拿到基因两眼一抹黑？没关系，先做个基因富集分析吧！

随着测序技术的发展，基于特殊算法找到实验组与对照组的显著差异基因后，接下来就需要运用生物信息学的方法分析这些基因参与了哪些功能，常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析。今天为大家介绍两款基因富集网站。通过基因富集，我们可以初步分析基因可能参与的生物学过程或者信号通路。

一、DAVID

DAVID是常用的基因富集分析网站，主要用于差异基因的初步分析以及GO注释功能分析,目前是6.8版本。那今天我们就来看一下如何使用DAVID进行通路富集分析，网址https://david./。

1. 进入DAVID主页，选择并点击Functional Annotation

2.按照如下步骤操作：

Step1:将需要分析的基因复制在对话框内(选择A)，或者上传文件列表（选择B)。
Step2:选择基因命名方式，一般选择基因的官方名称OFFICIAL-GENE SYMBOL。
Step3:根据上传数据类型，选择gene list。
Step4:点击Submist list,提交基因。

3.提交基因后，网页会弹出提示框 ，点击确定。

4.网页出现以下界面时，首先点击background,选择需要分析的物种，点击use。

5.点击list，按以下步骤操作：

(1)点击list1; (2)选择Use; (3) 选择物种mus musculus; (4 )点击Select Species。

6.点击右侧栏clear all清空默认选项，然后根据自己想要分析的内容进行选择。比如 Gene Ontology可分为分子功能(molecular function），生物过程（biological process）和细胞组成（(cellular component)三个部分，比如选中Gene_Ontology下的GOTERM_BP_DIRECT。

7. 选择完成后，点击第二栏Functional Annotation Chart。

8. 以下输入基因列表所分析的GOTERM_BP_DIRECT结果，网站根据输入基因分析其可能参与的生物学途径（term），以及参与该途径的相关基因（count），点击即可查看基因的详细情况。

二、Metascape

Metascape提供自动化元分析工具，网站使用方法简单、方便、而且还是免费的。网站http:///gp/index.html。网站可以进行基因富集分析、蛋白质相互作用（PPI）分析以及Gene Ontology（GO）网络的交互式网络图的生成。

1. 进入网站后，按以下步骤操作：

Step1:将需要分析的基因复制至对话框内，或者选择列表进行上传。
Step2:选择基因物种。
Step3:点击expression analysist 。

2.数据上传结束后，点击Analysis report page，网站可生成pdf版分析数据供用户下载。

3.数据分析结果：根据输入基因进行GO注释分析，结果显示这些基因可能参与的生物学途径。

4.根据GO/KEGG分析的富集基因统计相似性分层聚类，构建基因网络图，基因簇的大小与落入该基因簇的基因数量成比例，并且其颜色表示其簇（生物学途径）的相关基因。