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学员心语,《三十六策》之心得体会(附科研常用网站)

 Jennymgozseons 2018-07-19

不经《三十六策》百般淬炼,如何领悟科研真谛?



大家好,我是格致书院14班的班长慧美,作为酸菜大大的一名迷妹,特别庆幸这个时代,一个科研小白通过网络就能获得“大神”的指点。确实,酸菜大大作为一名领路人在尽心尽力地为科研小白们保驾护航,只盼着大家能够乘风破浪,早日越过sci的门槛,问鼎科研之巅。


初涉科研,好奇之余不乏迷茫与困惑;磕磕碰碰的前行,效果也只是差强人意。虽然学习和成长总是伴随着痛苦和孤独,但有酸菜老师领衔的《三十六策》相伴,这条痛苦的路上至少没有那么孤独。


其实,无论学员们在科研哪个阶段感到迟疑、迷茫、焦虑,都可以回到《三十六策》课程中找到方向指引和坚持的理由。因为该课程总的纲要就在于八个字“知识体系和套路规范”,这其中又囊括“常识和常理”两部分,常识就是专业领域的知识点,而常理则是论证逻辑规律数据表达套路。


在紧紧跟随酸菜大大的脚步之后,我明白了宏观思维决定你思维的高度,但微观思维能够决定你工作的质量,一个课题既要有框架也要布满了细节。


做科研要想出类拔萃,分子机制研究是重中之重,因为它是基础科研的核心所在;文章创新的第一要义则在主变量,而因变量最好是能傍上明星通路或分子,尽量避免因新而任重,犯了医生科研的大忌。不同的表型背后是有着不同“大佬”(机制)在把控;又因基因的功能可以被代偿,则同一个表型背后的主管调控作用的boss也可能是不同的。


现已知晓,分子机制研究的本质是把分子和分子串联起来,然后追本溯源。此时,只需尽量挂靠一个明星分子,把问题解释清楚,story就完整了。而这就离不了Rescue实验的鼎力相助,毕竟它才是寻找关键信号转导途径的“金标准”,但也正因此,这块硬骨头也分外难啃,少不得要对《三十六策》反复琢磨品尝,才能彻底参透Rescue实验的十二字真言:正正反,正反正;反正正,反反反。


医生做科研,高分文章往往是高山仰止般的存在,之所以偏爱灌水发三分文章是因为其无机制研究,工作量大大减少。而要冲破3分的瓶颈,间接机制研究则必不可少;要跨过5分以上大关,不仅要看文章的创新能力、数据的完整度,一般还会涉及到分子和分子的直接调控机制。


大家都知道,高分文章所论证的工作量一般都是满满当当的,甚至有时还是过量的。且不说正文里逻辑严谨的数据与图片,就是补充材料罗列起来也是整整一箩筐,可以说文章所带的数据涉及了整个story的方方面面。


但归纳起来,高分文章的共性大致有3点:机制研究的深度,分子的创新以及通讯作者的影响力。


首先,机制要足够深且其内容完全是原创的。其中,机制的创新涉及主变量和因变量之间的调控关系是否已经有别人报道;而机制的深度则分直接还是间接。间接的瓶颈是五分以下,而直接可以做到五分起步。


就分子创新而言,一般主变量的创新可分为两种:一类是大的创新,是主变量跟表型之间完全没有报道过;其次是微创新,就是指主变量在其他的研究中有提示,可以得到这个结果。


其次,文章数据要有规范性,即是否该做的实验都做到了,对同一个问题是否用不同的实验相互佐证,推导结论数据是否可靠严谨,是否符合套路规范。泛读文章时,要有一个基本的数据框架,可把文章数据的归属自动进行归类。


如果后续大家需要亲自操刀实验过程,则需要对每个实验的原理和操作流程了如指掌,同时可大致预判每个实验的结果,如阴性/阳性的结果,此外,还要学会以相应的统计方法对实验结果进行分析。


现阶段的论文均是通过分子水平来解释一些疾病的基本发生发展过程,如分子表达变化、分子间的两两调控、多个分子构成的信号轴以及多条线组成的分子网络。至于相关论文研究套路的学习,这4个锦囊妙计分享给大家。


1)要总揽全局,同一疾病有哪些相关的表型需要宏观掌握。


2)要多读review以疾病为关键词进行搜索或者参考文献,学习相同的或者相似的实验设计。


3)要精雕细琢围绕某一确定的领域学习具体的研究套路。如多读一些article了解表型评价的标准,包括模型、诱导条件检测指标等,或者多读一些硕博论文来高效提取实验细节关键信息。


4)另外,老套路新分子是一种普遍性的移植研究思路。


(点击看大图)


最后,秉着好东西大家共分享的理念,我给大家分享一个非常nice的学术网站OPENI(网址:https://openi.nlm./ ),它最别具一格的是提供了一种查阅文献的新姿势——图片检索法,即通过输入关键词,首先可看到文章的实验结果图片,可以更形象快速的寻找目标文献。



以p53为例,按enter键后,可查看相关研究的结果图片,将鼠标停留在某张图片后,可看到图片的相关说明。



点击任意一张图片,可以查看相关的研究以及相应的图注,如图片来源的相应文章题目、摘要、有些甚至还包括实验方法、实验结果、以及结果讨论等。如果与自己的研究相关,可以根据题目去下载。



另外,科研逻辑论证的思维框架虽是科研者的驰骋科研领域的战略思想,但巧妇难为无米之炊,没有实验protocol的buff加持,一切都只是纸上谈兵、空谈而已。但要想实验做得好,靠谱的实验protocol则必不可少。


那么关于实验的protocol,以下这几个网站大家可以收藏之。


1)Nature protocol

网址:https://www./nprot/  



2)Springer Protocols

网址:http://www./



3)Cold Spring Harbor Protocols

网址:http://cshprotocols./



4)Jove实验视频网站

网址:https://www./  




5)Protocol Online

网址:http://www./  



6)赛默飞实验视频网络讲座

网址:

https://www./cn/zh/home/support/webinars.html



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