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国自然热点:转录激活 巨噬细胞M2极化:创新点:转录因子 激活CCL28 调节巨噬细胞的M2极化 抑制结直肠癌(CRC)免疫逃避

 外科黄文斌 2023-12-19 发布于广东

通过转录激活CCL28表达抑制巨噬细胞M2极化,防止大肠癌细胞免疫逃逸

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创新点

转录因子(SPDEF激活CCL28抑制结直肠癌(CRC)免疫逃避,是通过调节巨噬细胞的M2极化来实现。

转录因子 激活CCL28 通过调节巨噬细胞的M2极化 抑制结直肠癌(CRC)免疫逃避

研究结果

1. COX回归分析发现18个重要免疫相关基因(IRGs)可以预测结直肠癌患者的预后

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2. 12个关键IRGs可能与结直肠癌患者的临床和病理特征密切相关

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3、WGCNA分析通过筛选三个微阵列数据集确定了两个CRC基因共表达模块

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4. CCL28可能通过转录因子调控巨噬细胞浸润参与结直肠癌细胞免疫逃避

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5. SPDEF通过转录激活CCL28的表达

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6. 上调CCL28在SPDEF上的表达可抑制M2巨噬细胞极化,抑制结直肠癌细胞生长

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7. SPDEF可上调CCL28的表达,抑制M2巨噬细胞极化,抑制NOD-SCID小鼠CRC细胞的成瘤

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网络药理学融合分子网络药物互相作用,揭示机体药物之间复杂的相互作用

网络药理学高分文章关键步骤:

第一步:利用权威数据库,中药处方(如:益气活血方)的潜在化合物。

第二步:采用超高效液相色谱-高分辨质谱法(UPLC-HRMS)对化合物进行鉴定和定量(有条件)

第三步:利用公共数据库RNA测序数据、蛋白芯片数据,结合疾病数据库,通过生物信息学分析或机器学习预测关键靶点,明确分子作用于疾病的关键机制

第四步:利用分子对接确定化合物与关键预测靶标之间的配体-靶标相互作用

第五步:更重要的是通过体内和体外实验进行机理验证

国自然高分攻略:多热点组合(巨噬细胞、自噬、铁死亡、泛凋亡、铜死亡、甲基化、细胞代谢、转录因子、长非编码RNA、miRNA、circRNA) 多层面(动物、细胞、类器官三个层面)研究,使实验设计更精彩。

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今天文章介绍

题目:结合网络分析和实验验证,揭示益气活血方治疗心肌缺血/再灌注损伤的自噬相关机制    杂志:Pharmacological Research IF=9.3 2023年3月

热点:氧化应激诱导 线粒体功能障碍 中药 网络药理 自噬 炎症 细胞凋亡

研究内容

1.体内实验验证YQHX对心肌I/R损伤模型的影响

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2.网络分析

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3.功能富集分析

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4.通过MCODE算法进行模块化分析

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5、通过分子对接验证已鉴定化合物与关键靶点之间的相互作用

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6、体外验证YQHX对H/R损伤模型的潜在机制

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YQHX可改善H/R损伤模型的线粒体功能障碍  

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YQHX保护线粒体形态,阻止H/R损伤中自噬体和自噬溶酶体的产生

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YQHX抑制H/R损伤模型中自噬和线粒体自噬靶点的表达

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小结

YQHX通过调节自噬、减轻氧化应激、抑制炎症、抑制细胞凋亡等作用减轻心肌I/R损伤。此外,YQHX通过作用于心肌I/R损伤,减轻氧化应激,调节自噬和线粒体自噬的机制已通过体内和体外实验得到验证。根据分子对接结果,UPLC-HRMS鉴定的CID44715618、柚皮苷、毛蕊异黄酮-7-O-β-D-糖苷和人参皂苷F1是调节自噬和有丝自噬的关键化合物。

国自然热点怎么玩:A基因通过B通路调控C疾病的D功能:巧妙整合热点:巨噬细胞、线粒体、自噬、炎症、铁死亡、甲基化、细胞代谢、转录因子、长非编码RNA、miRNA、circRNA泛凋亡

'A基因通过B通路调控C疾病'万能思路,万能公式,有的能发高分文章,有的就不可以,归根结底是创新。

把万能思路 两个热点整合,不仅能发高分,且能能顺利申请国自然本本。

例子:万能思路 泛凋亡 线粒体

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科学问题:探讨ph-IOP损伤中Drp1介导的线粒体动力学的变化,阐明ERK1/2-Drp1-ROS轴在RGC死亡中的关键作用。

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总结

        巨噬细胞、线粒体、自噬、炎症、铁死亡、甲基化、细胞代谢近几年国自然大热的方向,且近几年中标数量不断攀升。

       其中,巨噬细胞以肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)最为热门,值得继续挖掘。

       我们预测,2024年线粒体仍将是主要研究方向。

        线粒体重点关注:线粒体与疾病关联,探索线粒体在疾病如代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病、肿瘤中的作用。也可以关注线粒体与衰老:探索线粒体在细胞老化和衰老过程中的作用,以及线粒体相关的抗衰老策略。

         炎症,关注炎症发生机制、炎症与免疫调节、炎症与疾病关联、炎症调控与药物研发

         细胞自噬(autophagy),可以研究:不同细胞器引起自噬的机制,包括:线粒体自噬;内质网应激诱导的自噬;细胞核相关自噬;溶酶体相关自噬;过氧化物酶体介导自噬;核糖体介导自噬;多种细胞器相互作用调节自噬。自噬与免疫,自噬与衰老。注意几个热点交叉加分不少。

         甲基化:重点关注m6A、m7G。

         细胞死亡关注:细胞焦亡(Pyroptosis)、铁死亡、铜死亡、双硫死亡、泛凋亡

       干细胞:干细胞与疾病机制,干细胞与疾病治疗

       肿瘤微环境:肿瘤微环境中成纤维细胞(cancer associated fibroblasts, CAF)和巨噬细胞(cancer associated macrophages, TAM)的异质性研究。

        细胞衰老,在组织重塑、伤口修复、胚胎发生中发挥重要作用,细胞衰老在国自然申请中越来越占据优势,细胞衰老相关的生物标志物也成为近年科研的热点。

       另外,转录因子、长非编码RNA、miRNA、circRNA结合以上热点值得研究和关注。

        以上基因列表奥科医学都有验证过q-PCR引物、过表达质粒和RNA干扰质粒,也欢迎咨询。

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免疫基因集(各种变形一直在发文在路上)
题目A novel immune-related genes prognosis biomarker for melanoma: associated with tumor microenvironment
杂志: aging-us | IF:4.831
内容:WGCNA 免疫预后signature 

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