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(文章篇)S5E25:在microRNA和肿瘤研究的红海中,如何杀出一条血路发8分文章?

 op1116 2016-07-31

之前就听老板教诲:科研,没有绝对的过气明星。科研讲求的是延续性工作。在最新一期lancet oncology上,收录了两篇miRNA相关的文章。

Development and validation of a microRNA-based signature (MiROvaR) to predict early relapse or progression of epithelial ovarian cancer: a cohort study.

A prognostically relevant miRNA signature for epithelial ovarian cancer.

作为普通科研工作者,不可能人人都要最求极致,发篇10分左右的“那也是极好的”。

今天,我们就来依葫芦画瓢,看一篇Cancer Research上最新的一篇miRNA文章吧。


MiR-9 and miR-200 regulate PDGFRβ-mediated endothelial differentiation of tumor cells in triple negative breast cancer. ( Cancer Research )

下载链接:http://pan.baidu.com/s/1i5oBCkH    密码:i9wm

A分子在B疾病中调控Y蛋白介导了Z功能,也是青年基金的模式。



在多年前,做miRNA与肿瘤相关研究发Can Res会比较容易。那么这篇文章有什么亮点呢。本文主要讲了2个miRNA分子,在三阴性乳腺癌中,通过不同的方式调控了同一个靶标蛋白,引发了不同作用


直接看内容:

1、细胞实验作者选择了两个miRNA,分别为miR-9,miR-200.文章中,并未提到为什么选这两个miRNA,有可能是看了已经报道过的文献,然后做了前期预实验,如表型、功能实验,也有可能做了一些中通量筛选工作

血管新生,是肿瘤形成的关键因素。三阴性乳腺癌是乳腺癌中预后最差的,实验中的细胞株选择也很关键。miR-9能促进微管生成,并且通过沉默miR-9实验,验证了这种作用。前期已经报道miR-9与PDGFRβ有调控作用,并且作者做了验证。结合这部分实验,表明miR-9有助于PDGFRβ诱导的血管新生。


并且,作者跟临床验证。在三阴性乳腺癌中,miR-9是过表达的,其预后非常差。图见supplementary。



2、机制研究miRNA通过作用于mRNA,影响后者的表达。那么作者想了解是否miR-9通过抑制某些mRNA功能,来促进血管新生作用

由于在管腔乳腺癌与Basal型乳腺癌中,miR-9表达水平是有很显著差异的。作者通过TCGA预测工具,发现了一个具有差异表达蛋白STARD13。前期报道该蛋白与细胞迁移侵袭能力有关。实验也发现,减少STARD13表达能加速血管新生。且miR-9能结合到STARD13的mRNA上,实现对后者的表达的抑制作用。


miR-9抑制STARD13促进PDGFRβ表达

下面是另外一个miRNA,看看它的调控方式。


3、下面开始讲另外一个miRNA,miR-200。跟前面类似,只不过miR-200能抑制血管新生。另外miR-200能抑制PDGFRβ表达。


虽然miR-200抑制了PDGFRβ,但是能提升钙黏蛋白表达。且这种现状是抑制了ZEB1的特征,ZEB1是miR-200的靶标分子。


所以作者认为这里涉及到ZEB1/PDGFRβ串联调控作用。和预期一样,敲除ZEB1能减少血管新生的能力,且能同时降低PDGFRβ的mRNA与蛋白水平。


so,miR-200通过靶向ZEB1来抑制PDGFRβ,实现抑制血管新生作用。


4、动物实验miR-9、miR-200调控调控体内脉管腔形成

重症联合免疫缺陷小鼠的乳腺脂肪垫注射sponge miR-9细胞,或过表达miR-200细胞。结果发现miR-200过表达小鼠,能显著抑制体内肿瘤大小。而抑制miR-9表达的实验组,这种作用不明显。




5、组织样本实验。IHC实验是最为常见的肿瘤实验之一。前期报道CD31是确定人三阴性乳腺癌血管腔标志物。作者发现,PDGFRβ也能作为确定三阴性乳腺癌血管腔标志物。


总结一下,作者挑了2个分子(自己筛或找的,然后验证),功能验证,扯之前报道过的功能分子,机制验证。动物做一下,临床样本做一下,好了就这样。lncRNA也可以这么做的嘛。





That’s all. Thank you!



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