新冠对人类肠道菌群的独特影响

新型冠状病毒（COVID-19）爆发和大流行，引发了全球的关注。

患者会出现严重的呼吸道感染以及胃肠道症状，研究显示，这些症状与菌群有密切关联。

越来越多的研究开始聚焦肠道菌群，系统和全面地了解新冠和肠道菌群之间的关系对于提供公共卫生预防或治疗策略至关重要。

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新冠后出现腹泻

原来是新冠病毒引发胃肠道紊乱

自 2019 年 12 月首次发现新型冠状病毒以来，极高的传播导致了 2020 年全球冠状病毒病 2019 （COVID-19） 大流行。

来自武汉的早期报告显示，2-10%的新冠肺炎患者有胃肠道(GI)症状，包括腹泻，而另一项Meta分析报告称，高达20%的患者有胃肠道症状。

科学家招募了106名在香港医院住院的患有轻度至中度COVID-19的患者，患者在入院时、1个月后和6个月后采集了粪便样本。

研究人员使用了一种称为宏基因组测序的技术，共分析了258个样本。

出院后，81%的人在3个月后仍至少有一种持续的症状。6个月后，76%的患者仍有症状。

最常见的症状是疲劳、记忆困难、脱发、焦虑和睡眠障碍。

参与者的肠道微生物群与这种情况之间存在着显著的联系。

胃肠道感染新冠病毒或其他病毒后，部分患者可能发生胃肠道微生物群改变。

肠道组织和粪便也可能是一个贮存器。最近研究表明，即使鼻咽和口咽拭子检测新冠病毒RNA呈阴性，患者粪便样本中仍然有可能含有新冠病毒RNA。

另有研究指出，腹泻患者的新冠肺炎症状持续时间延长，而腹泻患者的粪便样本中病毒RNA的阳性率更高。

目前的假设是可能涉及肠道组织上的直接病毒感染和对该病毒的局部免疫反应。

实际上，在新冠肺炎患者患者的粪便中检测到新冠病毒RNA可能表明粪-口传播。

此外，新冠肺炎患者还可能发生细菌感染和继发感染，抗生素的使用是临床上常见的做法，但这可能会破坏胃肠道微生物组。

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新冠影响力

竟使42种菌群发生变化

2022年发布在《Nature》的观点总述 ，病毒性肺部感染后肠道微生物群的组成和多样性发生了变化。

在新冠肺炎患者中，与对照样本相比，入院时以及出院后3和6个月，42种菌群的丰度存在差异。

与健康对照组相比，主要表现为条件致病菌增多，有益共生菌减少。

例如，与未感染人群相比，新冠患者的活泼瘤胃球菌、多氏拟杆菌数量更高，并且能够影响免疫系统反应的种类则少得多，例如青春双歧杆菌、普拉梭菌和直肠真杆菌。

总共发现23个细菌分类群与新冠肺炎病的严重程度密切相关，其中大部分(15个)来自厚壁菌门。

与新冠肺炎疾病严重程度最具正相关的菌群有三种，分别为来自厚壁菌门的粪芽孢菌属，罗氏梭状芽孢杆菌和哈氏梭菌。粪杆菌和梭状芽孢杆菌的丰度与 COVID-19 严重程度呈正相关‍。

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调节“肠肺轴”

有望缓解长新冠症状

胃肠道和呼吸道是称为肠肺轴的共享粘膜免疫系统的一部分。

胃肠道和呼吸道的微生物群参与肠肺轴，影响局部和远处免疫反应。肠道微生物群支持局部粘膜免疫，并被认为是全身免疫系统的重要调节剂。

肠道菌群会影响肺免疫力， 肠肺轴是双向的，是肠道微生物群和肺部之间交流的一种方式。呼吸系统疾病长期以来一直与肠肺轴有关。

肠道菌群与呼吸道病毒感染密切相关，可能通过肠肺轴影响疾病的发生和发展。因此，肠道微生物群可能在肺部疾病的治疗中发挥潜在作用。

越来越多的证据表明，微生物群可以在细菌和病毒感染过程中调节免疫反应，成为所有这些疾病管理的潜在目标。

由 COVID-19 引起的大流行提醒我们，肠道微生物群的潜在价值可能是作为 COVID-19 的治疗靶点，有可能在肠道中寻找新冠病毒感染的解决方案或缓解措施。