今天给大家介绍一个经典的科研思路—“A基因通过B机制影响C疾病的D功能”。
话不多说，直奔主题！
我们该如何做这个类型的研究思路设计？
【对于疾病研究】：疾病组织和正常组织间，所研究的基因必须有差异，不然这个基因就不叫这个疾病的相关基因了。这个差异，可以是表达差异，可以是突变，也可以是基因修饰。在做的时候，样品量越多，检测方法越多，基因与疾病的相关性越紧密，这个数据就越好了。文章档次也就高了。
【对于非疾病研究】：在正常生理情况下，不同条件下基因的表达有差异。比如DNA损伤修复，采用紫外诱导DNA损伤，看处理和非处理组间基因的差异。
在这里，大家要注意，诱导条件要尽量接近天然环境。如果是非正常生理状态下的结果，对于我们科研是没有啥意义的。
第一步找到差异基因后，我们接下来就需要讨论：这个差异基因是这个疾病发生发展的因，还是果呢？讨论是因是果，就需要在细胞和动物模型上来看看是否有功能表型，这个功能表型与疾病的发生发展是否存在相关性。
另外需要注意的一点是，可执行性。很多人拿到课题了，却没能发表好文章。有的是没有做出来，有的是做不了。所以，课题设计中细胞及动物模型的建立需要慎重考虑，请先进行灵魂3问：模型成熟吗?有公认的造模方法吗？自己的实验室有这造模条件吗?
一个课题的深度就在于机制的深度。对于机制，做法简单分3类：
①下游信号通路检测
这个比较多，就看看A基因改变后，下游信号通路B改变如何。
②下游分子功能相关
信号通路检测，只是分子表达相关。课题要继续深入和拔高，就需要再做功能相关。那么如何思考和设计实验呢？
即：A干扰后，B下降，细胞有功能表型改变。那么如果单独把B干扰，功能表型是否跟A干扰一致？
或者，A干扰后，B下降，细胞有功能表型改变。那么如果在A干扰的前提下，把B过表达，细胞表型是否恢复？
以上这个脑回路就是我们常说的Rescue实验。
③分子互作
简言之就是必须找到与A直接互作的B。这个难度较大，成功的话可以挑战高IF期刊。方案有2个 ：
A干扰后做表达谱分析，获差异基因list X。生物信息学分析A可以调控哪些基因，获基因listY，listX和listY取交集。对交集基因，做luc检测。如果OK，再ChIP或EMSA。追求更高分的文章，可以把B的Rescue实验做出来。
或：ChIP on chip，微阵列芯片。这里跟上面的ChIP一样，需要有好用的抗体。最后要求也一样，高分文章可以把B的Rescue实验做出来。
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这套课程围绕目前的研究热点，比如：细胞自噬、细胞铁死亡、细胞焦亡、表观遗传、circRNA、lncRNA等，都做了很详细的讲解，带你直面CNS的秘密。
