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呼吸系统手术（30-34）包括喉和气管、肺和支气管、胸壁、胸膜、纵隔的手术。
不包括乳房手术（85.0-85.99）、呼吸道非切开的异物去除术（98.15）、气管造口管的去除和置换（97.37/97.23）以及气管支气管支架的置入术（96.05）。 应区分范围（部分喉、半喉、全部）。全部喉切除术不伴有根治性淋巴结清扫编码于 30.3（全喉切除术），伴有根治性淋巴结清扫编码于 30.4（根治性喉切除术），同时进行的气管造口术和甲状腺切除术不应编码。呼吸治疗填报应区分侵入性（经气管内插管或气管造口）持续性机械通气（96.71-96.72）和非侵入性机械通气（无创）（93.90-93.99）。住院期间两种操作均进行时应先填报侵入性，再填报非侵入性的机械通气。（一）侵入性（经气管内插管或气管造口）持续性机械通气应另编码 96.04（气管内插管）和（或）31.1-31.29（气管造口术）。与本次住院相关且作为一个医疗过程的门、急诊实施的气管内插管和气管造口术，可以作为其他操作编码填报。（二）侵入性（经气管内插管或气管造口）持续性机械通气按通气时间＜96 小时编码于 96.71、≥96 小时编码于 96.72，多次通气时间可合并计算。具体见下表：
气管造口术应区分暂时性气管造口术（31.1）和永久性气管造口术（31.2），同时进行的气管镜检查（33.21-33.24，33.27）应另编码。 支气管肺泡灌洗分类应区分目的。支气管和气管的非手术性冲洗和清洁编码于 96.56（支气管和气管的其他灌洗），诊断性支气管肺泡灌洗（BAL）编码于 33.24，全肺灌洗编码于 33.99。全肺灌洗（33.99）是主要用于矽肺患者的治疗性操作。呼吸系统相关部位的修补术和整形术应区分修补部位和目的。具体见下表：
应区分术式和切除范围。肺大疱未切除行结扎术编码于 32.21（肺大疱折叠术），单纯肺大疱局部病损切除编码于 32.29（肺病损或组织的其他局部切除术或破坏术），肺大疱行肺叶切除术编码于 32.49（肺叶切除术）。手术中同时进行的胸膜固定术编码于 34.6（胸膜划痕术）。同一术式处理多个肺大疱，仅编码一次。应区分手术入路、术式和切除范围，填报时不区分左右侧，双侧肺同时手术时，可分别编码。临床书写的肺叶切除伴纵隔淋巴结清扫应分别编码 32.49（肺叶切除）和40.59（纵隔淋巴结清扫）。具体见下表：
应区分入路、部位和目的，应与治疗性操作区分。如：支气管镜下抽吸痰液编码于96.05（呼吸道的其他插管术）。具体见下表：
包括单（双）侧肺移植手术（33.51、33.52）和心脏—肺联合移植术（33.6），应另编码 00.91—00.93说明供体来源，同时进行的体外循环辅助开放性心脏手术（39.61）也应另编码。未明确单、双侧的肺移植术（33.50）原则上不应使用。用于治疗胸腔积液和气胸编码于 34.04（肋间导管置入用于引流），其作为胸外科手术常规步骤不应编码。单纯胸腔穿刺抽吸编码于 34.91（胸腔穿刺术）。 肺和支气管切除术同时进行的肋骨部分切除术、胸骨切开术、胸骨劈开术和胸廓切开术不应编码，同时进行的支气管成形术（33.48）应另编码。胸腔内注射肿瘤化疗药物编码于 34.92（胸腔内注射），应同时编码 99.25（注射或输注癌瘤化学治疗药物）。 来源：广西壮族自治区医疗保障基金结算清单及编码填报管理规范（试行）
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