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TRIM28的基本信息

 新用户22511075 2022-06-20 发布于湖北

1. Trim28 是 TIFI 家族成员,具有 N-末端的三重模体结构,且与另一个家族成员共享主要 TIFI 信号序列,一个 HP1 领域,一个 PHD 的 C-末端结构域。 Trim28 这种胚胎发育转录调节因子会控制干细胞的染色质组织,同时也可对干细胞自我更新进行有效控制。

2. Trim28 作为胚胎发育阶段的转录调节因子,可控制 DNA 损伤反应,控制细胞自我更新,同时可控制干细胞染色质组织。同时, Trim28还有多种翻译修饰作用,可调节 Trim28 的基因功能,使其参与到细胞活动的多个方面,从而产生细胞因子和干细胞多能性等等。在分子
生物学研究领域中,基因表达和蛋白表达是非常重要的,在运用生物学相关知识的基础上,可通过表达或基因沉默对一些基因和蛋白的功能性进行研究。由于在各类细胞中, Trim28 很难保持一定的稳定性因此,在对 Trim28 进行研究的过程中建立可诱导 Trim28 稳定表达的
细胞系是非常必要的。

3.Trim28 又称为 KAP1 或 TIF1β,为 TIFI 家族成员,该家族成员主要包括 TIFIα、 IFIβ、 TIFIγ、 TIFIδ。 Trim28 被认定为一种通用的转录共抑制因子,可对干细胞的自我更新、染色质组织以及 DNA损伤反应起到控制性作用,同时可起到多种翻译后的修饰性作用,主要包括对磷酸化和 SUMO 化进行修饰。

4. Trim28(Tripartite motifprotein 28,又名Tif1β或Kap1)作为最新发现的肥胖“开关”基因',也可能在“胎儿程序化”改变过程中起着十分重要的作用。TRIM28是一种转录中介因子,在众多基因转录调控复合体中起桥梁作用,主要功能是以共抑制因子形式发挥特异的转录抑制作用。

5.胎儿程序化:Barker等首次提出了“胎儿程序化”(Fetal Programming)的概念,强调胚
胎时期宫内环境的改变对胎儿生长发育程序的重新设定作用,影响胎儿的身体特性、生理机能、新陈代谢以及出生后的长期健康。也就是说,儿童青少年期及成年后肥胖、代谢性疾病等慢性疾病的发生风险可能早在胎儿时期就已经设定。

6.基因甲基化水平检测:脐血的全血,提取DNA后,送北京京鸿汇盛科技有限公司,检测TRIM38和PPARγ的甲基化水平。

7.含三方基元蛋白 28( TRIM28),又称 KRAB 相关蛋白质 1( KAP1),KRAB-A 相互作用蛋白质 1( KRIP1)或转介因子 1-β( TIF1-β),既是转录中介因子 1( TIF1)家族的成员之一[27],也是含三方基序的蛋白质( TRIM)家族的成员之一[28]

8. TRIM28 最早在 1996 年由费雷德曼团队使用亲和层析法分离出来,它的蛋白分子量约为 110kDa,可以与 KRAB 结构域形成三元复合物,作为多种转录因子的辅助共抑制因子发挥作用,因此又被称为 KAP1[29]。 TIF1 家族由四个成员组 成 ( TRIM24/TIF1-α , TRIM28/TIF1-β/KAP1 , TRIM33/TIF1-γ 和TRIM66/TIF1-δ),该家族是高度保守的 TRIM 家族(一个由 80 多种蛋白质组成的家族,与泛素化有关)的一个亚家族[30],参与核受体( NRs)的反式激活[31],也可根据细胞和信号环境的不同,被趋化到具体细胞,辅助转录进程或妨碍传导信号[32]。此家族所有成员都有一个相似的整体结构,氨基( N)末端包含四个保守的结构域,其中包含( RING 指, B-box 区域和 CC 区域,统称为 RBCC 或 TRIM域),中心是 TSS(色氨酸和苯丙氨酸组成序列),羧基( C)端串联植物同源域( PHD 结构域)和溴结构域(统称 PB 结构域) [33]。 TRIM28 与其他 TIF1 家族成员虽然在结构上有许多相同性,但是成员之间的功能皆有差异。

9.免疫组化结果的判读:切片免疫组化染色评价系统以孙微团队[47]和刘博团队[43]的评价标准为基础,分为两个体系: 1、视野内阳性细胞数量占比, 2、强度。原则完全遵循随机,盲挑 5 个高倍镜视野,在每个视野内计算(染色阳性的细胞/视野内细胞)%,取平均值,其中占比<10%认为是 0 分, 10%~49%认为是 1 分, 50%~74%认为是 2 分, ≥75%认为是 3 分;同时强度也分为 4 度,无明显显色认为是 0 分,浅黄色认为是 1 分,深黄色认为是 2 分,棕黄色认为是 3 分。

(占比 x 强度)为最终计算,总评分范围 0~9分, ≥3 分被认定为进入高表达组。 (见表 5)。

10.TRIM28 是一种大型的多结构域蛋白,它包含 RBCC, TSS 和 PB 等结构域。
几个高度保守的结构域决定了 TRIM28 的基因沉默和转录抑制功能[27,77]

Re27Sushma Iyengar, Farnham Peggy-J.:KAP1 Protein: An Enigmatic Master
Regulator of the Genome[J]. Journal of Biological Chemistry, 2011, 286(
30): 26267-26276.

[77] Jun-You-Michael-Stadler Letizia Venturini. TIF1 gamma, a novel member
of the transcriptional intermediary factor 1 family[J]. Oncogene, 1999, (1
8): 1209-1217.

11.TRIM28参与的疾病:直肠癌、食管鳞状细胞癌、生长发育的各个方面(DNA损伤调节、沉默逆转录病毒的复制、驱动胚胎发育、干细胞重新编程控制等)、乳腺癌、肥胖、胰腺癌等各个方面。



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