分享

hsa-miR-124, SOX1, TERT, 和LMX1A基因甲基化...

 小小学习室001 2019-02-28

【据《Gynecologic Oncology,2018;150:545-551》2018年6月报道】题:hsa-miR-124, SOX1, TERT, 和LMX1A基因甲基化作为宫颈癌前病变的生物学标记(作者Caroline Domingues Rogeri等)

CpG岛启动子区基因甲基化是肿瘤发生中最重要的表观遗传学的机制。在正常细胞中,启动子区CpG岛低甲基化或非甲基化状态,而在肿瘤细胞中,则是启动子区CpG岛超甲基化,使抑癌基因失活,导致恶性肿瘤发生。通过回顾15篇文献,此研究筛选了15种基因来作为潜在的筛查宫颈癌前病变的生物学标记,分别是HIC1, APC,CADM1, CDH, DAPK1, TERT, JAM3, EPB41L3, C130RF18, MAL, hsa-miR-124, SOX1, PAX1,LMX1A和NKX6-1。

此研究的样本采用的液基细胞学的样本。选取了20例<CIN2的宫颈细胞学样本和CIN2/3的样本进行探索性试验,初步评价此15种基因的甲基化水平。选取AUC数值≥0.9的基因对全部407例样本进一步做了验证试验。

HPV检测采用Cobas平台,qMSP方法分析DNA甲基化。在验证阶段试验,8个基因中有7个在验证的步骤中显示出在诊断中甲基化谱的统计学差异;有6个基因的在感染HPV的情况下PMR值显著升高。

在HPV和基因甲基化诊断精确性方面,HPV检测的敏感性为91.3%,比细胞学的58.6%高,而5种基因的甲基化的敏感性:DAPK1 (35.2%), EPB41L3 (63.3%), LMX1A (45.3%), SOX1 (63.3%), TERT(60.9%) 。HPV检测的特异性50%,低于细胞学86%,而在验证阶段7种基因甲基化的特异性:CDH1 (92.1%), DAPK1 (87.5%), EPB41L3 (84.2%), HIC1(16.5%), LMX1A(90.7%), SOX1 (81.4%), TERT (77.1%) 。HPV检测的敏感性和特异性(91.3%, 50.0%)与hsa-miR-124-2基因甲基化的敏感性和特异性(86.7% and 61.3%)相比差异没有统计学意义。

经多元回归分析,诊断高级别病变的独立预测因子在高危型HPV检测中也显示出阳性结果(OR = 5.5; 95% CI = 2.6 to11.6) ,包括以下基因:hsa-miR-124-2 (OR = 5.1; 95% CI = 2.5 to10.3), SOX1 (OR = 2.8; 95% CI = 1.4 to 5.3), TERT (OR = 2.2; 95% CI= 1.2 to4.1), and LMX1A (OR = 2.0; 95% CI = 1.03 to 3.9)

HPV感染和基因甲基化谱在诊断中的协同作用。在没有高危型HPV感染的情况下,CIN以上病变的发生率非常低,也没有表观遗传的改变。这些频率在一个因子阳性的时候(HPV阳性或基因甲基化)略高,但是当两种因子同时出现的时候这种频率则显著升高(协同效应)。

基于以上结果认为hsa-miR-124-2,SOX1, TERT和LMX1A 启动子基因超甲基化与高级别病变有直接的相关性,可以作为预测高级别病变的独立预测因子,无论是否存在HPV感染。这些发现说明表观遗传学的机制可能是宫颈癌形成中的另一种途径。

在HPV感染和基因甲基化共存的情况下,CIN2以上病例数增加,意味着二者之间有协同作用。因此推断宫颈癌的发生存在着另一种途径,在这一途径中HPV感染可以导致某些特定抑癌基因的甲基化。由甲基化引起的基因沉默即便在HPV被清除掉以后仍可以启动宫颈癌的癌变。这条通路会保持激活状态,并在宫颈高级别病变的发展过程中发挥作用。

特定基因启动子区甲基化,如hsa-miR-124-2,SOX-1, TERT, and LMX1A可以作为检测宫颈癌前病变的辅助手段,而且这项客观的检测方法可以利用宫颈细胞学和HPV DNA检测的样本。将甲基化谱分析与细胞学和HPV DNA联合更具预测性。

    本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,请点击一键举报。
    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多