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20181123 | circRNA研究最近有哪些新进展?

 生物_医药_科研 2018-11-23

欢迎来到环状RNA研究新进展盘点,往期盘点可在公众号内回复“盘点”进行查看。那么,最近circRAN又有哪些新文章新进展发布?一起来看看吧。

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CircDYM通过靶向miR-9介导HSP90泛素化调控小胶质细胞活化,改善抑郁样行为

CircDYM ameliorates depressive-like behavior by targeting miR-9 to regulate microglial activation via HSP90 ubiquitination

期刊:Mol Psychiatry

影响因子:11.64

作者单位:东南大学

文章内容

circRNA在中枢神经系统中高度表达,参与多种调控过程,并涉及某些病理生理学。然而,circRNA在精神疾病,尤其是重度抑郁症(MDD)中的潜在作用,在很大程度上仍是未知的。在此,作者证明,无论是MDD患者外周血中的circRNA DYM (circDYM)水平,还是慢性应激(CUS)和脂多糖(LPS)两种抑郁样小鼠模型,均显著降低。circDYM表达的恢复明显减弱了CUS或LPS治疗诱导的抑郁样行为,抑制了小胶质细胞活化。进一步研究表明,circDYM作为内源性miR-9海绵抑制miR-9活性,导致下游靶基因HECTD1表达增加,HSP90泛素化增加,进而导致小胶质细胞活化减少。综上所述,研究结果证实了circDYM在抑郁症中的参与及其偶联机制,为circDYM可能成为抑郁症新的治疗靶点提供了转译证据。

2


胃肿瘤外泌体circRNA通过靶向miR-133/PRDM16通路促进白色脂肪褐变

Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway

期刊:Int J Cancer

影响因子:7.36

作者单位:天津肿瘤临床研究中心

文章内容

癌症相关恶病质是以脂肪和骨骼肌消耗紊乱为特征的代谢综合征,伴有体重减轻和全身炎症。癌症恶病质的治疗选择有限,其分子机制尚不清楚。circRNA是一种新的内源性非编码RNA家族,已被提出用于调控哺乳动物的基因表达。外泌体是来源于细胞的小泡,最近的研究表明circRNA在外泌体中是稳定的。然而,circRNA在外泌体中的生物学作用尚未清楚。在本研究中,我们发现血浆外泌体中的circRNA在胃癌(GC)中具有特异性表达特征,而ciRS-133与胃癌患者白色脂肪组织(WAT)的褐变有关。GC细胞的外泌体将ciRS-133传递到前脂肪细胞中,通过激活PRDM16和抑制miR-133,促进前脂肪细胞分化为棕色样细胞。此外,下调miR-133可降低肿瘤植入小鼠癌症恶病质,降低耗氧量和产热。因此,外泌体传递的circRNA参与了WAT褐变,并在癌症相关恶病质中发挥关键作用。

3


一种新的circRNA circFAT1(e2),通过靶向细胞质中的miR-548g并与细胞核中的YBX1相互作用来抑制胃癌进展

A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus

期刊:Cancer Lett

影响因子:6.491

作者单位:东吴大学附属张家港医院

文章内容

本研究检测了GEO数据库中配对胃癌(GC)组织中两种circRNA表达谱。作者发现了一个新的circRNA, has_circ_0001461,称之为circFAT1(e2),证实在胃癌组织和细胞系中,circFAT1(e2)显著下调,且与胃癌患者的总生存率相关。荧光原位杂交(FISH)分析显示,circFAT1(e2)分布在GC细胞的细胞质和细胞核中。功能分析表明,过表达circFAT1(e2)可抑制GC细胞的增殖、迁移和侵袭。然后,作者研究了circFAT1(e2)是否作为miR-548g的海绵,调控肿瘤抑制因子RUNX1在GC细胞中的表达。此外,作者发现核定位的circFAT1(e2)可以直接与Y-box结合蛋白-1 (YBX1)相互作用并抑制其功能。综上所述,circFAT1(e2)可能通过调控细胞质中的miR-548g/RUNX1轴,靶向细胞核中的YBX1,在GC细胞中发挥抑癌作用。

4


CircRNA_102171通过调节CTNNBIP1依赖的β-catenin通路激活,促进甲状腺乳头状癌进展

CircRNA circRNA_102171 promotes papillary thyroid cancer progression through modulating CTNNBIP1-dependent activation of beta-catenin pathway

期刊:J Exp Clin Cancer Res

影响因子:6.217

作者单位:哈尔滨医科大学附属第三医院

文章内容

背景:circRNA是最近发现的一种非编码RNA,在多种癌症中发挥着重要的生物学功能。然而,circRNA_102171在甲状腺乳头状癌(PTC)中的作用尚未被研究。本研究主要针对circRNA_102171在PTC进展中的功能研究,同时也试图揭示其潜在的分子机制。


方法:采用qPCR法测定PTC样品和细胞株中circRNA_102171的表达情况;采用CCK8、菌落形成和EdU结合检测细胞增殖情况;采用Annexin V/PI染色和流式细胞仪检测细胞凋亡;用Transwell法测定细胞迁移和侵袭;通过异种移植测定肿瘤在体内的生长;利用RNA-pulldown、RNA-IP (RIP)和RNA-EMSA分析circRNA_102171与CTNNBIP1的相互作用。


结果:肿瘤组织和细胞系中CircRNA_102171表达上调。CircRNA_102171沉默能抑制PTC细胞的增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。CircRNA_102171基因的下调抑制了体内PTC的生长。CircRNA_102171与CTNNBIP1相互作用,阻断其与-catenin/TCF3/TCF4/LEF1复合物的相互作用,从而激活Wnt/β-catenin通路。


结论:CircRNA_102171过表达以CTNNBIP1依赖的方式激活Wnt/β-catenin通路,促进PTC进展。

5


GDF15调控Malat-1 circRNA,并使NFkappaB信号通路失活,从而导致免疫致敏DC,从而预防心脏移植中的同种异体免疫排斥反应

GDF15 Regulates Malat-1 Circular RNA and Inactivates NFkappaB Signaling Leading to Immune Tolerogenic DCs for Preventing Alloimmune Rejection in Heart Transplantation

期刊:Front Immunol

影响因子:5.511

作者单位:加拿大西安大略大学

文章内容

重组人生长分化因子15 (rhGDF15)影响树突状细胞(DC)成熟。然而,GDF15是否在DC中表达,其在DC中的作用和信号转导仍不清楚。目前尚不清楚GDF15-DC是否能诱导心脏移植(HT)的免疫耐受。本研究旨在了解内源性GDF15对DC的发育、功能以及包括circRNA在内的潜在分子机制的影响。本研究还将探讨GDF15-DC介导的HT免疫调节。


作者培养骨髓来源的DC,并上调或下调GDF15的表达;检测DC的表型和功能;采用qRT-PCR检测基因和circRNA的表达;检测GDF15激活的信号通路;在MHC全失配小鼠HT模型中评估GDF15处理DC对预防同种异体移植物免疫排斥反应的影响。


结果显示,GDF15在DC中表达。敲除GDF15可促进DC成熟,增强免疫应答功能,上调circ_Malat 1,激活NFkappaB通路。GDF15在DC中的过表达增加了免疫抑制/抑制分子,增强了DC诱导T细胞衰竭,并通过IDO信号通路促进Treg的生成。GDF15利用TGF受体I和II,而不是GFAL。GDF15治疗DC可预防同种异体移植排斥反应和诱导免疫耐受。


综上所述,GDF15通过抑制circ_Malat-1和NFkappaB信号通路,上调IDO,诱导免疫耐受性DC (tol-DC)。GDF15-DC可预防HT的同种异体免疫排斥反应。

6


circRNA表达谱揭示前列腺癌特异性circRNA

Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer

期刊:Cell Physiol Biochem

影响因子:5.5

作者单位:复旦大学

文章内容

背景/目的:前列腺癌(PCa)是严重损害男性健康的主要癌症之一,发病率和死亡率较高,但目前仍没有理想的分子标志物用于前列腺癌的诊断和预后。


方法:为了确定前列腺癌中差异表达的circRNA是否可以作为前列腺癌诊断的新生物标志物,作者使用SBC-ceRNA芯片对4对前列腺肿瘤和癌旁组织中差异表达的circRNA进行筛选;利用Cytoscape3.5.1软件构建差异circRNA及其宿主基因的circRNA-miRNA-mRNA调控网络,并采用QPCR技术对芯片数据进行验证。


结果:作者利用SBC-ceRNA阵列在PCa肿瘤中发现了1021个差异表达的circRNA,并通过qRT-PCR分析证实了circ_0057558、circ_0062019和SLC19A1在PCa细胞株和肿瘤组织中的表达。结合PSA水平和两种差异表达的circRNA,其AUC、敏感性和特异性均明显高于单独PSA(血清PSA的AUC为0.854),分别为0.938、84.5%和90.9%。此外,circ_0057558与总胆固醇呈正相关。circRNA-miRNA-mRNA分析功能网络显示,circ_0057558和circ_0034467调控miR-6884, circ_0062019和circ_0060325调控miR-5008。


结论:差异表达的circRNA (circ_0062019和circ_0057558)和circ_0062019的宿主基因SLC19A1可作为前列腺癌潜在的新型生物标志物。

7


银屑病中circRNA表达谱及其潜在功能分析

Circular RNA Expression Profile and Analysis of Their Potential Function in Psoriasis

期刊:Cell Physiol Biochem

影响因子:5.5

作者单位:山东大学齐鲁医院

文章内容

背景/目的:circRNA是一种进化保守的环状非编码RNA,通过隔离(海绵)miRNA在多种疾病中发挥作用。然而,它们在牛皮癣中的作用尚不清楚。在本研究中,作者研究了circRNA的表达,并分析了它们在银屑病中的潜在功能。


方法:采用SBC人ceRNA芯片V1.0分析银屑病病灶及正常健康皮肤组织中circRNA的表达情况;采用GO及KEGG分析功能;利用miRNA靶区预测软件识别假定的miRNA响应元件(MRE)。QPCR验证了6个上调circRNA在银屑病病灶和健康皮肤组织中的表达。


结果:共4956个circRNA(上调3016个,下调1940个)在银屑病中差异表达;此外,在差异表达的circRNA中鉴定出4405 MREs。银屑病病灶hsa_circ_0061012较正常健康皮肤组织上调。hsa_circ_0061012前5位MREs分别为hsa-miR-7157-5p、hsa-miR-4769-3p、hsa-miR-6817-5p、hsa-miR-4310、hsa-miR-6882-3p。对银屑病5个miRNA上调靶点进行GO分析,探讨其丰富的生物学功能,发现排名前30位的大部分与银屑病有关。


结论:hsa_circ_0061012可能是银屑病的候选生物标志物。研究结果为更好地理解ceRNA介导的银屑病基因调控提供了新的视角,为进一步研究circRNA在银屑病中的作用提供了新的理论依据。

广州永诺生物科技有限公司成立于2010年,总部位于广州国际生物岛,旗下有广州永诺医学检验所、广东顺德永诺生物科技有限公司等子公司,是一家专注于医学科学技术开发与服务、分子诊断产品研发与生产的高新技术企业。

公司先后申请国家发明专利17项,授权3项,获得计算机软件著作权6项,团队骨干在国际顶级杂志Science,Nature Genetics,Genome Research上发表SCI论文多篇,累积发表SCI论文影响因子>100;并认定为“国家高新技术企业”、“广州市科技创新小巨人企业”、“ 广东省高新技术企业培育库入库企业”;承担了省、市等科技计划项目10项;获得了广东省高新技术产品证书3项;并与华南地区包括中山大学附属各医院、广州医科大学及附属各医院、广东省人民医院、深圳市各家医院等在内的60多家三甲医院开展了技术服务和产学研合作。


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