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circRNA研究汇总 | 20190516-0520

 生物_医药_科研 2019-05-20

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,由于circRNA的研究成果逐日增多,从本期开始,我们将一周一小结,每周一发布,力求给各位带来最新鲜的科研资讯。

本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献11篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

1、circYAP拮抗其来源基因YAP的蛋白翻译过程

论文标题:Translation of yes-associated protein (YAP) was antagonized by its circular RNA via suppressing the assembly of the translation initiation machinery.

杂志:Cell Death Dis. 

影响因子:5.638

通讯作者单位:加拿大多伦多大学

近日加拿大多伦多大学杨柏华教授团队首次报道发现YAP基因来源的circRNA可拮抗YAP的mRNA翻译起始过程,调控其母基因的翻译效率。杨柏华教授是今年第五届circRNA论坛邀请的主讲嘉宾之一,本文报道的研究工作曾在去年的第四届circRNA研究论坛中与大家分享过。期待各位同仁能参加第五届circRNA研究论坛,届时一起聆听杨教授与大家分享他的最新研究成果。该研究详细解读请查看本公众号历史文章:Nature子刊再发杨柏华教授新作:circYAP调控YAP蛋白翻译

图注:circYAP(circBank ID:hsa_circYAP1_008)可以通过结合翻译起始蛋白eIF4G和PABP,抑制母基因YAP的mRNA翻译起始,调控YAP蛋白的表达量

2、环状RNA在神经系统疾病中的现状和潜在作用

论文标题:Current status and potential role of circular RNAs in neurological disorders

杂志:J Neurochem. 

影响因子:4.609

通讯作者单位:新疆医科大学

非编码RNA在调节正常脑功能中和治疗神经障碍疾病中发挥重要作用,因此基于非编码RNA尤其是环状RNA(circRNAs)的在神经障碍疾病中诊断和治疗策略已显示出巨大的临床潜力。最近的研究表明,circRNA可能在阿尔茨海默病,帕金森病,缺血性脑损伤和神经毒性中起重要作用。然而,circRNA的作用机制尚未完全阐明。该综述文章综合性地回顾了脑内circRNA研究的最新进展,为有关circRNA在神经系统疾病中的作用提供新思路。

图注:综述中详细整理了目前已报道的circRNA在神经系统疾病中的作用列表

3、circRNA-miRNA在从阵发性心房颤动到永久性心房颤动的过渡中交叉互作

论文标题:circRNA-miRNA cross-talk in the transition from paroxysmal to permanent atrial fibrillation

杂志:Int J Cardiol. 

影响因子:4.034

通讯作者单位:里斯本大学医学院

心房纤颤(AF)是最常见的心律失常之一,是心房呈无序激动和无效收缩的房性节律,是由心房-主导折返环引起许多小折返环导致的房律紊乱,在老年人中十分常见。可见于所有的器质性心脏病患者,在非器质性心脏病患者也可发生房颤,发病率高持续时间长,还可引起严重的并发症,如心力衰竭和动脉栓塞。导致病人残疾或病死率增加。在表观遗传因子中,最近发现非编码RNA(ncRNA)如miRNA和lncRNA是参与AF进展的重要调控因子。研究者推测慢性AF中存在额外的miRNA和circRNA调节层,涉及不同ncRNA种类之间错综复杂的串扰。首先研究者通过RNA-seq分析阵发性和持续性AF患者左心房活组织检查中miRNA和circRNA的表达谱。基于circRNA海绵吸附miRNA机制模式,通过从阵发性到持续性AF的转变过程中下调的miRNA,筛选出特定的circRNA种类可能调控这些miRNA,阐明circRNA-miRNA在AF中作用机制。

图注:持续性心房纤颤(AF)中circRNA-miRNA互作调控网络图(基于RNA-seq和生信预测)

4、circLRP6调节高水平葡萄糖诱导的增殖,氧化应激,ECM积聚和系膜细胞炎症

论文标题:circLRP6 regulates high glucose-induced proliferation, oxidative stress, ECM accumulation, and inflammation in mesangial cells

杂志:J Cell Physiol.  

影响因子:3.923

通讯作者单位:吉林大学第一医院

糖尿病肾病(DN)的发生和发展中,往往涉及系膜细胞增殖,细胞外基质(ECM)积聚,氧化应激和高血糖状态下的炎症异常调节。然而,高血糖诱导的异常调节机制尚未明确阐明。该研究发现HMGB1基因在高葡萄糖(HG)处理的系膜细胞中表达升高,并通过Toll样受体4(TLR4)诱导NF-κB的磷酸化,核转位和DNA结合活性。功能测定显示HMGB1抑制TLR4/NF-κB途径减轻了HG诱导的系膜细胞增殖,氧化应激,ECM积聚和炎症。

研究者推测HMGB1是否参与circRNA-miRNA-mRNA调控网络。首先,鉴定HMGB1并确认其为miR-205的靶标,并且miR-205通过靶向HMGB1对HG诱导的细胞损伤起保护作用。然后发现circLRP6在HG处理的肾小球系膜细胞中上调,并通过海绵miR-205调节HG诱导的肾小球系膜细胞损伤。此外,miR-205的过表达或circLRP6的敲低抑制了NF-κB信号传导途径。总之,这些数据表明circLRP6通过海绵吸附miR-205,上调HMGB1和激活TLR4/ NF-κB途径调节HG诱导的系膜细胞增殖,氧化应激,ECM积聚和炎症。该研究发现为糖尿病肾病DN的发病机制提供了新的理解。

图注:circLRP6靶向miR-205验证。A:circLRP6与miR-205结合位点配对图;B: HG处理SV40-Mes13细胞后qPCR检测circLRP6表达;C: luciferase 荧光素酶报告基因验证circLRP6与miR-205直接结合;D&E:siRNA干扰circLRP6后,qPCR和WB检测miR-205和HMGB1的表达水平改变

参考文献列表

1

Nature子刊再发杨柏华教授新作:circYAP调控YAP蛋白翻译

2

第五届circRNA研究论坛

3

小结 | 5月上半月circRNA研究报道汇总

4

小结 | 4月下半月circRNA研究报道汇总

5

标准化命名circRNA—circbank综合数据库

6

重磅! Cell杂志再发circRNA研究论文

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