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肺癌除了生化检查、影像学检查外，对肺癌诊断最有价值的检查方式要数穿刺活检，但是穿刺检查有一定风险，在检查过程中会遇到三类问题。
第一，肺是一个因呼吸而不断活动的器官，在呼吸的过程中肺组织是一起一伏的，肿瘤也随之起伏，位置并不固定。实施穿刺活检手术期间为了让肺组织尽可能稳定，我们会让患者短时间憋住气。但患者在每次憋气时很难保证吸入气体的量完全一致，即使对没有疾病的成年人来讲也很难控制，这样就会造成穿刺时的误差。
第二，对于位处肺内深方的肿瘤，如果临近心脏和大血管部位，由于心脏持续跳动，肿瘤也会在肺内有一个活动范围，但CT只能扫描到其中某一个时刻的位置，医生需要抓住它的活动规律进行准确穿刺。这是一个特别复杂的过程。
第三，肺部穿刺活检过程中出现并发症的种类远远多于其它部位，受到并发症引起的不适感觉的刺激，患者的配合度可能会下降，穿刺操作也要及时、适时调整。
肺癌穿刺活检操作需要医生有丰富的临床经验，当影像学、生化检查不能确诊时穿刺活检是最佳选择，但建议患者找有经验的医生进行这类诊断，穿刺活检就好比在打移动的靶子，难度大，风险高。
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