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微生物多样性高分文章是怎么炼成的

 萌小芊 2018-01-11















一、Melatonin prevents obesity through 

modulation of gut microbiota in mice 

褪黑素通过调节小鼠肠道菌群预防肥胖

IF:9.314 期刊:Journal of Pineal Research

时间:2017.03  合作单位:北京师范大学


 研究背景

肥胖是一个非常严重的健康威胁因素,在2014年全球体重超标的成年人达到20亿,其中至少有6亿是肥胖症。有大量研究表明肥胖是癌症和一些慢性疾病,如糖尿病、脂肪肝、心血管疾病等的风险因素。现如今肥胖已经超越吸烟,成为世界范围内最严重的健康威胁。目前研究表明肠道菌群失调会导致肥胖及其并发症的发生。已有研究揭示褪黑素可以促进体重的下降以及自身能量的平衡,但是褪黑素的益生作用是否与肠道微生态有关,目前尚未报导。而本研究发现,褪黑素是通过改变肠道微生物结构来预防肥胖及其并发疾病。


 研究方法

小鼠随机分为3组,NCD(正常膳食)、HFD(高脂肪膳食)、HFD+M(高脂肪膳食+褪黑素)Illumina MiSeq;

16S rRNA V3+V4;组织学分析,生化分析,葡萄糖和胰岛素耐受分析,蛋白质印记分析。













二、Associations among dietary non-fiber carbohydrate, ruminal microbiota and epithelium G-protein-coupled receptor, and histone deacetylase regulations in goats. 

发表于《Microbiome》杂志(IF=8.4973),其中高通量测序分析部分(微生物多样性和转录组)由百迈客协助完成。



 研究背景

在瘤胃中的短链脂肪酸(SCFAs)对反刍动物的生长和健康起着关键的作用,微生物G蛋白偶联受体(GPR)和微生物脱乙酰化酶(HDAC)可能是这些影响的主要调节通路。该研究主要是选用不同比例非纤维碳水化合物摄入(15-30%)的山羊模型,通过转录组测序和16srRNA测序联合研究瘤胃上皮细胞和瘤胃微生物协同的响应机制。通过研究发现,瘤胃中微生物来源的SCFAs对上皮细胞的生长和代谢受到GPR和HDAC调节网络的影响,通过对这些调控机制和饮食组成的相互关系的理解,可更深入的了解瘤胃的新陈代谢机制,更好的促进牧业的发展。


 研究方法

样品取材:共6只雄性山羊,随机分为两组,第一组饲养为65%的干草+35%的饲料(MC组),另一组为90%的干草+10%的饲料(LC组);喂养28d后进行取样。


微生物多样性样品:饲养第28天,在清晨喂养0h、2h、5h以及8h进行取样,瘤胃内容物用4层纱布取样 ,收集瘤胃液15ml,-20℃保存用于提取。


转录调控测序取样:取10cm2瘤胃组织,用冷却的PBS进行清洗,去除肌肉层,取上皮组织切块于TRIzol保存液保存。液氮速冻5min后,-80保存用于RNA提取。


短链脂肪酸(SCFAs)浓度测定:上述样品加入5%HgCl2用于浓度测定。


测序分析:

瘤胃内容物微生物多样性测序:细菌V3+V4区、Illumina Miseq 平台测序

瘤胃上皮细胞转录组测序测序: PE125 测序、Illumina Hiseq2500 平台测序


 文章研究总结

该研究得到的结果揭示,SCFA调节的GPR和HDAC共调控网络存在于瘤胃的上皮细胞,该共调节网络作用可作用于动物敏感精确地接受微生物区的信号调节,这些调控网络调节上皮细胞各种生理学过程,尤其是细胞的生长和新陈代谢,在促进动物的生长和维持上皮细胞的完整性起到关键的作用。此外,这些调控网络重要的调控机制对于共生的细菌来说,主要通过调节上皮细胞生理过程提高细菌在宿主中的共生条件。通过了解宿主动物和微生物区之间互相的调节机制,加上相应饮食中的外界干预调节因素,可以可持续性的更好的提高动物的健康和生长。



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