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发高分SCI文章一招鲜吃遍天——前列腺癌篇

 微笑如酒 2017-04-27

临床医生朋友们,是否还苦于写课题写文章没有好思路?Dr.S教你一招让你吃遍天,前几期我们介绍了肺癌肝癌胃癌胰腺癌等癌症,今天我们来介绍一篇前列腺癌的文章;我们解析2017年发表在oncogene上的文章,还是用我们经典的ABCD四要素模式来分析一下。

直入主题,我们先解读一下题目:Collapsin response mediator protein-1 (CRMP1) acts as an invasion and metastasis suppressor of prostate cancer via its suppression of epithelial–mesenchymal transition and remodeling of actin cytoskeleton organization

又是A基因通过B基因/信号通路在C疾病中发挥D功能,今天就是要教你用这招4要素。

这是一篇典型的基因“移植研究”,值得我们学习借鉴,先听Dr.S娓娓道来。

A基因、C疾病的由来:

C疾病:本文章的研究肿瘤为前列腺癌 ,这完全取决于临床医生的所在领域。

A基因的由来:

前列腺癌面临和其他癌症同样的临床难点问题---肿瘤细胞转移,这是很多癌症患者病情恶化的原因之一;EMT过程与肿瘤转移密切相关,本文章就是找了个基因阐述其在前列腺癌细胞EMT过程及转移过程中发挥的功能。(Dr.S小贴士:对于基因“移植研究”,这需要研究者具有丰富的文献阅读量和极强的基础科研背景),CRMPs家族在轴突生长和神经发育期分支发挥核心分子的作用,最早在神经发育过程中被报道。在转移性神经内分泌前列腺癌转基因小鼠模型中CRMP1高表达,推测其在促进神经内分泌分化中发挥重要作用;而CRMP1在前列腺癌细胞对EMT和转移的调控尚未得到研究证实。从临床疾病关键问题出发,发现基因的新功能,是这类肿瘤研究专业杂志很喜欢的思路。临床方面:免疫组化检测CRMP1不同Gleason scored lesions前列腺癌组中的表达量(Fig1)。

Fig1

D功能:

分别干扰CRMP1和过表达CRMP1情况下,划痕实验和侵袭实验验证CRMP1和前列腺癌细胞迁移的关系;同时检测上皮细胞标志分子和间充质细胞标志分子,判断CRMP1与EMT的关系。(Fig2和Fig3)

Fig2

Fig3

B分子机制----借用经典的EMT细胞模型

Snail在前列腺癌EMT和肿瘤细胞转移过程中发挥重要作用。在Snail过表达的前列腺永生化上皮细胞BPH-1中存在EMT表型,在此细胞模型中改变CRMP1的表达,采用Three-dimensional culture assay方法,检测CRMP1对EMT的调控功能(Fig4)。Snail CHIP实验证明其在CRMP1启动子区的结合(Fig5)。

Fig4

Fig5

Fig6

好了,又一个漂亮的故事诞生了,在前列腺癌细胞中Snail和组蛋白去乙酰化介导了CRMP1的低表达,进而促进肌动蛋白纤维的形成,导致EMT的发生。

文章解读小结:

1. 要发表高分的SCI文章,ABCD模式一招鲜吃遍天,发现A基因(转录组测序或表达谱芯片),阐述其在C疾病中的D功能:细胞学功能和动物模型;以及B信号通路:分子机制(上游+下游)、功能恢复实验。

2. 对于待研基因,阐述其在某种疾病中的功能:临床相关性、细胞学功能、分子机制(上游+下游)、信号通路、功能恢复实验、动物模型、实验结论的临床回顾,关键在于“新基因”—新疾病—新机制。

根据吉凯基因的经验,从样本出发芯片,测序,质谱方法高通量筛选新功能基因的概率大约在10%左右,想要筛选验证得到一个新功能基因的难度非常大。吉凯基因历经3年,斥资上亿,已完成近6000个肿瘤相关基因的功能学筛选,从中找到明确的肿瘤功能标志基因若干,等待您来寻宝~~~

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