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《细胞》第17期论文汇总|橡叶蝶的进化与多样性+TET 蛋白在原肠胚形成过程中的内在和外在作用+线粒体ROS-坏死促进感染易感性

 GCTA 2022-12-12 发布于广东

封面:Kallima属的橡树叶蝴蝶是最著名、最引人注目的仿叶昆虫之一。在这一问题中,Wang等人探索了橡叶蝶的遗传和物种多样性,揭示了喜马拉雅东部的多样性热点是Kallima进化中的一个多样化中心,并且一个单一基因皮层参与控制翅膀多态性。封面图片显示两只橡树叶蝴蝶正在交配,翅膀向后折叠,看起来像褐色的枯叶。该属是一个有魅力的模型,可以帮我们理解生物地理学驱动多样化和自然选择产生复杂的多态性适应。图片来源:Albert Lau。

2022年Cell第17期研究论文汇总

【蚊子体内非经典气味编码】
【黑色素视网膜神经节细胞介导光促进
大脑发育
【橡叶蝶的
进化与多样性
【基于重复的全聚集体影响
基因组结构和核型进化
TET 蛋白在原肠胚形成过程中的内在和外在作用】
【富含PABP/嘌呤的基序触发免疫中
帽非依赖翻译的起始】
【pMHC连接的完全组装的肿瘤特异性T细胞受体的结构】
线粒体ROS通过gasdermin D介导的坏死促进感染易感性】
表观遗传阅读器SP140功能丧失导致克罗恩病,起因是巨噬细胞拓扑异构酶失控】
【噬菌体从
动员编码免疫系统的致病性岛对抗竞争对手中获益】
【天然大肠杆菌作为“底盘”植入宿主可引起持久稳定功能变化】

Non-canonical odor coding in the mosquito
【蚊子体内非经典气味编码】

人类产生一种复杂的混合气味线索,吸引雌性蚊子,这些线索通常是由表达单一受体的嗅觉神经元检测到的。然而,在雌性埃及伊蚊中,许多这些神经元共同表达多种化学感觉受体,直接影响蚊子的行为,并挑战典型的一对一受体神经元组织。人 produce odor that attract 雌性蚊子, and these cues are typically detected by 嗅觉神经元expressing 单一受体. In female 埃及伊蚊, however, many of these neurons co-express multiple 化学感觉受体 directly affecting mosquito behavior and challenging the canonical one-receptor-to-one-neuron organization.


Melanopsin retinal ganglion cells mediate light-promoted brain development
【黑色素视网膜神经节细胞介导光促进大脑发育】

在生命早期,表达黑视素的内在光敏性视网膜神经节细胞被光激活后加快催产素释放神经元来促进皮层突触发生,并确保成年小鼠的适当学习能力。Light sensation by X ensures learning ability by activating, which in turn promotes X.



The evolution and diversification of oakleaf butterflies
【橡叶蝶的进化与多样性】

宏观和微观进化分析表明,生物地理学推动了喜马拉雅山生态系统中橡树叶蝴蝶的多样化,自然选择产生了复杂的多态性适应。Analyses(analysis的复数) reveal that biogeography drove the diversification of 橡树叶蝴蝶 and natural selection produced complex, polymorphic adaptations.


Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution
【基于重复的全聚集体影响基因组结构和核型进化】

虽然大多数真核生物含有单一的区域着丝粒,但一些植物和动物谱系沿着整个染色体长度组装全着丝粒。染色体规模的全中心基因组与喙莎草及其最近的单中心亲属的基于重复的全中心体的组装揭示了受着丝粒组织影响的基因组结构和进化的重要方面。While most 真核生物contain 单一的区域着丝粒, several plant and animal lineages assemble 着丝粒along the entire chromosome length.

The intrinsic and extrinsic effects of TET proteins during gastrulation

【TET 蛋白在原肠胚形成过程中的内在和外在作用】

TET 介导的去甲基化改变基因表达的谱系和时间特异性的方式,但这种改变可以被源自相邻细胞的细胞间信号克服。TET-mediated demethylation alters gene expression in a lineage- and time-specific fashion, but such alterations can be overcome in the presence of inter-cellular signals from neighboring cells.

PABP/purine-rich motif as an initiation module for cap-independent translation in pattern-triggered immunity【富含PABP/嘌呤的基序触发免疫中帽非依赖翻译的起始】

对模式触发免疫(PTI)信号通路的研究揭示了一种促进应激诱导的帽非依赖翻译体重编程的翻译机制。Study unveils a cap-independent translation mechanism for facilitating stress-induced translatome reprogramming. 

In the process of Cap-dependent translation, eIF1 and eIF1A are required to identify the starting password. EIF1 occupies a part of the P site (peptidyl site), with a conservative ring, which can extend into the mRNA channel to detect the pairing of codons. EIF1A occupies a part of site A (aminoacyl site). Its combination makes the base of rRNA decoding site in an open conformation, which weakens the interaction between mRNA and rRNA, thus promoting the scanning of mRNA.

Structure of a fully assembled tumor-specific T cell receptor ligated by pMHC【pMHC连接的完全组装的肿瘤特异性T细胞受体的结构】

结合到肿瘤特异性人类I类pMHC的T细胞受体(TCR)复合物的冷冻EM结构分析表明,连接肽和甾醇脂质对复合物组装的功能影响,并表明TCR信号可能在没有自发结构重排的情况下被触发。


Mitochondrial ROS promotes susceptibility to infection via gasdermin D-mediated necroptosis【线粒体ROS通过gasdermin D介导的坏死促进感染易感性】

激酶Lrrk2中与疾病相关的突变促进了gasdermin D与线粒体膜的联系,从而导致活性氧的释放,向坏死性细胞死亡的转变,以及高炎症病理学。Mutations in Lrrk2 promote association of gasdermin D with mitochondrial membranes, which induces release of reactive oxygen species, a switch toward necroptotic cell death, and hyperinflammatory pathology.


Epigenetic reader SP140 loss of function drives Crohn’s disease due to uncontrolled macrophage topoisomerases【表观遗传阅读器SP140功能丧失导致克罗恩病,起因是巨噬细胞拓扑异构酶失控】

SP140是拓扑异构酶的阻遏物,维持巨噬细胞细胞因子和细菌杀伤功能,预防克罗恩病等炎性疾病。SP140 acts as a repressor of topoisomerases and maintains macrophage cytokine and bacterial killing functions, preventing inflammatory conditions such as Crohn’s disease.


Bacteriophages benefit from mobilizing pathogenicity islands encoding immune systems against competitors【噬菌体从动员编码免疫系统的致病性岛对抗竞争对手中获益】

噬菌体诱导染色体岛(PICI)是高度可移动的遗传元件,不仅在革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌中提供多种防御系统,还可以由辅助噬菌体诱导,以保护辅助噬菌体和细菌宿主免受竞争噬菌体和其他可移动遗传元件的影响。这揭示了细菌、PICI及其辅助噬菌体之间复杂的相互关系,可能广泛影响水平基因转移。

Intestinal transgene delivery with native E. coli chassis allows persistent physiological changes【天然大肠杆菌作为“底盘”植入宿主可引起持久稳定功能变化】

从小鼠粪便中分离的大肠杆菌菌株经过基因工程改造,可长期植入常规小鼠肠道,并对宿主产生长期全身效应,如改善2型糖尿病小鼠模型的胰岛素敏感性


往期回顾:(点击每期任意文字可转到详解内容)

2022年Cell第1期共发表6篇研究论文,内容包括:指纹基因的发现、mRNA疫苗功效、艾滋病的预防、细菌生物膜分段时钟的机制、蛋白质折叠校正结构机制、肺癌免疫逃逸机制。
2022年Cell第2期共发表8篇研究论文,内容涉及DNA非依赖的基因编辑技术,单HIV病毒分析,GSDMB不依赖细胞焦亡调节上皮恢复/修复,乳腺癌浸润性转变与进展性有关,皮层细胞类型和功能发育与视觉有关,腹侧嵴髓小脑束神经元控制哺乳动物运动,利用3D的“最小活细胞”模拟细胞内部基本运作,解析酵母核孔复合体的三维结构。
2022年Cell第3期共发表7篇研究论文,有5篇和疫情直接相关,另外两篇关于是微生物,具体内容包括奥密克戎变异株对抗体介导的中和作用具有高度抗药性,mRNA疫苗增强剂诱导的中和免疫,奥密克戎突变体广泛逃离中和抗体反应,德尔塔变异株接种疫苗后的传播能力,肠道微生物聚糖代谢,补体激活新冠病毒导致过度T细胞毒性,基因组结构预测微生物群落代谢动力学。
2022年Cell第4期共发表7篇研究论文,包括镁并调节CD8+T细胞效应功能,新冠mRNA疫苗有效性的关键是滤泡辅助T细胞,真菌配体的物理性质与抗原免疫原性,人血管紧张素转换酶2(ACE2)受体及其复合结构HIV病毒微结构,哺乳动物中性别典型的社会行为由大脑基因活动的差异决定,泵状光敏感通道蛋白ChRmine通道传导的结构。

2022年Cell第5期共发表9篇研究论文,包括:
胞表面的波动调节早期胚胎谱系分选
转录因子蛋白质相互作用组揭示
心脏病的遗传决定因素
GPR35 响应血清素代谢物5-羟基吲哚乙酸 (5-HIAA)促进
中性粒细胞募集
黏膜真菌
通过17型免疫促进肠道屏障功能和社会行为
新冠
疫苗可诱导针对Omicron变体的强大记忆T细胞免疫效应
SARS-CoV-2
奥密克戎传染性和免疫逃避的结构和功能特征
SARS-CoV-2的突破性感染或会引起强有力、广泛且持久的
机体中和抗体反应
多种早期因素预示着急性2019
冠状病毒疾病后遗症
新一代2019冠状病毒疾病
疫苗的呼吸道黏膜输送可提供强有力的保护,抵抗原始和变异;

2022年Cell第6期共发表9篇研究论文,包括:

局部热疗诱导白色脂肪褐变并治疗肥胖,泡个热水澡也可减肥啊!
合成信号通路可实现细胞群规模调控
TFPI是超毒力分支艰难梭菌毒素B肠道隐窝受体
两种抗体的组合使用有望治疗多种致命的埃博拉病毒物种。
新冠
mRNA疫苗可促进有效抗原特异性生发中心反应
疫苗接种与SARS-CoV-2感染后产生的
抗体不同
大部分个体(但并非所有个体)对 SARS 冠状病毒2型
奥密克戎变异株的T细胞反应仍然存在。
非细胞自主破坏核结构是 COVID-19诱导
嗅觉丧失的潜在原因。
中脑-丘脑-皮层回路重组皮层动力学以启动准备好的运动

2022年Cell第7期共发表7篇研究论文,包括:

果子狸等“野味”病毒多,不能吃。
cAMP纳米畴是不同G蛋白偶联受体
GPCR行使不同功能的关键。
冷冻电镜结构揭示了细菌外膜
蛋白质折叠的多个阶段。
以MHC/HLA-1为受体的新肠球菌成孔毒素(Epxs)。
肠粘膜
唾液酸化调控肠道宿主-菌群生理稳态。
人类乳腺癌中的组织驻留
FOLR2+巨噬细胞与CD8+T细胞浸润相关。
肿瘤反应性抗体非结合性和自身反应性前体演化而来。

2022年Cell第8期共发表9篇研究论文,包括:

为了包装更大的基因组,杆状病毒进化成纺锤形
oskar核糖核蛋白颗粒通过液相-固相转变调控果蝇胚胎发育;
新型聚集体自噬受体CCT2介导固态聚集体的清除;
TMEM106B在多种
神经退行性疾病中的同型纤维化;
肿瘤内的
微生物促进乳腺癌转移定植;
表达LGR5的皮肤成纤维细胞定义硬皮病中一个主要的细胞枢纽;
可吸入双特异性单域抗体,可广泛中和新冠病毒变体;
古基因组揭示了7世纪阿瓦尔族精英的起源和快速跨欧亚大陆迁移;
替代细胞因子激动剂的筛选方法。

2022年Cell第9期共发表10篇研究论文,包括:

【Argonaute蛋白通过一种新机制中和入侵 DNA,增加NAD (P) + 消耗,触发细胞死亡】
合成基因元件的跨物种表达有助发现人类微生物组衍生性的代谢物】
【雄性来源的
非核糖体多肽信息素控制着雌性血吸虫发育
靶向线粒体凋亡增强NK细胞免疫治疗
【Omicron 和 Delta 变异
疫苗对感染的保护作用随着时间的推移而减弱
【猴试验:测试针对奥密克戎变异毒株的疫苗保护】
加强针疫苗增强反应性记忆B细胞诱导的免疫反应】
【增强变异匹配或历史mRNA疫苗对小鼠Omicron感染的保护作用】
【印迹 SARS-CoV-2特异性记忆淋巴细胞定义混合免疫】
【前额叶远程抑制对海马信噪比的自上而下控制】

2022年Cell第10期共发表10篇研究论文,包括:

有袋动物的不完全谱系分类和表型进化】
【GPCR介导β-arrestin激活的单分子精度机制】
大麻与心脏病有关,金雀异黄素可以降低该风险
【静息的癌细胞通过形成免疫抑制生态位来抵抗T细胞的攻击】
【骨髓组织的适应性先天免疫训练是炎症性合并症的基础】
【SARS-CoV-2环状RNA疫苗及其变异体的研究】 
【蛋白酶调控的CAR-T细胞受体可增强安全性和有效性】
人类线粒体DNA中A-到-G的碱基编辑
【DNA纳米阵列技术绘制小鼠器官发生时空转录组图谱
【哺乳动物组织中细胞药物靶点的原位识别

2022年Cell第11期共发表10篇研究论文,包括:

【1.29万年前第一批农民的基因起源
【宿主和病原体能够响应针对脓肿分枝杆菌肺部感染而设计的噬菌体】
【第三剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗对Omicron反应性B细胞记忆的影响】
【一种植物免疫蛋白能够通过挽救microRNA的缺乏来实现广泛的抗肿瘤反应
【谱系追踪揭示了肿瘤的系统动力学、可塑性和进化途径
淋巴结定植诱导肿瘤免疫耐受促进远处转移
【抑制 PAAN/MIF 核酸酶可预防帕金森病中的神经退行性疾病
细胞外基质(ECM)动力学在自发滤泡模式下产生超细胞流动性】
癌症中突变导向的新蛋白相互作用
【人类复发性反转多态性与遗传不稳定性和基因组疾病相关】

2022年Cell第12期共发表10篇研究论文:
【帕金森病蛋白α-突触核蛋白调控mRNA稳定性
【拆除反义寡核苷酸搭起的“路障”可显著提高其在脊髓性肌萎缩症中的疗效】
先天性巨痣消退的局部治疗及黑色素瘤的预防
【破坏自动抑制回路产生“开环杀伤力”以产生
抗逃逸的抗病毒剂
【SARS冠状病毒2型
奥密克戎变异株BA2的病毒学特性
奥密克戎突破性感染后能够增强疫苗保护效果并产生大量反应性抗体
【人类
核外泌体靶向复合物(NEXT) RNA监测的结构机理】
【锌调节的GTPase金属蛋白激活剂1(ZNG1)调节
脊椎动物的锌稳态
XIST缺失损害乳腺干细胞分化,增加乳腺的成瘤性
胶质瘤的进展是由遗传进化和微环境相互作用决定的
2022年Cell第13期共发表11篇研究论文:
【星形胶质细胞和小胶质细胞中胆固醇与基质体通路失调
【骨髓
造血促进多发性硬化症的进展】
【基因编辑
人类造血干细胞的无化疗移植新方法
【新一代
重组蛋白疫苗高效预防Omicron
【新的人类冠状病毒CCOV-HuPn-2018
起源于犬类
【帕金森病风险蛋白TMEM175是
溶酶体中质子激活的质子通道
【非编码7S RNA通过
线粒体RNA聚合酶二聚化抑制转录】
【III-E 型
CRISPR-Cas7-11效应子配合物的结构与工程化】
【BacPROTACs 介导
细菌靶向蛋白质降解
【一系列保守的细菌毒性因子
通过阻断钙信号来抑制干扰素的反应
【植物免疫受体的TIR结构域为介导
细胞死亡的2′ ,3′-cAMP/cGMP合成酶】

2022年Cell第14期共发表11篇研究论文:

【新冠病毒BA.4、BA.5变种可逃避疫苗及免疫系统】
【四种新冠
疫苗诱导的体液和细胞免疫记忆
轻微的新冠感染仍可导致神经细胞和髓鞘失调】
【GABAA受体自身免疫性脑炎的结构机制】
抑制食欲的器官间神经回路】
肠道菌群将橙皮纤维转化为活性代谢物N-甲基-5-羟色胺】
皮肤共生微生物来源的一种气味挥发物促进黄病毒感染宿主吸引蚊虫】
【从
多能干细胞生成人类动脉和静脉细胞突出了尼帕病毒和亨德拉病毒的动脉嗜性】
【胸腺上皮细胞通过谱系相关转录因子清除自身反应性T细胞】
单细胞测序绘制首张全基因组基因型-表型图谱
【小鼠卵母细胞在哺育细胞的帮助下在囊中发育】
【解析未经治疗的
人类黑色素瘤脑转移的生态系统】

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