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大家好，今天介绍的文章题目为Myel oid-specific KDM6B inhib ition sensitizes gliobla stoma to PD1 blockade（髓系特异性KDM6B抑制使胶质母细胞瘤对PD1阻断敏感）胶质母细胞瘤（GBM）富含免疫抑制骨髓细胞，对免疫检查点疗法（ICT）无效。通过表观遗传途径调整免疫抑制骨髓细胞功能表型以克服ICT耐药性尚待研究。 01 研究背景 胶质母细胞瘤 （GBM） 肿瘤富含免疫抑制性骨髓细胞，并且对免疫检查点治疗 （ICT） 无效。靶向表观遗传途径以重新编程免疫抑制性骨髓细胞的功能表型以克服对ICT的抗性仍未探索。 人GBM肿瘤的单细胞和空间转录组学分析显示，表观遗传酶组蛋白3赖氨酸27脱甲基酶（KDM6B）在肿瘤内免疫抑制性骨髓细胞亚群中的高表达。 重要的是，骨髓细胞特异性Kdm6b缺失增强了GBM荷瘤小鼠的促炎途径并提高了存活率。机制研究表明，Kdm6b的缺失通过抑制免疫抑制介质（包括Mafb，Socs3和Sirpa）来增强骨髓细胞中的抗原呈递，干扰素反应和吞噬作用。 见图一 KDM6B富集在人GBM的瘤内骨髓细胞中。  图一 a，scRNA seq数据的特征图，显示了编码表观遗传酶的指示基因在肿瘤内骨髓细胞簇中的表达，如图所示。1c. b，scRNA seq 数据的 UMAP 图，显示来自 GBM 患者（n = 45 名患者）的 GBM TME 中的 CD4+ 免疫细胞亚群。 c，小提琴图显示指示基因在不同免疫细胞簇中的表达水平。 d，scRNA seq 数据的 UMAP 图，描绘了来自 GBM 患者的 GBM TME 中的 CD45+ 免疫细胞亚群（n = 20 名患者）。 e，小提琴图表示指示基因在不同免疫细胞簇中的表达水平。 f，小提琴图显示了KDM6B在GBM（n = 5例患者）TME中不同骨髓细胞簇中的表达水平，请参见图。1c. 虚线表示用于定义 KDM6B 的截止 KDM6B 表达式值高和 KDM6B低细胞。 g，h， 代表KDM6B间差异表达基因的火山图高和 KDM6B低GBM （g） n = 4 例患者 （h） n = 13 例患者的 TME 中的髓系细胞。火山图显示褶皱变化（对数2FC）与绝对置信度log10调整后的p值（-log10（p））相对立。双尾泊松测试是使用修拉R包进行的。 见图二 KDM6B高 富含骨髓细胞的区域在人GBM肿瘤中缺乏CD8 T细胞。  图二 a，苏木精和伊红染色GBM肿瘤切片（n = 3例患者）。每个部分代表一名患者。图像中包含的比例。 b，代表性图显示GBM组织样本中KDM6B的免疫组织化学染色（n = 3例患者）。 c，d，多重免疫荧光染色显示 GBM 肿瘤样本中 CD3（白色）、KDM6B（蓝色）、CD68（绿色）、GFAP（黄色）和 CD163（红色）的分布。箭头标记显示KDM6B蛋白表达与CD68和CD163的共定位。数据代表两个独立实验。 e，i，UMAP图匹配的scRNA序列数据显示GBM TME中的CD45 +免疫细胞亚群，用于通过应用CellTrek将单个细胞嵌入到组织切片中的空间坐标中。 f，j， 在空间坐标上绘制的来自匹配患者的所有不同免疫细胞簇的基因表达数据。 g，h，k，l，Visium空间基因表达评分图，用于表达CD68 + KDM6B + CD163 + KLF2 + CXCL8表达骨髓细胞簇（以蓝绿色突出显示）和CD3E + CD8A + GZMB + GZMK + ICOS T细胞簇（以红色突出显示）在人GBM肿瘤中的空间分布表达骨髓细胞和活化的CD6 T细胞。 见图三 表达KDM6B的免疫细胞簇富含免疫抑制标志物。  图三 a-c，点图显示感兴趣基因的平均基因活性评分以及簇中表达指定簇中基因的细胞的百分比（如图所示）。2e，以及扩展数据图中所示的b和c。2e， i）。 见图四 Kdm6b的髓细胞特异性缺失不影响髓系细胞丰度。  图四 a，演示LysM生成的示意图克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州遗传鼠模型。 b，琼脂糖凝胶的代表性图像，显示描述来自Kdm6b删除纯合小鼠（单个400 bp条带），Kdm6b删除杂合子小鼠（368和400 bp条带）和对照纯合子小鼠（单个368 bp条带）的PCR扩增DNA的条带。数据代表两个独立实验。 c，t-SNE图和箱须图，描绘了对照和LysM中指示解剖位置中存在的不同免疫细胞群的身份和丰度克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州通过CyTOF分析确定的小鼠。n = 3只雌性小鼠/组。进行双尾学生t检验（ns=不显著）。晶须表示最小值到最大值。 见图五 Kdm6b的骨髓特异性缺失改变了肿瘤内免疫细胞的丰度。  图五 a，热图显示了目标基因在不同Cd45+免疫细胞簇中的表达（如图所示）。 b，条形图，描绘对照和LysM中不同肿瘤内免疫细胞亚群的频率克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州小 鼠。 c，条形图表示肿瘤内CTL和Tregs在对照和LysM中的比率克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州根据scRNA序列。 d，确定的小鼠，小提琴图描绘了对照和LysM中不同免疫细胞簇中Lyz2的表达水平克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州小 鼠。两个独立的scRNA序列实验的数据代表。 e–g，箱形和晶须图，代表流式细胞术分析来自对照和 LysM 的 PBMC （e）、淋巴结 （f） 和脾脏 （g） 中存在的不同免疫细胞群的丰度克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州携带GBM肿瘤的雌性小鼠（n = 3个生物学独立的样品/组对于（E），n = 4个生物学独立的样品/组对于f和g。进行双尾学生t检验。晶须表示最小值到最大值。 见图六 Kdm6b的髓系特异性缺失使TME偏向促炎表型。  图六 a，热图显示了图中所示免疫细胞簇中感兴趣的蛋白质标记物的表达。3g通过质控细胞术测定。 b，热图显示了不同骨髓细胞簇中目的基因的表达（如图所示。四右面板）。 c，代表对照组和LysM的肿瘤内骨髓簇频率的条形图克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州小 鼠。两个独立实验的数据代表。 见图七 Kdm6b缺失改变了肿瘤内骨髓细胞的染色质景观。  图七 a， UMAP展示了GBM（GL261）TME控制和LysM中的CTL和Treg簇克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州通过scATAC序列测定小鼠（如图所示。第5a、b段）。 b，条形图描绘了对照和LysM中肿瘤内CTL和Treg的频率和比率克雷KDM6B佛罗里达州/佛罗里达州根据scATAC序列b确定的小鼠，描述CTL和Treg簇中指定基因的染色质可及性的覆盖图。 c，热图显示了感兴趣的基因在指示的骨髓细胞簇中的表达（如图所示。5d）。 d，e， 覆盖图描绘了感兴趣基因中指示染色质区域（峰）的可及性。 02 研究结论 此外，KDM6B的药理学抑制反映了Kdm6b缺失髓系细胞的功能表型，并增强了抗PD1功效。因此，本研究将KDM6B确定为骨髓细胞亚群功能表型的表观遗传调节因子，以及增强ICT反应的潜在治疗靶点。 好了，今天的文献解读就到这儿来，我们下期再见！如果你正在开展临床研究.需要方案设计.数据管理. 数据分析等支持.也随时可以联系我们。 |
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