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(文章篇)S4E09: 做microRNA研究,提升文章档次的三个锦囊。

 op1116 2016-07-31

大家好,今天我们介绍这篇文章:MicroRNA-143 Activation Regulates Smooth Muscle and Endothelial Cell Crosstalk in Pulmonary Arterial Hypertension.Circ Res(IF 11.0). 2015 Oct 23;117(10):870-83. (全文下载链接:http://pan.baidu.com/s/1nvkw6ed 密码:ytw9),并在文后总结部分给大家提升文章档次的三个锦囊。

首先我们看文章的机制图:


在PASMC(肺动脉平滑肌细胞)中,肺动脉高压发生相关信号通路通过激活miR-143/145启动子活性调节miR-143/145的表达。 在血管重构过程准哦功能,MiR-143-3p作为旁分泌信号来介导细胞运动、调控凋亡。在PAH(肺动脉高压)进展过程中,PASMC分泌包含miR-143-3p的外泌体,并被转运到PAEC(肺动脉内皮细胞)诱导细胞的运动和血管生成。

这篇文章的内容包括三部分:

1. MiR-143在PAH动物模型、病人样本中高表达,而且miR-143/145的表达激活是由于其启动子上游区域含PAH相关信号通路中转录因子结合位点所导致;


2. MiR-143体外功能:影响PASMC的运动和凋亡;而MiR-143敲除或者抑制后改良了缺氧导致的PAH表型;


3. MiR-143通过PASMC分泌的外泌体传递到PAEC,并调节PAEC的运动和血管形成能力。

我们先看一下PASMC与PAEC的共培养体系(与Transwell非常像):


作者分别用共培养体系和来源于PASMC的培养基,来评估含MiR-143的外泌体从PASMC分泌到PAEC,并对PAEC运动能力的影响。



然后评估PASMC来源的外泌体中miR143对PAEC运动和血管形成能力的影响。



最后总结一下,这篇文章有几个关键词:microRNA;外泌体;肺高血压;转录调节,这篇文章之所以能发11分,我们有哪些亮点可供参考,以帮我们提升文章的档次:

  1. 不走下游走上游:作者选microRNA143/145簇(cluster)作为关键分子,对microRNA的经典套路来说,一般会从下游着手,比如预测靶基因,然后在PASMC中验证microRNA143/145在PASMC中的功能(运动、凋亡),然后通过荧光素酶报告基因实验证明microRNA143/145对靶基因的调控;而作者呢,则反其道而行之,研究microRNA上游的因子对表达的调控,此为亮点一;当然,对microRNA启动子和转录因子结合位点的分析验证、以及对甲基化等其他可能调控microRNA表达因素的排除也是我们学习的地方;

  2. 引入热点:外泌体,在通过PASMC验证了microRNA143的功能后,作者进一步研究了外泌体中的microRNA143在PASMC与PAEC细胞通讯中的作用,在对外泌体进行大小、电镜、Marker等方式进行鉴定后,通过共培养体系、条件性培养基两方面验证外泌体在PASMC与PAEC细胞通讯中的作用,实验设计和方法都很经典,所以做microRNA研究的小伙伴,除了常规实验外,可以考虑外泌体作为加分点哦!

  3. 体内实验表型逆转考虑到动物实验的复杂性,体外细胞实验的表型有一定概率在动物实验难以重复,不可否认,作者通过体内动物模型实验对microRNA143的进行了干预,并逆转了PH的表型,这是本文加分的第三点。

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