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大自然是修补匠，而不是发明家。新序列都是由已经存在的序列的变化而来的，而不是凭空产生的。
在生物基因进化过程中，生物中的遗传基因随着地理和气候环境的不断变化而改变 ,导致了原本相同的生物基因序列在进化演变过程中有着稍微的不同，即存在着片段缺失、插入以及相同序列位置发生了改变等问题，从而在物种之间产生了不同的性状。虽然生物基因序列不同，但是在序列之间依然存在一定的相似性关系，生物学家们通过使用现代计算方法来计算出序列之间的相似性程度，从而了解生物之间 的遗传变异关系。一般来说，如果来自于不同生物的基因序列满足了一定的相似性 ，我们就可以判定两生物可能来自于同一个祖先，即具有同源性。
而同源性是一个重要的生物学概念。同源性同源性是一个重要的生物学概念。如果两个物种具有共同的进化祖先,就认为它们是同源的。同源的物种的中的许多部分是相同的。反过来,如果两个物种有相似的子串,那么通常可以断定它们来自共同的祖先。序列比对算法可用来查找这种类似的子串。计算生物学的一个主要主题就是比较序列并尝试找出两个序列的公共部分。
随着计算机技术的成熟与发展，越来越多的算法被开发出来以解决生物学问题。序列对比的算法研究作为计算机科学与生物学的交叉领域，将生命的问题用计算机技术来解决，这是令人非常着迷的。因此不论你是有着计算机的学科背景，还是像笔者我的生物学背景，亦或是业余的爱好者，我们都可以尝试用自己的知识解决该领域的问题。学科之间的交叉碰撞，思维之间的碰撞产生的反应是非常奇妙的！
接下来会有一系列的文章，用来介绍序列对比的相关算法及知识。学习的主要参考书目为《生物序列分析》科学出版社出版。另外也会参考一些文献资料。届时将会在文章的末尾呈现。
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