【原】动物植物科研找miRNA靶基因建议收藏这些网站

引言部分

在生信漫谈交流群里有小伙伴问想问一下友友们，有没有什么软件可以预测植物miRNA的靶基因（已知miRNA序列），当即想到躺在自己收藏夹的一些关于miRNA靶基因预测的好网站。

通过施一公院士的自我突围，可以看到一公的大公无私，为中国教育的发展燃烧自己。这本书写给教育科研工作者，写给青年学子，在追求理想的道路上步履不停，共同前行。

R必看Y叔（余光创教授）的R实战书这本书《R实战：系统发育树的数据集成操作及可视化》，刚推出时候，卖断货N多次，现在价格只要半价，非常推荐。

01

植物部分

植物调节性小rna (sRNA)在基因表达调控中发挥着重要作用，包括大多数microRNAs (miRNAs)和一小部分小干扰rna (phasiRNAs)。尽管由不同的遗传生物发生途径产生，但长度从20-22个核苷酸不等的调节性sRNAs具有通过mRNA降解或翻译抑制引导转录后基因沉默的相同机制,这是psRNATarget网站的前言翻译。

网站地址：https://www./psRNATarget/

加载示例文件如图：

选择默认参数上传即可：

等待数秒即可看到结果：

网站功能还是非常齐全，速度响应快，植物的数据库非常齐全，做植物的建议参考收藏一下。

如果是研究水稻的话有个专门的网站，可以看到具体的区段有哪些小RNA：http://sundarlab./cgi-bin/smrna_browse/rice2/#search

还有一个根据具体的小RNA查目的靶基因，也非常直接：http://sundarlab./cgi-bin/mirna/known_mirnas_vs3.pl?mirna_table=os_known_mirnas&target_table=os_mirna_targets&gbrowse=smrna_browse/rice2/

网站功能也非常强

02

动物部分

动物小RNA推荐这个网站，功能也非常齐全，中山大学团队开发的可以收藏研究：https://rna./chipbase/miRNA.php

使用也非常简单，按步骤来即可：

该网站的其他功能大家感兴趣也可以研究一下：

今天就先给大家介绍到这里，需要生物软件的小伙伴关注公众号生信漫谈，私信我即可免费获取软件及安装教程，想看免费视频资料的关注微信视频号生信漫谈，希望大家的科研能有所帮助！祝您科研顺利快乐！  ------生信漫谈