不要只专注于 ATGC，甲基化修饰为你开辟研究新思路

提及遗传，我们都习惯于理解为基因组的编码信息存在于 ATGC 这四种碱基的排列顺序中。然而，诸如胞嘧啶的甲基化修饰及其分布、组蛋白的乙酰化等，同样影响着表型。这就构成了表观遗传学 (epigenetics) 的主要研究内容。

对于表观遗传学，比较统一的认识是，在细胞核 DNA 序列不改变的情况下，基因功能的可逆可遗传的改变。也就是说，不改变基因组序列，通过 DNA 和组蛋白的修饰等来调控基因表达。

而 DNA 甲基化 (DNA methylation) 在表观遗传学的研究中最为常见。DNA 甲基化是重要的表观遗传学标记信息，对生命活动非常重要，是基因调控的手段之一。DNA 甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记、胚胎发育、肿瘤发生等方面都起着至关重要的作用。

[可逆的 DNA 甲基化过程]

RNA 甲基化（m6A）是目前甲基化研究的新热点，m6A 甲基化是真核生物中最常见的一种转录组后修饰。已有研究表明，m6A 与 mRNA 剪切、生物钟调节、mRNA 稳定性等功能有关。

[可逆的 RNA 甲基化过程]

随着甲基化研究的不断深入，其检测方法也层出不穷。高通量测序的不断发展，更是大大提高了甲基化检测的分辨率、灵敏度、动态范围，获取更全面的甲基化信息。

甲基化研究手段特点

• 全基因组甲基化测序（WGBS）能绘制全基因组 DNA 甲基化图谱，检测到甲基化密度低的区域，检测精度高。
  

• MeDIP-seq，是通过使用 5’-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的 DNA 片段再测序的方法。价格相对低，适用广泛。

• MBD-seq，利用 MBD 蛋白富集高甲基化 DNA 序列区域，对富集到的 DNA 片段进行测序，从而检测全基因组范围内的甲基化位点。多适用于哺乳动物，实验相对稳定。

• 人 DNA 甲基化芯片，Illumina 850K 芯片，可检测 853,307 个 CpG 位点，保持了 450K 芯片 CpG 岛和启动子区覆盖，并加强了增强子区及编码区的探针覆盖。价格便宜，准确度高，可重复性好。

• RRBS，是通过酶切富集启动子及 CpG 岛区域后进行 BS 测序，具备单碱基分辨率，经济实用，更适用于人和小鼠。

• MeRIP-seq，则是借助二代测序技术通量高、快速高效的特点，将免疫沉淀方法与高通量测序技术结合，快速高效的检测基因组 m6A 甲基化的研究方法。