛上四代繁衍生息。但随着科技的发展，在专家学者的研究下，通过基因检测技术发现了徐福不是日本人的祖先。消息一出，很多日本民众不接受这个结果，在日本人眼中，徐福是日本历史人物的最高代表，是他们文化和行动的象征，这个国家以其文化为荣，正是因为徐福，日本有着如此悠久的文化历史，但是论日本岛和日本人的起源，我国的典籍记录相当丰富。
山海经上有记载，我国上古时代，中国大陆有多次向东出海的人，搬到海外岛屿，周代文学国内北京也说，国家举着延安倭北倭属烟草，所以日本这个国家一直存在，从新石器时代到公元前时代，日本考古上被称为报纸式文化时期，用石器打肉，居住在数学上，出土了女性土人。由此，可以在徐福到达日本之前做出判断，那里本来就有土著的种族和文化，现在长得和中国人差不多的是日本的大和人，现在是日本人的主要民族，日本人的组成不仅仅是这个种族，还有另外两个种族，他们分别是阿伊努族、琉球族。
阿伊努族人在日本北海道一带，他们的长相和家人截然不同，眉框之间显得格外粗，更像蒙古人种，被伟人和人的民族鄙视，阿伊努人现在只剩下2万多人，就像当年的印第安人一样，虽然是原住民，却濒临灭绝。琉球人是琉球岛的故乡，后来从日本改为冲绳，经过大和人的童话故事，现在琉球人已经和大和人没有太大差别了。通过DNA比较分析，在日本人1%的基因中，和云贵高原中国境内的古人基因非常相似，同时东南亚有着30%以上的基因，50%与藏人基因相似，经过历史学家和地理学家的推测，远古时代有来自中国西南部的人，经过韩半岛来到了中国，另外还有人从印度尼西亚、菲律宾、琉球进入日本，这也是日本人本土文化比较杂的原因，日本血脉之谜已经揭开。
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