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中西医的产生与发展过程有着质的不同，这种差异导致了这两种医学的认识论与方法论的根本性差别。中毉理论是从人自身乃至宇宙万物的生命及其能量流动的深刻体验出发的，中毉治病的原理就是调整人身的能量动态使之归于平衡的常态，中毉的一切理论都是围绕这种能量状态的消长变化展开的，理法方藥莫不如此。如果偏离了这种观察思考的角度，处方用藥必将变得毫无方向（见用藥指月篇）。所以中毉学是以理论为第一要义的，经验只是在理论指导下的实践的积累。
离开了中毉的基本理论，即使用中藥治病，也只能是简单的经验毉学（所謂的祖传秘方、验方……），不能归入中毉“天人合一”与辨证施治体系了。
西医是随着解剖学与化学的发展产生并发展起来的，由于起点远离了直接的生命体验，导致了其认识论与方法论的机械主义倾向。一般来说，西医是把人体当作一部机器对待的，所以检查同样离不开机器，如医院停电，医也不是医，因为它所以靠的重要元素不存在。西医的治疗方法除了作用于诸大系统的内科化学疗法外，外科的方法更像是木工或裁缝工作。这样就忽略了作为一个生命体的个人的生命力的能量存在状态，及其作用于人的直接或即发性病理状态。由于其认识论与方法论的局限，导致了西医治疗学体系的重大缺陷——无法正确诊断能量状态的常态、非常态的客观存在。常见的现实如：病人能够很明显地感觉得到自身的某种不适症状，但经过西医病理（数据）检查，却被告知没有病（取名为亚健康），于是，对于病人来说很现实的客观症状就被歪曲成了一种主观错觉。还有诸如手术后病人已经死亡，却得出了手术非常成功的荒谬结论，等等。这些现象从本质上来说都是由于其认识论与方法论的先天缺陷造成的。中毉的认识论与方法论从自然中來的客观实在性与可验证性，证实了中医理论针对疾病治疗的正确性的同时，也从客观上弥补了西医方法论上的这种先天不足。可惜绝大多数自以为很了解西医，很相信科学的明白人并不能清醒地认识到这一点，他们熟视无睹或有意回避其局限性。科学在他们的头脑中已经图腾为一种拜物教似的迷信（即使有西医明白人也在大潮流“以利为先”中淹灭）。
中毉治病是以“全面”（全息）为最终目的的，但由于客观因素的局限，能够达到全面的上工寥寥无几。西医是以装拆“人体零件”为目的的,只要“零件”修好了，就是换上“板状、管状、环状、、缠绕状……，由不锈钢、镍、钽、钴铬合金等材质制造”的零件，局部上达到这样的有效率就算成功。
中毉自古就是以个体行毉的，治疗对象也是个体，不会等到凑全人数才开始治疗。西医是以群体行医，治疗是分组进行的，实际上同时是在拿患者作实验（同时又起到行大欺客的作用）。中毉的标准是上工，真正达标的毉生很少。西医是以下工为标准，只要能够与“物质”相应就算合格。
中毉是在进行治疗，西医正在进行实验。因为大多数中毉不能真正代表中毉，因为你遇到的中毉大部分是西医的化身，如现代人不反“中医”反而不正常。证明用西方文化改造东方文化是不正确的，要是正确的、进步的，根本就不存在什么殖民不殖民的问题了。
事实并非如此，真正能代表两种医学的治疗结果（权威的水平）的疗效的性质，即标本的差别，也即预后的情况。是真正的治愈了，还是只是掩盖一时，比如激素的短期效果与后期副作用。这种区别才是两种医学理论所指导下的医学实践的本质区别，而不是人为造成的错误与伤害。
西医治病靠的主要能量是药的能量，而中毉则完全不同，它力求用自然的力量或来自整体的“本能”能量来治病，这是中西医最大的区别！
西药是化学小分子，它研究到人体细胞，作用于绝大多数细胞，对病变细胞进行杀伤。而中毉是生物场它超越了人体细胞进入经络炁态（很多人对中毉的偏见非得要西医认可，如果是这样，中毉就没有存的价值了，因为要请西医做判官，要中毉干嘛？）比西医更微观。它作用的对于十四经脉，因为中毉认为，细胞的病变并不是病变的全部，而是生存的大环境迫使它变异，于微环境“对应”变异。在中毉看來小到细胞层次也是宏观层次，经络炁气层次才是中毉微观层次，中毉的宏观在“天地”外，包括“天地”。所以、微观也好，宏观也罢，属性是“其大无外，其小无内”，能量平衡的基本属性。
不改变环境就无从使病变的细胞改邪归正，即使杀死了病变细胞，新的细胞还会在这里发生变异。细胞的生存环境是由经络营养的输送形成的，细胞的病变有两种形式，一种是细胞功能亢进，能量高度积聚，如癌症，另一 种是细胞功能低下，如脾胃虚弱。
功能亢进就需要堵塞经络，使营养无法运送进去，自然亢进就会偃旗息鼓，堵塞经络的东西就是西医认为的毒藥，即重金属离子，此时它就是良藥。细胞功能低下就需要疏通经络，通过这种方式，局部细胞就能够在整体的控制下恢复正常。 自然力量是中毉借助的第二种治病力量，这一点我们从五运属水的肾或穴位就知道了。假如水分子可以在能量的激发下游离出一个氢质子，而这个自由氢质子又会转换另一个水分子中的氢原子，如此往复，就形成了人体的普遍联系。自然的变化是通过激发水分子中的氢原子失去一个电子成为自由氢质子来作用于人体的。自由氢质子多了，这里的电位就会升高，组织液就会从这里向电位低的地方流动。肾和穴位就是人体组织液含量最大的地方，因此，人体组织的流动的启动点就在这里。特别是肾，之所以称之为“先天之本”就是因为它是人体吸收自然能量的大本营。
人体有“无量”个细胞，每天都有大量的旧细胞死亡，也同时有大量的新细胞产生，在这新陈代谢之中，人们很少会怀疑它们的基因发生了变异。为什么呢? 原来，人体有一套精妙的管理系统，通过经络系统，整体的意志就贯穿在周边的每一个角落，与这种意志相和拍的细胞就可以不断产生（“引、斥、和”定律），而与这种意志相违背的细胞就在这里不断灭亡，正是这种优胜劣汰的机制，使人体每一个细胞的形成都听整体的话。 疾病的产生与整体的失控有关，即经络不通造成整体不平衡，信息在这里传递失真和变形，于是局部细胞的新陈代谢就失了控，一些细胞发生的变异整体还不知道，而整体的命令局部细胞也不清楚，于是糊里糊涂之中，变异的细胞群体越来越大，疾病便产生了。
在西方医学看来，大脑是整体的管理中心，它高高在上，管理着身体的一 切。但在中毉学看来，大脑虽然高高在上，但它绝对只是整体的一部分，真正的管理中心是以心脏为核心的脏腑系统，它通过血液的不对称供应决定着大脑中信息之间的竞争，谁与它顺应就支持谁成为主导，并上升为影响人整体活动的意识一一精→炁→神；
同样，这个意（神）产生之后，也是在心脏血液的不对称供应之下，使某些器官优先活动，并使其它器官以它为中心进行协调，这才使整体能够完成某些特定的功能。借用一个名词就是说心脏是爷爷，而大脑只是具体的执行者，它按照爷爷的意志对信息优胜劣汰，优先出对整体发展有利的信息，并上升到整体的命令，在整体进行实施。 穴位是人体的次管理中心，它在人体中有周边'小心脏'之称。它的最大特 点就是和心脏一样有自己独特的搏动主频，它优先获得心脏能量供给的方式就是和心脏的搏动频率相和拍。意识是整体意志的一种体现，它和心脏的搏动频率有直接的关系，当某一个信息被优选出来成为意识之后，就会通过水分子集团的周期组织与离散在神经中传递，中毉讲'意到气到'，其实就是意识优先支持哪一个穴位，心脏的能量就优先供应哪一个穴位，穴位通过经络将整体的信息传递到各个局部的组织细胞，从而使整体表现出了惊人的一致性。 明白了整体的控制原理，再来看中毉治病的原理就一目了然了。人体的疾病产生是人体自我管理的混乱造成的，一般这种混乱很少产生于神经和血管这部分，最主要的原因就是十四经脉，即从穴位到具体的每一个组织细胞的微循环系统，因此，中毉才特别强调经络在人体的重要性。中医治病也是从经络入手的，局部组织功能亢进就适当堵塞经络，使这些组织得不到整体的营养供应而停止过度的兴奋；
反过来，如果局部组织功能低下，就需要疏通经络，增强 整体对它的营养供应，使之组织功能加强。中藥（上艹下木、主心骨是“樂”，樂的简化字是“乐”，心情要快乐）就是通过对经络的 疏堵来完成的，克服病患的力量主要不是藥物自身，而是利用整体的综合力量。 西药则完全不同，西方医学根本不懂微循环在人体的重要作用，他们总以为宏观的神经和血管比微循环更重要，因此对中毉经络学说所描述的微循环始终没有得到正确认识（仅仅是现代机器“看”不见）。没有了它们沟通整体与局部的每一个细胞，整体就被他们 拆散成一个个没有联系的部分，西医治病就是'头痛治头，脚痛治脚'。西药治病的机理不是恢复整体的控制，而是要用药物来杀死变异的细胞，变异的细胞杀死很容易，但要让新生成的细胞取代它们就不是西药能够完成的，它需要整体力量的介入，如果只重视杀死变异细胞，那么更多的细胞还会在药物的作用下变异，这得不偿失。 在中毉学中，经络穴位的重要性远比实际的组织器官作用要大，因为它们是这些组织器官最直接的管理者，穴位通过微循环中的体液流动，使整体的信息渗 透到每一个细胞，与整体的意志相和拍的细胞就不断让它在这里产生，而那些与整体意志不和拍的细胞就让它在这里灭亡，细胞的新陈代谢并不是胡乱进行 的，而是在整体的控制下有条不紊地新旧代换。中毉治病不仅注重经络的作用， 而且特别注重穴位在人体的作用。如针灸、穴位药物注射，艾灸等。 中毉治病主要利用先天和后天两大力量。先天的主要是自然力量，自然是变化的，它可以通过引力或电磁力作用于人体的组织液，使水分子中的氢原子 失去一个电子而游离出来，成为自由氢质子，体液中自由氢质子多，生物电压 就高，体液中自由氢质子少，生物电压就低，体液就是按照生物电压的从高到 低有序流动的。由此可见，体液含量相对较大的组织就是吸收大自然能量的窗口。如三焦、命门、丹田等这些重要的穴位都不是一个点，而是孔隙相通、各种网络汇集的一片区域，其中包含着大量的组织液，它们能有效地吸收大自然 的能量，推动体液在人体的循环。其次是各个穴位，它们也是推动体液循环的 主要动力点。肾被称为人体的'先天之本'，主要原因就在于它管理着人体的体 液代谢，而这直接关系到人体对大自然能量的吸收。因此，中毉治病特别强调治心和养肾，治心可以让人体的能量按照自然之势自主地循环，治肾可以让自然能量有序地在人体汇集。 后天的主要是自我的控制能力，中毉学的一个核心观念就是整体决定局部， 无论局部多么重要，它都永远是整体的一部分，如大脑，虽然高高在上，但它 绝对服从于整体，意识本质上就是整体意志的一种体现，而绝不是大脑自主分泌的产物。人体真正的中心应该是以心脏为核心的脏腑系统，它不仅通过血液的不对称供应控制着大脑中意识的产生，也通过血液的不对称供应控制着各个穴位，穴位是细胞最直接的管理者，它通过经络将整体的意志传达到每一个细胞。人体生了病，不在于病变细胞，而在于细胞的生存环境，细胞相对于它的生存环境来说永远是渺小的，环境变了，细胞就要发生变异，中毉治病就在于改变细胞的生存环境，让细胞改邪归正，而不是去直接杀死变异细胞。 中毉特别强调经络，原因就在于经络不仅是人体信息传递的主渠道，而且是细胞营养供应的主渠道，经络堵塞，信息传递就会失真（能量堆积），整体不知道局部的细胞发生了什么，局部的细胞也不知道整体要干什么?久而久之，疾病就产生了。
中毉治病最根本的就在于恢复整体的控制能力，局部组织功能亢进就要消弱， 方法就是“通”经络，使过度兴奋的组织得不到过多的量能而平静下来，局部组织的功能低下就要增强，方法也是疏通经络，使整体能够优先支持它而使功能得到加 强。这样中毉学中有中藥“归经”，根据藥性能量与藥量“内察”中藥在经络中运行的起始点而形成组方。
西医不明白这个原理，总是把这些所谓的有毒药物视为洪水猛曽，疏不知，毒药运用得当，就会变成良藥。 以治癌来说，中毉强调治癌先治心，癌症本质上并不难治，难治的只是患者自己的心。我们知道，不顺应社会的发展就会事业失败，但绝大多数人并不 知道，不顺应自然的变化就会疾病连连，疾病就是大自然对不顺应它变化的人 一种惩罚，而癌症就是对那些屡教不改的人一种牢狱之灾。你不顺应自然而形 成的疾病，那能怪谁呢? 最根本的是自己，是你自己过于执着于社会意识，让我们先天的潜意识主导的与自然顺应的功能受到阻碍，致使人与自然之间的矛盾激化产生疾病。由此可见，要想治癌，最根本的就是治心，只有患者认识到自 己的错误所在，并能及时改变这种错误，癌症才有可能治愈，如果执迷不悟， 还任由自己的偏执意识主宰你的身体，那么你就完了。
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