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2024年3月小分子药物专利-特别关注

 liuherotao007 2024-05-12 发布于甘肃

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1.OX2R激动剂 US20240076283A1

取代哌啶基化合物及相关治疗方法

本发明涉及取代哌啶基化合物,特别是具有激动剂活性的取代哌啶基化合物。
食欲素(Orexin)是一种神经肽,由下丘脑外侧及其周围区域内的神经元亚群合成和释放。它由两种亚型组成:食欲素 A 和食欲素 B。食欲素 A 和食欲素 B 与食欲素受体(OX1R,OX2R)结合。食欲素受体是优先在大脑中表达的 G 蛋白偶联受体。食欲素受体有两种亚型(1 型和 2 型)。已知食欲素受体的激活对于多种中枢神经系统功能很重要,例如维持清醒、能量稳态、奖励处理和激励。
发作性睡病是一种神经系统疾病,会导致白天过度嗜睡、突然发作的肌肉麻痹(猝倒)和睡眠模式紊乱。众所周知,发作性睡病是由食欲素神经元退化引起的。可以在被改造为退化食欲素神经元的转基因小鼠中模拟发作性睡病症状,并且可以通过心室内施用食欲素肽来逆转它们的症状。对食欲素 2 受体敲除小鼠的研究表明,食欲素 2 受体在维持清醒方面发挥优先作用。因此,食欲素-2受体激动剂可以作为治疗发作性睡病或表现出白天过度嗜睡的其他疾病例如帕金森氏病的治疗药物。
对食欲素-2受体具有激动剂活性的化合物可用作发作性睡病、特发性嗜睡症、嗜睡症、睡眠呼吸暂停综合征、昏迷等意识障碍、发作性睡病综合征、嗜睡症等的新型治疗药物,其特征在于过度睡眠。
已经报道了一些具有食欲素-2受体激动剂活性的化合物。然而,这些化合物例如在活性、药代动力学、脑/中枢神经系统渗透性或安全性方面并不令人满意,需要开发更高活性的激动剂。
专利保护结构通式如下:

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专利中,披露了45个化合物,以Cisbio IP1检测作为SAR分析。Cisbio IP1 是一种基于细胞的功能检测,可量化肌醇单磷酸 (IP) 的积累。肌醇单磷酸是一种代谢物,是食欲素 2 受体通过磷脂酶 C-Gq 信号通路激活而释放的结果。通过竞争性免疫测定,其中受体激活后细胞产生的 IP1 与 d2 荧光团(受体)偶联的 IP1 类似物竞争,以与 Eu 穴状化合物(供体)标记的抗 IP1 单克隆抗体结合。测得的基于 HTRF-FRET 的信号与产生的 IP1 浓度成反比。给出的IC50<100nM。

此外,检测了MDCK-MDR1渗透性,肝细胞代谢稳定性,大鼠睡眠中脑电图(EEG)和肌电图(EMG)。

 
2. TEAD共价抑制剂 WO2024059317A1
YAP/TAZ-TEAD癌蛋白抑制剂 
TEA结构域转录因子(TEA domain transcription factors, TEAD蛋白)是具有失调的Hippo肿瘤抑制途径信号传导的癌症中致癌YAP/TAZ信号传导的效应子。Yes1 相关转录调节因子(YAP1(Yes1 Associated Transcriptional Regulator),又名 YAP)、含有 WW 结构域的转录调节因子 1(WWTR1(WW domain-containing Transcription Regulator 1),又名 TAZ,YAP 的转录共激活因子旁系同源物)和 TEAD 蛋白之间存在相互作用。在这两种蛋白相互作用的情况下,蛋白质的相互作用都会导致 TEAD 转录活性和涉及增殖、存活、血管生成和其他癌症标志的基因表达增加。在正常组织中,完整的 Hippo 信号通过 MST1/2 和 LATS1/2 激酶导致 YAP/TAZ 磷酸化、细胞质中的隔离和蛋白体降解。NF2、MST 或 LATS 体细胞突变导致 Hippo 信号失活,稳定 YAP/TAZ 并导致核易位、与 TEAD 关联以及 TEAD 靶基因激活。YAP/TAZ 的基因组扩增或导致 YAP/TAZ 组成型活性的基因融合是 Hippo 通路失调的替代机制。此外,YAP/TAZ 信号传导的激活已被描述为对其他靶向癌症疗法(例如 EGFR 和 MEK 抑制剂)产生耐药性的机制。 
因此,TEAD1、2、3和/或4的抑制剂在癌症治疗的应用中可以具有巨大的潜力,既可以作为Hippo途径信号传导失调的癌症的单一疗法,也可以作为与其他靶向药物的组合疗法。
本专利披露了一类有效的作为 YAP/TAZ-TEAD 癌蛋白共价抑制剂的小分子化合物,可用于癌症治疗。
其结构通式如下:
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专利中,披露了106个化合物。以MCF7-TEAD-Luc报告基因测定法(BPS #60618)评估化合物抑制TEAD依赖性转录的能力。使用 ONE-Step Luciferase Assay System测量荧光素酶信号。活性最优的分子活性IC50<10nM其次,进行了增殖和活力测定在多个细胞系(NCI-H226,NCI- CPA,H2052)中评估了化合物抑制细胞增殖和活力的效力和功效。用CellTiter-Glo 2.0细胞活力测定法(Promega #G9243)测量活细胞,IC50<100nM。最后,进行了TEAD 选择性测定,对TEAD1/2/3活性较好。

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对体内活性最优的三个化合物进行了小鼠体内PK和药效(30-150 mg/Kg)测定。

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3. 大环类(Macrocyclic)的LRRK2抑制剂  WO2024056775A1

大环类LRRK2( leucine-rich repeat kinase 2,亮氨酸重复序列激酶2) 抑制剂

帕金森病(PD)是一种神经退行性疾病。它是继阿尔茨海默病之后第二常见的神经退行性疾病,影响超过 1% 的 65 岁以上人群。帕金森病的临床特征是静止性震颤、运动迟缓、肌肉僵硬和姿势不稳定。除了运动症状外,许多患者还存在其他症状,例如神经精神症状,在疾病晚期,通常会出现帕金森病痴呆。从病理学上讲,该疾病的特征是多巴胺能神经元丧失,随后大脑中多巴胺水平下降,以及蛋白质α-突触核蛋白在多巴胺能神经元中聚集。这些聚集体称为路易体,由多种元素组成,但在路易体中大量发现了丝氨酸 129处磷酸化的不溶性 α-突触核蛋白和泛素。

目前帕金森病的治疗干预策略旨在通过施用左旋多巴或单胺氧化酶 B 抑制剂来提高多巴胺水平。作为替代方案,施用多巴胺激动剂来刺激多巴胺能受体,其效果类似于通过增加多巴胺水平获得的效果。尽管这些疗法为患者提供了显著的症状益处,但它们也与不良副作用相关,并且在长期治疗和基础疾病进展后往往变得无效。重要的是,现有的疗法都没有解决潜在的致病问题,即多巴胺能神经元的逐渐丧失。

LRRK2是一种 2527 个氨基酸的蛋白质,参与催化蛋白质磷酸化。越来越多的证据表明 LRRK2 与帕金森病发病机制之间存在关系。改变 LRRK2 功能结构域中氨基酸的单核苷酸多态性已被证明会导致常见和散发性帕金森病。已鉴定出几种此类致病性变异,包括 G2019S、I2020T、N1437H、R1441C、R1441G、R1441H 和 Y1699C。LRRK2 相关帕金森病最常见的致病形式是 LRRK2 蛋白激酶结构域中的氨基酸取代 G2019S。G2019S 帕金森病以常染色体显性遗传方式遗传,表明 LRRK2 蛋白存在功能获得性突变。生化研究表明 G2019S 和其他致病性 LRRK2 变体都会导致 LRRK2 激酶活性增加。与 LRRK2 突变相关的帕金森病的临床和病理特征与特发性帕金森病非常相似。对于具有此类 LRRK2 激活突变的患者,过度活跃的 LRRK2 与帕金森病的发病机制有关,并且 LRRK2 抑制剂可用作熟悉的帕金森病的疾病修饰治疗。此外,对常见外显子多态性变异的研究突出显示了几种 LRRK2 帕金森病风险变异,包括亚洲人群中常见的 A419V 和 G2385R。LRRK2 还有一种激酶活性降低的保护性变体,例如 LRRK2 N551K R1398H 变体,表明野生型 LRRK2 活性在帕金森病中并非最佳,进一步支持了 LRRK2 抑制在特发性帕金森病中的潜力。

在功能上,LRRK2 通过 RAB GTP 酶的磷酸化影响溶酶体和其他囊泡的运输,并且 PD 相关基因富集参与溶酶体功能和自噬的基因。与帕金森病相关的两个基因 VPS35 和 RAB29 已被证明与 LRRK2 生物学直接相互作用,因为它们增加了 LRRK2 活性,并且如上所述,LRRK2 相关的帕金森病与特发性 PD 非常相似。总之,这有力地支持了 LRRK2 抑制在特发性 PD 治疗中的相关性。

制药行业和学术界都对开发有效的选择性 LRRK2 抑制剂非常感兴趣,因为它们在治疗帕金森病和其他突触核蛋白病方面具有巨大的前景。LRRK2 抑制剂的历史发展在文献中有详细描述。尽管制药行业和学术界的重点一直放在设计新的 LRRK2 抑制剂上,但设计一种脑渗透性、强效、选择性 LRRK2 抑制剂的任务仍然是药物化学界面临的挑战。目前,仅有 Denali Therapeutics 的两种分子(DNL201 和 DNL151)已进入临床阶段。

在此背景下,提供具有良好药代动力学特性、同时保持高效力和良好选择性的 LRRK2 抑制剂仍然是一个高度未满足的需求。

本专利惊奇地发现一系列大环化合物是 LRRK2 抑制剂。其通式为:

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专利中对30个化合物进行了SAR分析。LRRK2 野生型和 G2019S 激酶活性测定,使用 Invitrogen (Life Technologies Corporation) 的 LanthaScreen 激酶活性测定法测量 LRRK2 激酶活性。该测定法是一种均质时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 测定法,其测量由于 LRRK2 激酶活性而导致的荧光素标记肽底物 (可从 Life Technologies Corporation 获得的荧光素-ERM LRRKtide) 的磷酸化。磷酸化肽被铽标记的磷酸特异性抗 LRRKtide 抗体 (pLRRKtide 抗体,可从 Life Technologies Corporation 获得) 识别,随后,可以通过铽供体和荧光素受体之间的 TR-FRET 程度来量化磷酸化的 LRRKtide。 

LRRK2 野生型 ADP-Glo 方法使用 Promega Corporation 的 ADP-Glo 激酶测定法测量 LRRK2 激酶活性。该测定法是一种基于均质发光的测定法,用于测量由激酶反应形成的 ADP。ADP 转化为 ATP,用于在荧光素反应中产生光,产生的光与激酶活性相关。可以看到大环分子具有非常高的活性,IC50~0.2nM,且具有较高的选择性>2.6倍。

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此外,还进行了激酶选择性,脑分布,肝细胞稳定性,微粒体稳定性测试。

4. Nav1.8抑制剂 US20240083896A1

含氮 2,3-二氢喹唑啉酮化合物作为 Nav1.8 抑制剂

疼痛是动物避免潜在组织损伤的一种保护机制,然而,在许多疾病迹象中,疼痛已经失去了其作用,并成为一种致残的负担。疼痛不再有效的适应症可大致分为以下几类:神经损伤或损伤是触发因素(神经性疼痛);炎症反应或代谢失调使疼痛反应敏感(炎症性疼痛);以及损伤引起的疼痛,或外科手术导致疼痛反应短期升高(术后/动态疼痛)。
电压门控钠通道通过设定阈值和动作电位的上升,成为所有可兴奋组织中电信号传导的基础。电压门控钠通道有九种不同的亚型。Nav 1.1、Nav 1.7、Na v 1.8 和 Nav 1.9 的那些主要表达于它们控制的周围神经上神经元的兴奋性。Na v 1.5 是心肌细胞中表达的主要钠通道亚型,Na v 1.4 在骨骼肌中表达并发挥作用,而 Na v 1.1、Na v 1.2、Na v 1.3 和 Na v 1.6 广泛表达于中枢神经系统 (CNS) 中,并在一定程度上表达于周围神经系统中。这九个电压门控钠通道的主要作用是相似的,因为它们控制钠流入细胞,但它们的生物物理特性各不相同,这极大地影响了各自细胞类型的生理特征。
目前,非选择性钠通道抑制剂在临床上用作抗心律失常和抗癫痫治疗,包括利多卡因、卡马西平、阿米替林和美西律。然而,由于这些药物在不同的钠通道同种型之间缺乏选择性,因此它们的治疗效用由于主要由中枢神经系统和心脏活性介导的不良副作用而大大降低。这促使人们努力开发对特定钠通道亚型具有选择性的新药物,以避免中枢神经系统和心血管系统的副作用。
Na v 1.8 通道在背根神经节 (DRG) 的神经元中表达,并在该组织的小直径神经元中高度表达,这些神经元形成疼痛感知 C 神经纤维和 Aδ 神经纤维。Na v 1.8 最接近的分子同源分子是 Na v 1.5,其序列同源性约为 60%。
Na v 1.8 可作为疼痛适应症的治疗靶点。Na v 1.8 已被证明在 DRG 神经元动作电位上冲期间传导大部分电流,并且由于其重新启动速率对于这些神经元重复放电。据报道,Na v 1.8 的表达和功能增加是对疼痛刺激的反应,例如炎症介质、神经损伤以及疼痛性神经瘤。敲除小鼠体内编码 Nav1.8 的基因会导致疼痛表型减轻,尤其是炎症挑战时的疼痛表型。敲低编码 Na v 1.8 的 mRNA 也会导致啮齿动物模型中疼痛表型的减少,特别是在神经病理模型中。通过选择性小分子抑制剂进行的药理学干预已在啮齿动物炎症性疼痛和神经性疼痛模型中证明有效。
因此,需要开发新的化合物,特别是用于治疗疼痛和疼痛相关疾病、病症和病症以及心血管疾病、病症和病症的Na v 1.8抑制剂。
本专利通过提供具有Na v 1.8抑制活性的化合物以及此类化合物在治疗疼痛和疼痛相关疾病、病症和病症以及心血管疾病、病症和病症中的用途来满足该需要。
本发明涉及式(I)的化合物:

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专利中共披露了23个化合物。利用 QPatch 48 HTX 系统中的电压钳模式,使用半失活状态电压方案 (V 1 /2) 来确定本发明化合物在 Na v 1.8 离子通道的药理活性。IC50 ~5.3-7.9nM。有关PK,药效数据并未披露。

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