生物医药简单来说就是生物技术和医药技术的结合,如生物制药就是把生物工程技术应用到药物制造领域的过程。因为各国对其定义范围不统一,甚至不同人的观点也大相径庭。 伴随着生物医药的快速发展,产生了海量的高通量数据,如何对生物医药数据库有效的查询并利用其数据水平直接反映了研发效率的高低。 下面以药融云生物医药数据库V4.0为例给大家讲解
1、进入数据库
2、点击药品研发
可以看到按药品性质来查询可以搜索 药品名称、研发企业、适应症状;也可以搜索靶点、化学结构式编码、CAS号。
下面以sintilimab为例进行检索:
可以看到sintilimab的基本信息、研发企业、ATC信息、化学数据、上市时间轴、研发章台、全球销售额、其它信息、关联信息反转逆向查询。点击企业名称关联查询如下图:
附:生物化学医药常用数据库 代谢与信号通路类1. KEGG -Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 网址:http://www./ 2. HMDB -The Human Metabolome Database 网址:http://www./ 3. Reactome- A Curated Pathway Database 网址:http://www./ 4. PhosphoSitePlus 网址:http://www./ 5. EcoCyc- BioCyc Database Dollection 网址:http:/// 6. APD -Antimicrobial Peptide Database 网址:http://aps./AP/main.php 7. REBASE-The Restriction Enzyme Database 网址:http://rebase./ 8. PathwayCommons - Search and visualize public biological pathway information 网址:http://www./about/ 9. PID -Patheay Interaction Database 网址:http://pid.nci./ 10. TAIR - The Arabidopsis Information Resource 网址:https://www./ 蛋白质类1. UniProt- The Universal Protein Resource 网址:http://www./ 2. Pfam -Protein Families Database 网址:http://pfam./ 3. Ensembl- Ensembl 网址:http://www./ 4. STRING- Known and Predicted Protein-Protein Iinteractions 网址:http:/// 5. UCSCGenome Browser - University of California,Santa Cruz Genome Browser 网址:http://genome./ 6. NCBI -National Center for Biotechnology Information 网址:http://www.ncbi.nlm./ 7. PROSITE- Database of protein domains,families and functional sites 网址:http://prosite./ 8. BioGRID- Biological General Repository for Interaction Datasets 网址:http:/// 9. InterPro- Protein sequence analysis & classification 网址:http://www./interpro/ 10. PX - ProteomeXchange 网址:http://www./ RNA类1. miRBase- microRNA database 网址:http://www./ 2. Ensembl- Ensembl 网址:http://www./ 3. RDP -Ribosomal Database Project 网址:http://rdp.cme./ 4. UCSCGenomes Browser - University of California,Santa Cruz Genome Browser 网址:http://genome./ 5. NCBI -National Center for Biotechnology Information 网址:http://www.ncbi.nlm./ 6. Rfam -RNA Families 网址:http://rfam./ 7. TRANSFAC- a database on transcription factors and their DNA binding sites 网址:http://www./pub/databases.html 8. FlyBase- Database of Drosophila Genes & Genomes 网址:http:/// 9. RefSeq- Reference Sequence Database 网址:http://www.ncbi.nlm./refseq/ 10. miRTarBase - miRNA Target Database 网址:http://mirtarbase.mbc./ 结构类1. Pfam -Protein Families Database 网址:http://pfam./ 2. ChEMBL 网址:https://www./chembl/ 3. CDD -Conserved Domain Database 网址:http://www.ncbi.nlm./Structure/cdd/cdd.shtml 4. SWISS-MODEL- The SWISS-MODEL Repository 网址:http://swissmodel./repository/ 5. CAZy -Carbohydrate-active Enzymes Database 网址:http://www./ 6. BRENDA- The Comprehensive Enzyme Information System 网址:http://www./ 7. CATH 网址:http://www./ 8. RCSBPDB - RCSB Protein Data Bank 网址:http:/// 9. DisProt- Database of Protein Disorder 网址:http://www./ 10. BMRB - biological magnetic resonance databank 网址:http://www.bmrb./
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