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| 共 11 篇文章 |
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果蝇Hox基因簇内研究的首个lncRNA是Bxd (似双胸转录本，Bithoraxoid)，其基因座是位于UBx基因(超级双胸基因，Ultrabithorax)和Abd-A基因之间的调控序列——ubx-TRE (Ubx基因相关顺式三胸复合体反应元件，Ubx cis-regulatory trithorax response elements)。目前定义了两种印记基因簇：Igf2r、Kcnq1、Gnas、Pws等印记基因簇的DMR在卵子成熟过程... 阅1 转自蹦蹦跳跳z 公众公开 20-03-07 10:55 |
LncRNA报告全新升级，快来接招！LncRNA的研究正在如火如荼地进行，越来越多的lncRNA被发现，并且越来越多的lncRNA数据库被建立并完善。1. 对于已知的lncRNA，想预测lncRNA的保守性，比如在人和小鼠中某条lncRNA是否保守（当然我们知道lncRNA是很不保守和很不稳定的）。今天我们就基于一个很强大的lncRNA数据库——NONCODE进行lncRNA保守性分析... 阅1 转自苏西suzy... 公众公开 20-01-18 23:00 |
长链非编码RNA（long non-coding RNA，LncRNA）一般指不具有蛋白编码能力，转录本长度超过200 nt的RNA分子，包括intronic/exonic lncRNAs、antisense lncRNAs、overlapping lncRNA和long intergenic ncRNAs（lincRNAs）。LncRNA-mRNA或LncRNA-lncRNA interaction调控生物学功能研究。再通过生信流程分析鉴定到3515个intergenic lncRNAs（88.29 ... 阅220 转0 评0 公众公开 20-01-14 10:13 |
根据lncRNA在基因组上与附近mRNA的位置关系， lncRNA可以分为以下五种类型：细胞内除mRNA之外，还存在另外一些RNA分子，比如长链非编码RNA（lncRNA）也存在miRNA应答元件（MRE），当lncRNA与mRNA存在相同的MRE时，他们之间构成了竞争相同种类miRNA的关系，换句话说，细胞内lncRNA表达水平的高低，直接影响了可被相应mRNA结合的miRNA数量的多少... 阅1 转自田瑞t59i6... 公众公开 20-01-14 10:11 |
LncRNA的功能到底怎么查询和预测-数据库和算法盘点文章来源：企鹅号 - 爱上科研有点难。LncRNA-长链非编码RNA (Long non-coding RNA, lncRNA) 是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，目前多个lncRNA与多种疾病的关系，已经被逐渐建立，很多机制也在逐渐被揭开，目前已知功能的以及明确关联疾病的lncRNA还是少数派。LncRNA2Target LncRNA靶点数据库... 阅790 转7 评0 公众公开 19-04-01 08:25 |
lncRNA定位预测，推荐一个简单易用的小工具！如题，今天介绍一个预测lncRNA定位的网站——lncLocator：long non-coding RNA subcellular localization predictor.参考文章：The lncLocator: a subcellular localization predictor for long non-coding RNAs based on a stacked ensemble classifier.Bioinformatics 2018 Feb 15. 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-04-01 08:07 |
LncRNA定位：一键预测，基于深度学习的LncRNA亚细胞定位。那么做LncRNA相关的研究，就需要做LncRNA的亚细胞定位，进而决定接下来的研究方向，但是LncRNA的定位实验（FISH实验）昂贵而且耗时，因此迫切需要一个数据库来预测LncRNA的定位。lncLocator是基于深度学习（Deep Learning）来预测lncRNA亚细胞定位，只需要输入核苷酸序列，即可快速得到... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 19-03-28 10:55 |
有趣的是，随着研究的深入，人们发现肿瘤细胞表面表达的免疫监测点相关蛋白的高低，肿瘤细胞周边以及肿瘤基质中哪类免疫细胞浸润分布（例如杀伤性T细胞或是抑制性T细胞，血液来源淋巴细胞或是骨髓来源单核细胞），肿瘤周边分布浸润细胞分泌的细胞因子类型（例如IFNγ, TNFα等）都与肿瘤的生长，抑制或药物治疗存在着紧密关系。三、RNAscope原... 阅116 转2 评0 公众公开 18-09-19 18:30 |
有趣的是，随着研究的深入，人们发现肿瘤细胞表面表达的免疫监测点相关蛋白的高低，肿瘤细胞周边以及肿瘤基质中哪类免疫细胞浸润分布（例如杀伤性T细胞或是抑制性T细胞，血液来源淋巴细胞或是骨髓来源单核细胞），肿瘤周边分布浸润细胞分泌的细胞因子类型（例如IFNγ, TNFα等）都与肿瘤的生长，抑制或药物治疗存在着紧密关系。一、RNAscope方... 阅161 转4 评0 公众公开 18-09-19 18:29 |
研究LncRNA的一种新方法---RNAscope技术。RNAscope 是基于独特的探针设计和信号放大方法的原位杂交方法。每个RNA分子只需三对双Z RNA探针结合到目标RNA就可以检测到信号，该方法的高灵敏性使RNAscope平台具有原位检测人类转录组中大多数基因的能力，很多低丰度的RNA也可以清晰的显示空间位置。LncRNA没有蛋白产物，因此要在体内检测LncRNA的表... 阅1 转自柳叶刀star 公众公开 18-09-18 23:30 |
