1.消化道反应。部分患者在服用二甲双胍后会出现恶心、呕吐、腹胀、上腹部不适感、食欲下降等表现。这种情况多与服药剂量有关，建议患者遵医嘱、从小剂量开始服药，可以减轻二甲双胍的胃肠道副作用。二甲双胍引起的消化道反应多出现在治疗早期，大多数患者发生于服药的前10周，随着治疗时间的延长，可逐渐耐受或者症状消失。如果实在不能耐受，可以在医生的指导下更换药物。
2.转氨酶升高。二甲双胍服用后在肝脏进行代谢，部分患者会出现转氨酶升高的情况，建议血清转氨酶超过3倍正常上限或有严重肝功能不全的患者避免使用二甲双胍。
3.乳酸酸中毒。二甲双胍可以增加无氧糖酵解，同时抑制肝脏以及肌肉对乳酸的摄取和利用，导致乳酸在体内蓄积，极少数患者会出现乳酸酸中毒的表现，主要发生在有明显肾功能障碍的患者中。一旦发生乳酸酸中毒，需要及时前往正规医院就诊，及时治疗。
4.影响维生素B12的吸收。多项研究显示，长期服用二甲双胍可以引起体内维生素B12水平的下降。其可能的机制是，由于小肠蠕动的改变，刺激肠道细菌过度生长，可以竞争性地抑制B12的吸收。另外，二甲双胍还可抑制回肠末端维生素B12内因子复合物钙依赖性的吸收。
