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这里如果再加一个干扰掉过表达miR-644a细胞中PITX2,确认细胞的表型,才能更加说明问题:miR-644a通过PITX2起作用。另外,作者通过TOP/FOP flash荧光实验(测定细胞内beta-catenin介导的转录活性的方法)发现报告基因的表达受到miR-644a抑制,表明miR-644a抑制β-catenin转录。上述第三部分内容已经证实,miR-644a能阻遏Wnt/β-catenin通路,所...
而KHSRP能促进miR-192-5p成熟并作用许多EMT因子,且KHSRP能够控制很多pre-RNAs选择性剪切,以维持细胞上皮表型状态,从而抑制EMT作用。细胞过表达KHSRP后,作者对RNA进行测序,随后分子功能的GO分析发现,KHSRP调控的转录组参与了大量的细胞进程,如侵袭迁移,粘附等。作者发现,沉默了KHSRP后并不影响前体miR-192的水平,但是成熟的miR-192-5p...
miR-644a靶向CTBP1的mRNA(CTBP1能促进肿瘤生长、转移、耐药),所以,miR-644a这里表现为一个抑癌分子。miR-644a下调CTBP1,上调野生型p53或突变型p53,能通过诱导p21或Noxa分别引起细胞G1阻滞或细胞凋亡。干扰掉CTBP1能降低细胞生存能力,且在p53突变细胞中能提升细胞凋亡,这部分跟第一部分内容过表达miR-644a串到一起。由于miR-644a与CTBP1...
MiR-9 and miR-200 regulate PDGFRβ-mediated endothelial differentiation of tumor cells in triple negative breast cancer. ( Cancer Research )作者选择了两个miRNA,分别为miR-9,miR-200.文章中,并未提到为什么选这两个miRNA,有可能是看了已经报道过的文献,然后做了前期预实验,如表型、功能实验,也有可能做了一些中通量筛选工作。...
在 MYCN非扩增型神经母细胞瘤中,LIN28B/let-7/MYCN这一信号轴存在,LIN28B下调let-7和上调MYCN,但是在MYCN扩增型神经母细胞瘤中LIN28B上调MYCN的作用就失效了。这一部分把神经母细胞瘤按照MYCN是否扩增进行了分型,然后分别讨论在不同的肿瘤里面LIN28B/let-7/MYCN这一信号轴是否存在,并讨论了在LIN28B下调let-7和MYCN扩增这两个作用力下,MY...
一共检索到40项,其中lncRNA与SNP为主题的只有5和28两项,SNP与microRNA相关的有38项,大多数研究分为两类:microRNA本身的SNP(比如启动子区域的多态性)和靶基因的SNP(比如3‘UTR区多态性),分别影响microRNA的表达和对靶基因的调控。SNP位点rs2147578的不同基因型通过影响miR-128-3p对lnc-LAMC2-1:1 的结合与调控能力,影响lnc-LAMC2-1:1 ...
胶质瘤干细胞能提升表达let-7的miRNA水平以及其靶基因,包括IMP2。在胶质瘤干细胞中,当LIN28B缺乏,能提升let-7miRNA水平,以及let-7miRNA的靶基因。在胶质瘤干细胞中,RNA结合蛋白IMP2高表达,它是let-7靶蛋白。PAR-CLIP技术发现,miRNA结合蛋白2结合到let-7的miRNA识别元件,防止let-7的靶标基因沉默。因为在常见的肿瘤及胚胎干细胞中,let-...
引入热点:外泌体,在通过PASMC验证了microRNA143的功能后,作者进一步研究了外泌体中的microRNA143在PASMC与PAEC细胞通讯中的作用,在对外泌体进行大小、电镜、Marker等方式进行鉴定后,通过共培养体系、条件性培养基两方面验证外泌体在PASMC与PAEC细胞通讯中的作用,实验设计和方法都很经典,所以做microRNA研究的小伙伴,除了常规实验外,可...
LincRNA-EPS是一个免疫调控lincRNA,在巨噬细胞中被精确调控,来控制免疫应答基因(IRGs)的表达。作者使用TLR2刺激巨噬细胞后,通过RNA测序确定了下调的lincRNA-EPS,而EPS在静息的巨噬细胞中是高表达的,那么作者认为EPS可能调控了IRG表达。4、在静息巨噬细胞中,EPS与染色质关联着的-引出调控IRG原因。通过ChIP实验发现,缺乏EPS的细胞,RNA...
好吧,作者再次直接看蛋白降解,我们一般是这么来做的:先做CARM1的IP+质谱,筛选下那些蛋白与CARM1结合的蛋白,然后再挑泛素连接酶,于是就出现了SKP2,那么这里的因素变量就是SKP2了:下面就是证明CARM1与TFEB的作用对下游基因和H3R17me2的影响了,这里的研究内容包括:CARM1与TFEB的结合,因素变量CARM1、TFEB和H3R17me2的干预对下游基因通...
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